Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4D6

Protein Details
Accession C5M4D6    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-281AATKQNVPKLPKKKIMKIRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-281KLPKKKIMKIRG
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006617  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition  
KEGG ctp:CTRG_00926  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSNTRRPVLEEVDDDDIDNMDMDIAEFDPSLKTPVAPKRPEPKIVRSQDSEPPLFPNLPMGGQMPPIPSQEEIAATKKSSGIRDPRSFTEEEKKQFDQFQMIYPCYFDMNRSHNEGRRVSIDRAVENPLATTIAEACRKLSLPVFLELDKSHPQDYGNPGRVKVLYKAVFDGGKLVDPKIKNKRVLFNLIAEYLAEHPTSLDSIGSKSGVPYPPEFQSGFTPEEIPKVKGYKMNTIVPVHSSLTLKHPMTKHIYDPEPETPAATKQNVPKLPKKKIMKIRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.28
3 0.22
4 0.17
5 0.15
6 0.11
7 0.06
8 0.06
9 0.05
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.08
16 0.08
17 0.11
18 0.1
19 0.11
20 0.18
21 0.28
22 0.37
23 0.41
24 0.49
25 0.57
26 0.62
27 0.71
28 0.69
29 0.69
30 0.7
31 0.73
32 0.71
33 0.65
34 0.64
35 0.61
36 0.62
37 0.54
38 0.45
39 0.4
40 0.37
41 0.32
42 0.28
43 0.24
44 0.19
45 0.17
46 0.17
47 0.15
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.15
59 0.16
60 0.17
61 0.18
62 0.16
63 0.17
64 0.19
65 0.21
66 0.21
67 0.25
68 0.32
69 0.39
70 0.45
71 0.48
72 0.48
73 0.49
74 0.48
75 0.45
76 0.45
77 0.43
78 0.42
79 0.43
80 0.42
81 0.4
82 0.42
83 0.39
84 0.34
85 0.28
86 0.3
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.22
92 0.18
93 0.18
94 0.13
95 0.14
96 0.18
97 0.2
98 0.26
99 0.29
100 0.31
101 0.37
102 0.36
103 0.32
104 0.33
105 0.35
106 0.3
107 0.31
108 0.28
109 0.24
110 0.25
111 0.26
112 0.22
113 0.17
114 0.16
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.05
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.18
142 0.24
143 0.28
144 0.32
145 0.31
146 0.31
147 0.32
148 0.33
149 0.31
150 0.27
151 0.27
152 0.22
153 0.22
154 0.23
155 0.23
156 0.22
157 0.2
158 0.2
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.15
164 0.16
165 0.25
166 0.33
167 0.39
168 0.44
169 0.47
170 0.55
171 0.55
172 0.6
173 0.54
174 0.47
175 0.43
176 0.36
177 0.32
178 0.24
179 0.2
180 0.14
181 0.13
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.14
196 0.17
197 0.19
198 0.21
199 0.23
200 0.24
201 0.28
202 0.27
203 0.24
204 0.24
205 0.25
206 0.25
207 0.22
208 0.23
209 0.2
210 0.26
211 0.27
212 0.24
213 0.25
214 0.26
215 0.28
216 0.3
217 0.33
218 0.36
219 0.39
220 0.43
221 0.45
222 0.44
223 0.43
224 0.4
225 0.39
226 0.31
227 0.29
228 0.24
229 0.2
230 0.23
231 0.29
232 0.28
233 0.31
234 0.31
235 0.35
236 0.42
237 0.44
238 0.44
239 0.44
240 0.47
241 0.44
242 0.48
243 0.46
244 0.42
245 0.39
246 0.35
247 0.29
248 0.3
249 0.33
250 0.3
251 0.31
252 0.35
253 0.44
254 0.5
255 0.55
256 0.6
257 0.65
258 0.72
259 0.76
260 0.78
261 0.79