Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M507

Protein Details
Accession C5M507    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-226FTSLPSTPPPKKKKRTTTSSPSIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-216KKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
KEGG ctp:CTRG_01985  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSIFYQPMSGSNDIPNCLTPNNNLEDQFGLIKQQLAITTSSTSSNSSTSSNTTNASGTSSPSGAQPLSPPLSPYQRSASLQLIKQPLPILPKLNKNNKSYLQNSNAEFKIENFNDYKLTVDIKTVDKNYYNKQLDFLNKYSSLSNSEKASAGINGSSLPPRKYKKRLNYDSNDEITHSDTERVRTRRVVKTTNKDFTTDDEAFTSLPSTPPPKKKKRTTTSSPSIPILTLQQQLIDESIPDYSPDVSTLPPKNAKCLKIEWKGQPMDLSNDPNLSKLTHPAEVMLASILRLPVAVYLDSKRRFFYEKVNRIRSGKTFRRTDAQKACRIDVNKASRLFAAFEKVGWLNDELFEKYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.24
5 0.25
6 0.23
7 0.26
8 0.29
9 0.31
10 0.3
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.26
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.17
35 0.19
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.2
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.17
54 0.2
55 0.19
56 0.2
57 0.22
58 0.3
59 0.31
60 0.32
61 0.32
62 0.34
63 0.36
64 0.37
65 0.4
66 0.38
67 0.37
68 0.4
69 0.4
70 0.36
71 0.35
72 0.33
73 0.28
74 0.27
75 0.28
76 0.29
77 0.29
78 0.38
79 0.46
80 0.55
81 0.6
82 0.59
83 0.64
84 0.64
85 0.66
86 0.61
87 0.6
88 0.57
89 0.55
90 0.53
91 0.51
92 0.46
93 0.4
94 0.35
95 0.28
96 0.3
97 0.25
98 0.26
99 0.21
100 0.22
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.13
105 0.15
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.19
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.27
115 0.3
116 0.38
117 0.39
118 0.35
119 0.35
120 0.37
121 0.38
122 0.4
123 0.37
124 0.31
125 0.28
126 0.29
127 0.28
128 0.25
129 0.25
130 0.22
131 0.23
132 0.19
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.13
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.12
145 0.13
146 0.19
147 0.24
148 0.32
149 0.41
150 0.49
151 0.56
152 0.65
153 0.73
154 0.76
155 0.77
156 0.77
157 0.73
158 0.65
159 0.55
160 0.45
161 0.36
162 0.28
163 0.23
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.16
168 0.22
169 0.24
170 0.24
171 0.29
172 0.36
173 0.4
174 0.44
175 0.5
176 0.51
177 0.59
178 0.65
179 0.66
180 0.6
181 0.55
182 0.5
183 0.45
184 0.44
185 0.34
186 0.26
187 0.2
188 0.2
189 0.18
190 0.17
191 0.14
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.13
196 0.2
197 0.29
198 0.4
199 0.49
200 0.59
201 0.69
202 0.78
203 0.82
204 0.85
205 0.84
206 0.84
207 0.83
208 0.79
209 0.71
210 0.62
211 0.53
212 0.43
213 0.35
214 0.27
215 0.22
216 0.17
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.11
223 0.08
224 0.06
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.15
235 0.17
236 0.22
237 0.28
238 0.28
239 0.36
240 0.42
241 0.43
242 0.4
243 0.45
244 0.5
245 0.51
246 0.58
247 0.56
248 0.58
249 0.57
250 0.54
251 0.49
252 0.42
253 0.39
254 0.35
255 0.32
256 0.25
257 0.27
258 0.26
259 0.24
260 0.23
261 0.19
262 0.17
263 0.2
264 0.22
265 0.21
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.19
270 0.18
271 0.13
272 0.09
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.14
284 0.23
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.3
289 0.34
290 0.35
291 0.42
292 0.45
293 0.51
294 0.6
295 0.66
296 0.68
297 0.66
298 0.69
299 0.66
300 0.66
301 0.65
302 0.64
303 0.63
304 0.62
305 0.68
306 0.68
307 0.7
308 0.7
309 0.69
310 0.68
311 0.66
312 0.65
313 0.62
314 0.6
315 0.56
316 0.55
317 0.55
318 0.54
319 0.51
320 0.5
321 0.45
322 0.44
323 0.4
324 0.32
325 0.31
326 0.24
327 0.22
328 0.25
329 0.24
330 0.24
331 0.23
332 0.22
333 0.17
334 0.19
335 0.22