FuNGI

C5M355

Protein Details

Accession

C5M355

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-50	KGPGAKPKFKPKVVVRKSKEERAKV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-82	GKGPGAKPKFKPKVVVRKSKEERAKVAPTLKTEPTTRKPVSNRGRGGARGGRGGGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	ctp:CTRG_00494 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSNRLESLNSKKPASGTGSTSSTPGKGPGAKPKFKPKVVVRKSKEERAKVAPTLKTEPTTRKPVSNRGRGGARGGRGGGRGGRNYAGTHILSNGFLSAGAVSIGNSNGSKLGLTNDLIYGGENGGSEFISGLKLKEEKIRNDSDDEGSGSSSEGSGNDGRQRINMTKEYRFREEDVVLFPVRPFRDDGIKRKEPIYNQQQQQVEQSNEEIKLKTEPGLEDSATPMPISLTQSRESTVKSENIDEKLEMIKESKSKLESKIVQGDPYAIEESNRLITDYQQILDIVTGKLDKLLSVPTTIKHKVKKEKTADDIEVDNEDGEADNDDDDEFVEEEEIIEPDENYVLFQLPKHLPSYNRAPTLVKLEKGVKPVDEPYNAEEISQLATHTSALRGQIGKINIHQSGKITIDLGDKNIRLNATKGASTDFLQELAMIEMMEQKDKEKEKEKPEGSNDIEADEDIQMVDDEGRSIKGKLVRLGTISEKIVATPSIQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.41
3	0.36
4	0.37
5	0.39
6	0.38
7	0.39
8	0.35
9	0.29
10	0.26
11	0.24
12	0.24
13	0.27
14	0.31
15	0.4
16	0.48
17	0.55
18	0.61
19	0.7
20	0.74
21	0.72
22	0.77
23	0.76
24	0.78
25	0.8
26	0.84
27	0.79
28	0.81
29	0.84
30	0.84
31	0.83
32	0.79
33	0.75
34	0.72
35	0.72
36	0.68
37	0.68
38	0.62
39	0.58
40	0.57
41	0.54
42	0.5
43	0.49
44	0.51
45	0.5
46	0.56
47	0.53
48	0.55
49	0.57
50	0.64
51	0.69
52	0.7
53	0.67
54	0.64
55	0.66
56	0.59
57	0.6
58	0.56
59	0.48
60	0.41
61	0.38
62	0.34
63	0.3
64	0.31
65	0.29
66	0.28
67	0.28
68	0.27
69	0.27
70	0.27
71	0.26
72	0.26
73	0.24
74	0.2
75	0.19
76	0.18
77	0.17
78	0.16
79	0.15
80	0.13
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.06
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.05
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.09
99	0.1
100	0.11
101	0.12
102	0.11
103	0.12
104	0.12
105	0.11
106	0.1
107	0.08
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.1
120	0.12
121	0.13
122	0.21
123	0.27
124	0.31
125	0.37
126	0.42
127	0.41
128	0.43
129	0.44
130	0.38
131	0.33
132	0.28
133	0.23
134	0.18
135	0.15
136	0.12
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.05
141	0.08
142	0.09
143	0.11
144	0.15
145	0.17
146	0.17
147	0.18
148	0.21
149	0.22
150	0.26
151	0.31
152	0.32
153	0.37
154	0.44
155	0.48
156	0.49
157	0.49
158	0.46
159	0.43
160	0.39
161	0.34
162	0.29
163	0.26
164	0.22
165	0.19
166	0.17
167	0.18
168	0.17
169	0.16
170	0.16
171	0.15
172	0.24
173	0.3
174	0.39
175	0.43
176	0.47
177	0.48
178	0.49
179	0.51
180	0.44
181	0.48
182	0.49
183	0.49
184	0.47
185	0.52
186	0.5
187	0.47
188	0.48
189	0.44
190	0.35
191	0.26
192	0.25
193	0.21
194	0.21
195	0.21
196	0.17
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.14
201	0.13
202	0.12
203	0.14
204	0.15
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.08
212	0.07
213	0.08
214	0.11
215	0.11
216	0.13
217	0.15
218	0.15
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.16
223	0.16
224	0.17
225	0.16
226	0.19
227	0.21
228	0.22
229	0.22
230	0.19
231	0.17
232	0.16
233	0.15
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.12
238	0.13
239	0.14
240	0.16
241	0.18
242	0.21
243	0.26
244	0.28
245	0.3
246	0.37
247	0.35
248	0.33
249	0.3
250	0.29
251	0.22
252	0.2
253	0.17
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.09
263	0.13
264	0.14
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.12
270	0.12
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.08
280	0.08
281	0.1
282	0.11
283	0.12
284	0.19
285	0.23
286	0.28
287	0.32
288	0.4
289	0.48
290	0.56
291	0.64
292	0.66
293	0.68
294	0.69
295	0.69
296	0.62
297	0.54
298	0.47
299	0.38
300	0.3
301	0.23
302	0.16
303	0.1
304	0.09
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.13
334	0.14
335	0.16
336	0.18
337	0.21
338	0.22
339	0.27
340	0.36
341	0.37
342	0.38
343	0.38
344	0.37
345	0.36
346	0.43
347	0.42
348	0.33
349	0.3
350	0.34
351	0.35
352	0.38
353	0.37
354	0.29
355	0.27
356	0.32
357	0.33
358	0.3
359	0.28
360	0.28
361	0.31
362	0.3
363	0.27
364	0.22
365	0.17
366	0.16
367	0.15
368	0.11
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.11
376	0.14
377	0.15
378	0.16
379	0.2
380	0.22
381	0.23
382	0.24
383	0.28
384	0.28
385	0.29
386	0.29
387	0.25
388	0.27
389	0.26
390	0.23
391	0.19
392	0.17
393	0.21
394	0.21
395	0.23
396	0.24
397	0.23
398	0.24
399	0.26
400	0.25
401	0.21
402	0.22
403	0.25
404	0.23
405	0.24
406	0.23
407	0.24
408	0.24
409	0.23
410	0.25
411	0.2
412	0.17
413	0.16
414	0.15
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.07
419	0.07
420	0.11
421	0.12
422	0.15
423	0.14
424	0.15
425	0.23
426	0.28
427	0.35
428	0.39
429	0.47
430	0.53
431	0.63
432	0.66
433	0.67
434	0.68
435	0.7
436	0.65
437	0.63
438	0.55
439	0.45
440	0.41
441	0.32
442	0.28
443	0.19
444	0.15
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.17
457	0.22
458	0.27
459	0.32
460	0.36
461	0.36
462	0.37
463	0.4
464	0.4
465	0.39
466	0.36
467	0.32
468	0.28
469	0.25
470	0.25

C5M355

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer