FuNGI

A0A5N6SWB3

Protein Details

Accession

A0A5N6SWB3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
153-174	FSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLP	Hydrophilic
368-392	YTMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVV	Hydrophilic
546-568	QAAGNPSRKKRKVVTQETPTTAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MHSYVRPHQFVALRLPSEFTKIQKIEPDSTVFLGKFGSFPANQIIGRPFYLTFEILDDADEKDGSCLRVIPAAELHAETLIAEGEGEGDGEELDTNEDGTPMRTNRETVDDASTQKLTWEEIEALKKESGGAGREIISKLLESHQALDQKTSFSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPLDVSILTNHMMEDQGAARIMELRDEMIGLLGCWGNVHHGGDASLEQAIAAKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHDGDDYEEQGSSDEPKKNEAEQAQDDEQPPTDSSTRRPARPAHMSASGNSITFLHPNKQPNLSLLKYFGYNLDNPDETHPLHKHLKTVSWLQLLDPNADPIYSEEPEIIPESELYTMKSNKRGAYHRKRNRWARVQSVVNEARAGEFDGLIVATAMDPSSVLKYAVPLLAGSAHVAVYSPSIEPLTELMDLYSTPRKTAFITRRQQLKEQKLLQSSDQNDANDNESQDSYLSELMDEFYLDPTLLLAPTLQHSRVRPWQVLPGRTHPLMSMRGGAEGYIFHGIRVIPTQQAIQAAGNPSRKKRKVVTQETPTTAVDSGSGVDVEMKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.4
3	0.35
4	0.37
5	0.36
6	0.31
7	0.33
8	0.34
9	0.36
10	0.41
11	0.46
12	0.45
13	0.45
14	0.47
15	0.39
16	0.39
17	0.4
18	0.32
19	0.27
20	0.23
21	0.2
22	0.16
23	0.15
24	0.18
25	0.14
26	0.16
27	0.21
28	0.24
29	0.23
30	0.26
31	0.28
32	0.26
33	0.26
34	0.26
35	0.22
36	0.2
37	0.23
38	0.2
39	0.17
40	0.16
41	0.17
42	0.15
43	0.15
44	0.14
45	0.12
46	0.13
47	0.12
48	0.1
49	0.11
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.17
56	0.17
57	0.17
58	0.16
59	0.17
60	0.17
61	0.16
62	0.16
63	0.12
64	0.11
65	0.09
66	0.08
67	0.07
68	0.05
69	0.05
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.05
74	0.04
75	0.04
76	0.04
77	0.04
78	0.05
79	0.04
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.09
87	0.14
88	0.14
89	0.19
90	0.19
91	0.2
92	0.22
93	0.27
94	0.28
95	0.26
96	0.3
97	0.28
98	0.28
99	0.3
100	0.29
101	0.23
102	0.21
103	0.2
104	0.15
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.17
109	0.23
110	0.23
111	0.25
112	0.24
113	0.23
114	0.21
115	0.2
116	0.19
117	0.16
118	0.16
119	0.15
120	0.16
121	0.19
122	0.19
123	0.17
124	0.15
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.17
129	0.15
130	0.16
131	0.2
132	0.24
133	0.24
134	0.26
135	0.24
136	0.21
137	0.21
138	0.21
139	0.18
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.22
144	0.28
145	0.37
146	0.44
147	0.53
148	0.58
149	0.64
150	0.72
151	0.76
152	0.79
153	0.81
154	0.82
155	0.8
156	0.8
157	0.76
158	0.75
159	0.65
160	0.56
161	0.46
162	0.37
163	0.29
164	0.25
165	0.2
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.09
170	0.07
171	0.07
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.06
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.09
212	0.09
213	0.11
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.18
219	0.16
220	0.15
221	0.13
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.09
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.14
253	0.16
254	0.16
255	0.19
256	0.21
257	0.21
258	0.25
259	0.24
260	0.24
261	0.22
262	0.26
263	0.25
264	0.26
265	0.26
266	0.22
267	0.21
268	0.17
269	0.15
270	0.13
271	0.14
272	0.12
273	0.14
274	0.24
275	0.27
276	0.28
277	0.31
278	0.33
279	0.37
280	0.43
281	0.44
282	0.37
283	0.39
284	0.39
285	0.35
286	0.36
287	0.29
288	0.22
289	0.19
290	0.16
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.17
296	0.21
297	0.23
298	0.25
299	0.25
300	0.25
301	0.29
302	0.27
303	0.24
304	0.21
305	0.2
306	0.18
307	0.17
308	0.16
309	0.13
310	0.13
311	0.14
312	0.15
313	0.14
314	0.15
315	0.17
316	0.17
317	0.16
318	0.2
319	0.19
320	0.22
321	0.28
322	0.28
323	0.29
324	0.28
325	0.31
326	0.29
327	0.33
328	0.33
329	0.29
330	0.28
331	0.25
332	0.28
333	0.26
334	0.25
335	0.2
336	0.16
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.13
342	0.11
343	0.11
344	0.1
345	0.1
346	0.11
347	0.13
348	0.11
349	0.08
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.13
356	0.17
357	0.2
358	0.26
359	0.28
360	0.3
361	0.35
362	0.42
363	0.5
364	0.57
365	0.65
366	0.69
367	0.76
368	0.83
369	0.88
370	0.89
371	0.88
372	0.84
373	0.8
374	0.78
375	0.72
376	0.64
377	0.64
378	0.56
379	0.46
380	0.39
381	0.31
382	0.24
383	0.19
384	0.18
385	0.09
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.06
403	0.08
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.11
432	0.17
433	0.15
434	0.16
435	0.17
436	0.18
437	0.2
438	0.3
439	0.36
440	0.4
441	0.48
442	0.55
443	0.63
444	0.66
445	0.72
446	0.72
447	0.72
448	0.71
449	0.69
450	0.69
451	0.65
452	0.64
453	0.59
454	0.57
455	0.5
456	0.46
457	0.43
458	0.37
459	0.34
460	0.33
461	0.32
462	0.26
463	0.25
464	0.21
465	0.18
466	0.17
467	0.15
468	0.14
469	0.12
470	0.11
471	0.1
472	0.08
473	0.08
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.1
489	0.14
490	0.16
491	0.19
492	0.21
493	0.29
494	0.37
495	0.43
496	0.42
497	0.42
498	0.5
499	0.53
500	0.58
501	0.56
502	0.54
503	0.55
504	0.52
505	0.5
506	0.41
507	0.39
508	0.36
509	0.32
510	0.29
511	0.23
512	0.24
513	0.23
514	0.21
515	0.17
516	0.13
517	0.14
518	0.15
519	0.14
520	0.12
521	0.15
522	0.15
523	0.16
524	0.19
525	0.19
526	0.15
527	0.17
528	0.18
529	0.18
530	0.2
531	0.2
532	0.17
533	0.2
534	0.23
535	0.28
536	0.35
537	0.38
538	0.46
539	0.55
540	0.59
541	0.63
542	0.66
543	0.71
544	0.74
545	0.8
546	0.81
547	0.8
548	0.84
549	0.81
550	0.76
551	0.66
552	0.57
553	0.46
554	0.35
555	0.26
556	0.17
557	0.14
558	0.11
559	0.1
560	0.08

A0A5N6SWB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer