Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCH2

Protein Details
Accession C5MCH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
802-827SGLFKLGGKKKQHQNQKNSKNNENAIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ctp:CTRG_03923  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MSESLDSTLHSRSNVLHDYHEKIHTQPIKPLITEEDKKSYYFRLINYEYHSLQSDSEIRQKSLFQLMDYCELQYENSNTQTQSGSHQKGIKSYIRGYLVFNYLINGFIMHHFNGFDEFIATNETDFIIYLNIYAFYNTDVYFSNGNYSVFATDLRNYMKDYLVKNNILSFDINELFKWLNEYISYLKDKDRNGSTLPDNESSTPSPPSSPSSTASSFSFIETYKTPDLQYEEDFKVRYPSVNSYNTYKTSSKTHQSSHHTRPPIPTQVPPSPPQNDFPRLPDESPTHLSPLRLSQSSPSSPSPSLKLLASSPPPIPPPHKYPTKEYPTAPSVLDTNTSPYPLQEGTASPPGSPQGSPPTLSPSPASMSLYNPVSIPVAVPVPKEESKYFKPKSYGRPKREVPDGYLRPTDYTTAKIHGSNVHTPHLYPQQQQQQYLPTHNHYQQQQPPLQQQQYILPSNQIPHQFQPSYPQQAPHYIQPFPYQQSQVLPPQQQAIAHPSSMQQPMHYHGNNNGAPSGSLVQQNSAYSHIPSHVVHQSDSSRNKKQNLLKEFSVCGLRNFGSSCYINSTIQLLFGVYEFKSIFNRGYQKHVKALKYLKMVAKANSHSKDSVLLSDATAGLLKTFQNNGGVSVSPTKFIRVTTMLKPDFNIPYEQQDAQEFLLFLLDRLHDEMADKSPENYNPEEALRKWKIKLSLDTKDKYLDWCKSLHEHEGTSPITDLFQGHLQNKLKCNKCGYESISYSQFTILSLPIPASSTKEVNLSDCLRYFIQDEVLSGENAWHCPKCNGEVPTLDNHPVFENKRSGLFKLGGKKKQHQNQKNSKNNENAISTKSVNFVKLPSILILQLGLFNFTDKLDMQIRYPLVLKFNNHGHEIVYKLSGMINHVGSLKSGHYTALVNKSNINEKLKNLDNLKQPFWCFFDDDNVKSNVANGHLSPPYDEVVSSDAYVLCYERIDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.33
4 0.36
5 0.41
6 0.45
7 0.46
8 0.41
9 0.37
10 0.45
11 0.46
12 0.44
13 0.45
14 0.48
15 0.48
16 0.46
17 0.47
18 0.44
19 0.46
20 0.49
21 0.48
22 0.48
23 0.46
24 0.46
25 0.47
26 0.43
27 0.42
28 0.4
29 0.38
30 0.39
31 0.41
32 0.45
33 0.48
34 0.5
35 0.43
36 0.41
37 0.41
38 0.32
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.26
43 0.33
44 0.35
45 0.34
46 0.34
47 0.35
48 0.35
49 0.38
50 0.35
51 0.28
52 0.3
53 0.31
54 0.35
55 0.35
56 0.31
57 0.23
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.22
62 0.21
63 0.24
64 0.26
65 0.25
66 0.27
67 0.28
68 0.24
69 0.27
70 0.33
71 0.34
72 0.37
73 0.42
74 0.41
75 0.44
76 0.5
77 0.49
78 0.44
79 0.44
80 0.45
81 0.44
82 0.43
83 0.42
84 0.39
85 0.36
86 0.32
87 0.28
88 0.23
89 0.19
90 0.19
91 0.16
92 0.12
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.16
101 0.15
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.14
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.16
141 0.18
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.24
146 0.27
147 0.28
148 0.34
149 0.38
150 0.39
151 0.38
152 0.38
153 0.36
154 0.32
155 0.3
156 0.21
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.18
165 0.14
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.15
170 0.2
171 0.23
172 0.21
173 0.26
174 0.3
175 0.31
176 0.36
177 0.37
178 0.36
179 0.36
180 0.39
181 0.38
182 0.39
183 0.41
184 0.37
185 0.35
186 0.32
187 0.34
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.22
192 0.21
193 0.21
194 0.25
195 0.25
196 0.26
197 0.27
198 0.3
199 0.31
200 0.31
201 0.3
202 0.28
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.2
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.24
215 0.24
216 0.26
217 0.26
218 0.26
219 0.27
220 0.28
221 0.25
222 0.26
223 0.24
224 0.24
225 0.21
226 0.25
227 0.29
228 0.34
229 0.36
230 0.37
231 0.4
232 0.4
233 0.42
234 0.37
235 0.32
236 0.34
237 0.38
238 0.42
239 0.43
240 0.46
241 0.49
242 0.56
243 0.63
244 0.66
245 0.67
246 0.63
247 0.61
248 0.62
249 0.6
250 0.6
251 0.54
252 0.49
253 0.48
254 0.51
255 0.52
256 0.49
257 0.48
258 0.44
259 0.43
260 0.44
261 0.44
262 0.43
263 0.4
264 0.41
265 0.4
266 0.38
267 0.37
268 0.37
269 0.33
270 0.32
271 0.35
272 0.32
273 0.3
274 0.28
275 0.28
276 0.24
277 0.27
278 0.25
279 0.22
280 0.21
281 0.22
282 0.26
283 0.28
284 0.3
285 0.27
286 0.27
287 0.28
288 0.3
289 0.29
290 0.25
291 0.25
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.21
296 0.21
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.24
302 0.27
303 0.27
304 0.32
305 0.36
306 0.44
307 0.44
308 0.5
309 0.57
310 0.6
311 0.6
312 0.54
313 0.53
314 0.47
315 0.46
316 0.39
317 0.3
318 0.23
319 0.19
320 0.19
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.14
328 0.12
329 0.13
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.19
334 0.19
335 0.16
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.24
346 0.23
347 0.24
348 0.23
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.2
353 0.14
354 0.14
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.14
359 0.13
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.18
372 0.23
373 0.28
374 0.38
375 0.39
376 0.39
377 0.43
378 0.47
379 0.56
380 0.62
381 0.66
382 0.63
383 0.7
384 0.69
385 0.68
386 0.7
387 0.61
388 0.54
389 0.54
390 0.51
391 0.45
392 0.43
393 0.38
394 0.31
395 0.3
396 0.27
397 0.18
398 0.18
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.19
405 0.23
406 0.24
407 0.25
408 0.25
409 0.24
410 0.23
411 0.26
412 0.29
413 0.28
414 0.24
415 0.29
416 0.36
417 0.38
418 0.39
419 0.37
420 0.35
421 0.34
422 0.36
423 0.32
424 0.26
425 0.29
426 0.31
427 0.34
428 0.3
429 0.35
430 0.37
431 0.4
432 0.41
433 0.39
434 0.4
435 0.42
436 0.41
437 0.35
438 0.31
439 0.29
440 0.3
441 0.29
442 0.24
443 0.19
444 0.19
445 0.19
446 0.21
447 0.2
448 0.17
449 0.17
450 0.22
451 0.21
452 0.2
453 0.26
454 0.26
455 0.3
456 0.29
457 0.29
458 0.26
459 0.31
460 0.32
461 0.31
462 0.3
463 0.24
464 0.24
465 0.25
466 0.26
467 0.23
468 0.24
469 0.2
470 0.18
471 0.19
472 0.21
473 0.22
474 0.25
475 0.23
476 0.21
477 0.21
478 0.21
479 0.19
480 0.18
481 0.18
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.16
487 0.18
488 0.17
489 0.13
490 0.14
491 0.17
492 0.23
493 0.22
494 0.2
495 0.2
496 0.27
497 0.27
498 0.26
499 0.23
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.15
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.11
511 0.12
512 0.11
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.14
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.18
523 0.2
524 0.25
525 0.32
526 0.34
527 0.38
528 0.42
529 0.45
530 0.5
531 0.53
532 0.56
533 0.55
534 0.55
535 0.5
536 0.48
537 0.45
538 0.39
539 0.38
540 0.29
541 0.22
542 0.19
543 0.18
544 0.16
545 0.16
546 0.15
547 0.14
548 0.14
549 0.14
550 0.16
551 0.18
552 0.17
553 0.17
554 0.18
555 0.14
556 0.14
557 0.13
558 0.08
559 0.06
560 0.06
561 0.08
562 0.06
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.1
567 0.11
568 0.12
569 0.14
570 0.21
571 0.21
572 0.29
573 0.35
574 0.36
575 0.42
576 0.48
577 0.44
578 0.45
579 0.5
580 0.47
581 0.45
582 0.47
583 0.42
584 0.42
585 0.43
586 0.39
587 0.39
588 0.37
589 0.41
590 0.39
591 0.38
592 0.32
593 0.3
594 0.3
595 0.25
596 0.23
597 0.16
598 0.14
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.09
603 0.08
604 0.07
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.08
610 0.09
611 0.12
612 0.12
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.18
618 0.18
619 0.17
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.19
625 0.18
626 0.22
627 0.25
628 0.34
629 0.34
630 0.34
631 0.34
632 0.34
633 0.32
634 0.29
635 0.28
636 0.19
637 0.22
638 0.25
639 0.25
640 0.22
641 0.2
642 0.2
643 0.17
644 0.17
645 0.13
646 0.09
647 0.11
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.08
656 0.1
657 0.11
658 0.13
659 0.15
660 0.15
661 0.15
662 0.18
663 0.21
664 0.24
665 0.23
666 0.22
667 0.21
668 0.23
669 0.25
670 0.23
671 0.3
672 0.32
673 0.34
674 0.34
675 0.36
676 0.41
677 0.43
678 0.51
679 0.49
680 0.53
681 0.57
682 0.57
683 0.55
684 0.51
685 0.46
686 0.42
687 0.41
688 0.36
689 0.3
690 0.3
691 0.31
692 0.33
693 0.35
694 0.36
695 0.31
696 0.28
697 0.27
698 0.31
699 0.29
700 0.24
701 0.22
702 0.16
703 0.14
704 0.13
705 0.13
706 0.09
707 0.12
708 0.15
709 0.16
710 0.24
711 0.29
712 0.33
713 0.39
714 0.47
715 0.49
716 0.49
717 0.54
718 0.51
719 0.49
720 0.52
721 0.49
722 0.48
723 0.46
724 0.45
725 0.43
726 0.39
727 0.36
728 0.29
729 0.25
730 0.17
731 0.15
732 0.12
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.09
738 0.09
739 0.12
740 0.14
741 0.15
742 0.15
743 0.19
744 0.19
745 0.2
746 0.24
747 0.23
748 0.23
749 0.23
750 0.25
751 0.22
752 0.22
753 0.21
754 0.18
755 0.19
756 0.16
757 0.16
758 0.16
759 0.17
760 0.16
761 0.15
762 0.16
763 0.13
764 0.15
765 0.18
766 0.16
767 0.17
768 0.19
769 0.21
770 0.23
771 0.29
772 0.3
773 0.31
774 0.33
775 0.34
776 0.37
777 0.38
778 0.36
779 0.29
780 0.27
781 0.26
782 0.28
783 0.28
784 0.29
785 0.3
786 0.28
787 0.35
788 0.36
789 0.36
790 0.35
791 0.36
792 0.36
793 0.42
794 0.5
795 0.52
796 0.57
797 0.65
798 0.69
799 0.74
800 0.8
801 0.79
802 0.81
803 0.84
804 0.88
805 0.89
806 0.86
807 0.85
808 0.82
809 0.77
810 0.71
811 0.65
812 0.56
813 0.5
814 0.47
815 0.41
816 0.34
817 0.33
818 0.3
819 0.27
820 0.25
821 0.23
822 0.22
823 0.22
824 0.22
825 0.19
826 0.19
827 0.17
828 0.16
829 0.15
830 0.12
831 0.12
832 0.11
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.11
837 0.1
838 0.12
839 0.1
840 0.14
841 0.18
842 0.19
843 0.2
844 0.25
845 0.26
846 0.26
847 0.28
848 0.26
849 0.26
850 0.3
851 0.31
852 0.31
853 0.38
854 0.39
855 0.39
856 0.37
857 0.33
858 0.32
859 0.31
860 0.27
861 0.21
862 0.17
863 0.15
864 0.16
865 0.16
866 0.15
867 0.17
868 0.16
869 0.16
870 0.18
871 0.17
872 0.17
873 0.17
874 0.16
875 0.14
876 0.14
877 0.13
878 0.13
879 0.15
880 0.21
881 0.29
882 0.32
883 0.31
884 0.34
885 0.37
886 0.44
887 0.48
888 0.49
889 0.43
890 0.42
891 0.49
892 0.52
893 0.56
894 0.52
895 0.53
896 0.55
897 0.57
898 0.58
899 0.55
900 0.52
901 0.48
902 0.47
903 0.42
904 0.37
905 0.33
906 0.39
907 0.4
908 0.4
909 0.41
910 0.39
911 0.37
912 0.32
913 0.34
914 0.26
915 0.23
916 0.23
917 0.2
918 0.23
919 0.25
920 0.26
921 0.26
922 0.25
923 0.23
924 0.21
925 0.2
926 0.15
927 0.15
928 0.16
929 0.14
930 0.14
931 0.13
932 0.13
933 0.14
934 0.14
935 0.12