FuNGI

C5MFB4

Protein Details

Accession

C5MFB4

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MAKSKSRGRRAEKKSKKEESSLVH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-17	KSKSRGRRAEKKSKK
650-675	RVKKPIELKLERLAEEKRRKEEQAEK
682-684	KRK
691-705	SGPEKKQKLRGRNRN

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR040000 NOP9 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003723 F:RNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	ctp:CTRG_04757 -

Amino Acid Sequences

MAKSKSRGRRAEKKSKKEESSLVHDSEVPVQESGENSTPSGVPNTFFGLVDSNELDYFKQAESTLNINAFDSDEDRQGFINSVLEEAQGKELKLVTNQICSKLMERLILFANNKQLKKIFKQFSNHFVSLAFHKYSSHVLETLLVRSAALIEKELAQTEEEKHEEEEEGEDEKDDVPMEDLFISMLNEFKPHLTTMIDHSYASHVLRLLLLILAGKELPSTTTSNSTLRSKKSKIARKMIEIKDNEDFNRAFQTPESFKNELREYCQTISAGLDTKSARELSIHKIGSPVLQLLVQFEGLVDRERTFWHLIFCKDSEGKDSTEESFVEYLLSDSVGSHFLESIIKNDGARPKYLERLYKLYMKDRVLKLAKRSTNGVYIIQALLFKLKPVEVEFILDEIIPELSELISIAENQNLDLANKLIDASIIRGNYRRDEIIDQLFKKFAPNYNVENPQDHTTTEFIENILQLQGSTLGNTRDDWPTAEERKRALFLEKLMEYDYKFVICTWFNFMALPIERFIQMCFHGVFCHVVEKALIVEPEESKKVQILRKRLLNIFQGQIVGLACNSYGSHIVDTLWNFTVLLPMYKDRIASELFSESHKVKESTYGRLVWKNWGMELFSRKKYDWKALIKQQEVEYYGEDNEESTTSKRVKKPIELKLERLAEEKRRKEEQAEKAQSGYIKRKLDELTGSGPEKKQKLRGRNRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.91
3	0.88
4	0.84
5	0.82
6	0.78
7	0.76
8	0.71
9	0.62
10	0.53
11	0.48
12	0.42
13	0.4
14	0.35
15	0.28
16	0.22
17	0.21
18	0.2
19	0.2
20	0.24
21	0.22
22	0.2
23	0.18
24	0.2
25	0.2
26	0.2
27	0.23
28	0.19
29	0.16
30	0.17
31	0.21
32	0.2
33	0.2
34	0.19
35	0.18
36	0.17
37	0.19
38	0.19
39	0.16
40	0.15
41	0.16
42	0.15
43	0.14
44	0.15
45	0.12
46	0.13
47	0.12
48	0.14
49	0.17
50	0.2
51	0.22
52	0.22
53	0.22
54	0.21
55	0.2
56	0.19
57	0.17
58	0.16
59	0.15
60	0.17
61	0.17
62	0.17
63	0.18
64	0.18
65	0.18
66	0.16
67	0.17
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.18
75	0.16
76	0.16
77	0.17
78	0.18
79	0.19
80	0.2
81	0.27
82	0.23
83	0.3
84	0.32
85	0.34
86	0.34
87	0.34
88	0.34
89	0.32
90	0.32
91	0.27
92	0.25
93	0.25
94	0.25
95	0.29
96	0.29
97	0.26
98	0.34
99	0.37
100	0.37
101	0.38
102	0.4
103	0.42
104	0.49
105	0.56
106	0.54
107	0.55
108	0.63
109	0.65
110	0.69
111	0.71
112	0.63
113	0.53
114	0.45
115	0.4
116	0.35
117	0.35
118	0.27
119	0.18
120	0.18
121	0.2
122	0.23
123	0.24
124	0.22
125	0.18
126	0.17
127	0.21
128	0.22
129	0.21
130	0.19
131	0.16
132	0.13
133	0.12
134	0.13
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.12
143	0.11
144	0.13
145	0.14
146	0.18
147	0.18
148	0.18
149	0.18
150	0.19
151	0.18
152	0.17
153	0.16
154	0.13
155	0.14
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.16
183	0.2
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.2
188	0.2
189	0.19
190	0.15
191	0.11
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.08
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.07
207	0.09
208	0.1
209	0.14
210	0.17
211	0.19
212	0.22
213	0.28
214	0.3
215	0.35
216	0.41
217	0.4
218	0.45
219	0.53
220	0.59
221	0.62
222	0.67
223	0.66
224	0.67
225	0.74
226	0.73
227	0.71
228	0.63
229	0.57
230	0.51
231	0.48
232	0.4
233	0.33
234	0.28
235	0.21
236	0.24
237	0.21
238	0.17
239	0.16
240	0.21
241	0.2
242	0.25
243	0.31
244	0.28
245	0.29
246	0.34
247	0.37
248	0.33
249	0.35
250	0.34
251	0.31
252	0.3
253	0.31
254	0.25
255	0.22
256	0.21
257	0.17
258	0.15
259	0.11
260	0.13
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.17
269	0.24
270	0.24
271	0.22
272	0.23
273	0.23
274	0.22
275	0.2
276	0.15
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.12
293	0.14
294	0.14
295	0.16
296	0.19
297	0.2
298	0.22
299	0.22
300	0.22
301	0.21
302	0.21
303	0.21
304	0.19
305	0.19
306	0.18
307	0.19
308	0.17
309	0.17
310	0.16
311	0.14
312	0.12
313	0.11
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.1
333	0.13
334	0.18
335	0.17
336	0.18
337	0.2
338	0.19
339	0.25
340	0.29
341	0.3
342	0.28
343	0.31
344	0.33
345	0.36
346	0.36
347	0.34
348	0.37
349	0.35
350	0.39
351	0.35
352	0.4
353	0.4
354	0.41
355	0.41
356	0.44
357	0.44
358	0.39
359	0.41
360	0.35
361	0.34
362	0.33
363	0.27
364	0.19
365	0.18
366	0.16
367	0.14
368	0.12
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.11
378	0.09
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.06
386	0.05
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.07
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.14
416	0.15
417	0.17
418	0.19
419	0.17
420	0.17
421	0.18
422	0.21
423	0.25
424	0.29
425	0.28
426	0.27
427	0.27
428	0.25
429	0.25
430	0.24
431	0.23
432	0.22
433	0.25
434	0.29
435	0.35
436	0.42
437	0.41
438	0.4
439	0.38
440	0.36
441	0.33
442	0.27
443	0.22
444	0.16
445	0.17
446	0.16
447	0.14
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.1
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.11
463	0.14
464	0.13
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.22
469	0.29
470	0.32
471	0.32
472	0.32
473	0.34
474	0.35
475	0.33
476	0.29
477	0.25
478	0.23
479	0.27
480	0.25
481	0.24
482	0.24
483	0.24
484	0.21
485	0.2
486	0.18
487	0.12
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.17
494	0.18
495	0.17
496	0.17
497	0.18
498	0.2
499	0.2
500	0.2
501	0.14
502	0.14
503	0.15
504	0.15
505	0.15
506	0.12
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.14
514	0.12
515	0.14
516	0.12
517	0.12
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.11
523	0.09
524	0.11
525	0.13
526	0.16
527	0.18
528	0.17
529	0.15
530	0.19
531	0.24
532	0.28
533	0.32
534	0.38
535	0.44
536	0.51
537	0.56
538	0.57
539	0.56
540	0.57
541	0.54
542	0.47
543	0.4
544	0.33
545	0.27
546	0.25
547	0.19
548	0.13
549	0.09
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.08
556	0.09
557	0.1
558	0.1
559	0.11
560	0.14
561	0.15
562	0.17
563	0.15
564	0.14
565	0.14
566	0.13
567	0.16
568	0.13
569	0.15
570	0.14
571	0.15
572	0.17
573	0.18
574	0.19
575	0.16
576	0.18
577	0.18
578	0.17
579	0.17
580	0.18
581	0.18
582	0.19
583	0.22
584	0.2
585	0.22
586	0.25
587	0.23
588	0.2
589	0.29
590	0.31
591	0.35
592	0.38
593	0.41
594	0.41
595	0.47
596	0.47
597	0.46
598	0.48
599	0.42
600	0.38
601	0.35
602	0.32
603	0.32
604	0.39
605	0.39
606	0.39
607	0.42
608	0.41
609	0.48
610	0.51
611	0.56
612	0.56
613	0.59
614	0.63
615	0.68
616	0.77
617	0.72
618	0.71
619	0.64
620	0.6
621	0.52
622	0.44
623	0.37
624	0.29
625	0.26
626	0.22
627	0.19
628	0.14
629	0.13
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.18
634	0.23
635	0.32
636	0.37
637	0.45
638	0.51
639	0.6
640	0.68
641	0.72
642	0.77
643	0.74
644	0.73
645	0.74
646	0.71
647	0.62
648	0.57
649	0.54
650	0.53
651	0.58
652	0.6
653	0.58
654	0.6
655	0.62
656	0.66
657	0.69
658	0.69
659	0.7
660	0.71
661	0.65
662	0.6
663	0.6
664	0.55
665	0.52
666	0.51
667	0.48
668	0.45
669	0.44
670	0.48
671	0.48
672	0.49
673	0.47
674	0.42
675	0.4
676	0.41
677	0.43
678	0.42
679	0.44
680	0.46
681	0.48
682	0.5
683	0.54
684	0.58
685	0.66

C5MFB4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer