Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M365

Protein Details
Accession C5M365    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-137QWKDVAKKYQPPRSKLKKEEKVDTHRDVHydrophilic
366-385SENKHHKKTSTKKEEHRVIDBasic
411-436DVAKVAQPKRNTRKRKLRQVQEEEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-426RNTRKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034732  EPHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR003349  JmjN  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0001227  F:DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0051864  F:histone H3K36 demethylase activity  
GO:0140684  F:histone H3K9me2/H3K9me3 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0010507  P:negative regulation of autophagy  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_00504  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02373  JmjC  
PF02375  JmjN  
PF13771  zf-HC5HC2H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51805  EPHD  
PS51184  JMJC  
PS51183  JMJN  
CDD cd15571  ePHD  
Amino Acid Sequences MQSNYQHDSNLHIEPHHIENGVPVFMPSLKEFENFYNFNKAINKYGMSSGIVKVIPPKEWLDEVRGKCYSHENLSRIVIRNPILQNINMNQPGVFQFQNIERARKYSIFQWKDVAKKYQPPRSKLKKEEKVDTHRDVLEFSIDTSEFTDQRCEELEKTYWKSLPYSEPMYGADSLGSLFGDNVEAWNVSKLPNLLDLMDARLPGVNEAYLYGGLWKSSFAWHLEDQDLYSINYLHFGAPKKWYSIPQAQHEQFYNIMKSHFEDEWKNCSEFLRHKTFMISPTNLEKLGIQVNQIVHREGEFIITYPYGYHAGFNLGFNLAESVNFALDDWFEFGKKTQKCECISDSVGIDIGKLWKKFYGTDYPSSENKHHKKTSTKKEEHRVIDDSDSETAIELHDESDVESIMSDHSTDVAKVAQPKRNTRKRKLRQVQEEEEEDDDDEAVNECFLCPNNFQDSSFKSSPMFELLKTDMGPLEVHRLCANMFPQQLSYDKTNNSIIGLNNLSKQQMNLQCCVCKQRDAGACFQCNYKRCAKSFHGSCGLSDGVKYMLDTGEAYCKTHNNYKKEHGIVEGVNIGSFVQFKFNKGVFAGKVVNLNDTFVEVEVYPLAKDIIEVPLNDIFNSNDCFLNQPAGFNYLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.29
4 0.25
5 0.21
6 0.24
7 0.26
8 0.24
9 0.2
10 0.16
11 0.15
12 0.16
13 0.19
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.19
18 0.21
19 0.24
20 0.3
21 0.3
22 0.31
23 0.37
24 0.36
25 0.39
26 0.42
27 0.4
28 0.38
29 0.4
30 0.39
31 0.32
32 0.34
33 0.32
34 0.28
35 0.28
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.21
40 0.25
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.28
45 0.26
46 0.31
47 0.32
48 0.33
49 0.39
50 0.4
51 0.43
52 0.44
53 0.41
54 0.38
55 0.44
56 0.41
57 0.41
58 0.46
59 0.41
60 0.43
61 0.47
62 0.51
63 0.46
64 0.43
65 0.4
66 0.34
67 0.4
68 0.37
69 0.38
70 0.35
71 0.33
72 0.35
73 0.33
74 0.39
75 0.32
76 0.31
77 0.25
78 0.24
79 0.26
80 0.24
81 0.22
82 0.14
83 0.16
84 0.18
85 0.28
86 0.29
87 0.32
88 0.29
89 0.32
90 0.36
91 0.36
92 0.35
93 0.34
94 0.42
95 0.42
96 0.43
97 0.46
98 0.48
99 0.52
100 0.56
101 0.55
102 0.49
103 0.55
104 0.62
105 0.65
106 0.68
107 0.67
108 0.72
109 0.76
110 0.8
111 0.81
112 0.84
113 0.83
114 0.82
115 0.86
116 0.85
117 0.84
118 0.81
119 0.75
120 0.69
121 0.61
122 0.54
123 0.45
124 0.35
125 0.28
126 0.2
127 0.16
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.22
142 0.25
143 0.28
144 0.32
145 0.35
146 0.35
147 0.33
148 0.33
149 0.32
150 0.34
151 0.32
152 0.32
153 0.28
154 0.28
155 0.27
156 0.28
157 0.25
158 0.2
159 0.15
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.14
208 0.15
209 0.17
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.15
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.11
223 0.13
224 0.15
225 0.19
226 0.21
227 0.23
228 0.24
229 0.27
230 0.3
231 0.36
232 0.39
233 0.4
234 0.48
235 0.46
236 0.47
237 0.44
238 0.39
239 0.33
240 0.29
241 0.25
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.14
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.19
250 0.21
251 0.26
252 0.28
253 0.27
254 0.25
255 0.25
256 0.26
257 0.28
258 0.31
259 0.33
260 0.32
261 0.32
262 0.33
263 0.35
264 0.35
265 0.34
266 0.28
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.23
271 0.21
272 0.16
273 0.13
274 0.15
275 0.14
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.15
322 0.17
323 0.21
324 0.26
325 0.32
326 0.34
327 0.39
328 0.39
329 0.36
330 0.36
331 0.33
332 0.27
333 0.2
334 0.19
335 0.14
336 0.12
337 0.08
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.2
346 0.25
347 0.25
348 0.31
349 0.34
350 0.36
351 0.38
352 0.4
353 0.41
354 0.41
355 0.44
356 0.46
357 0.46
358 0.48
359 0.56
360 0.63
361 0.7
362 0.71
363 0.73
364 0.73
365 0.79
366 0.83
367 0.76
368 0.71
369 0.62
370 0.53
371 0.46
372 0.39
373 0.3
374 0.22
375 0.19
376 0.14
377 0.11
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.16
402 0.23
403 0.27
404 0.33
405 0.43
406 0.53
407 0.63
408 0.71
409 0.74
410 0.79
411 0.84
412 0.9
413 0.9
414 0.9
415 0.9
416 0.9
417 0.86
418 0.8
419 0.72
420 0.62
421 0.53
422 0.43
423 0.32
424 0.23
425 0.15
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.09
437 0.13
438 0.18
439 0.19
440 0.2
441 0.24
442 0.26
443 0.33
444 0.33
445 0.3
446 0.26
447 0.26
448 0.26
449 0.26
450 0.24
451 0.16
452 0.19
453 0.2
454 0.21
455 0.2
456 0.19
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.11
461 0.18
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.2
468 0.21
469 0.18
470 0.18
471 0.18
472 0.19
473 0.2
474 0.22
475 0.23
476 0.25
477 0.24
478 0.24
479 0.26
480 0.27
481 0.26
482 0.25
483 0.24
484 0.2
485 0.2
486 0.22
487 0.2
488 0.2
489 0.21
490 0.21
491 0.19
492 0.19
493 0.23
494 0.27
495 0.29
496 0.31
497 0.33
498 0.34
499 0.36
500 0.43
501 0.37
502 0.34
503 0.33
504 0.37
505 0.42
506 0.42
507 0.49
508 0.49
509 0.5
510 0.47
511 0.5
512 0.48
513 0.43
514 0.44
515 0.45
516 0.44
517 0.43
518 0.5
519 0.51
520 0.56
521 0.58
522 0.62
523 0.61
524 0.54
525 0.52
526 0.48
527 0.43
528 0.32
529 0.27
530 0.2
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.09
535 0.08
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.16
540 0.17
541 0.18
542 0.19
543 0.22
544 0.26
545 0.35
546 0.42
547 0.41
548 0.48
549 0.55
550 0.62
551 0.62
552 0.59
553 0.52
554 0.49
555 0.43
556 0.38
557 0.33
558 0.24
559 0.2
560 0.18
561 0.15
562 0.11
563 0.12
564 0.1
565 0.15
566 0.16
567 0.18
568 0.25
569 0.26
570 0.28
571 0.28
572 0.34
573 0.26
574 0.31
575 0.31
576 0.26
577 0.31
578 0.3
579 0.33
580 0.27
581 0.27
582 0.22
583 0.21
584 0.19
585 0.14
586 0.15
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.12
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.14
598 0.16
599 0.16
600 0.19
601 0.24
602 0.25
603 0.24
604 0.24
605 0.19
606 0.2
607 0.23
608 0.21
609 0.18
610 0.18
611 0.21
612 0.21
613 0.27
614 0.24
615 0.23
616 0.23