Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDF6

Protein Details
Accession C5MDF6    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
490-516SVQSSQPLKKPMKKTRRKSSTATRTTAHydrophilic
543-576DVGVTPVKKKHTRRRLLPRSKKGCWICRIKHLKCHydrophilic
614-646EEVSLIRKRNQAKTRIPRKKSKKDLKKSTLSGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
498-507KKPMKKTRRK
550-564KKKHTRRRLLPRSKK
620-640RKRNQAKTRIPRKKSKKDLKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_04257  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MITHMVTPDSTSSPPNSPCGEDTIKLNSSVISASSPATSSNFLQSLQFQHQQINQFHMLQQHQHQQYSQQVYSTNYTSTPVDQLFQFDNNSVTSFNPAHAATINSSQRSPYESLQPPPPPPSQSQSQSSSQQQQLPPPPSMSIIPQASQDTTTQPLQPNNFYHEYINEFGNNPQHPYSSFVNPQFANSVNSLPNLDAHQQSSQSQSIMQHSQDYSKIGSAPTETTSFLYNLQNQSTDLMINHDLEFNNTSFDSIGEYSQPGISLTYPPTLQPQQNQFHDSIPTSQVQEYPHTPSHLSEPPLSAGISDVSNFSTVLDESHLYRPSSTIGHKLKSPIPSSTPYSNIHNSQLPPPTSSTRKKITKKSSLSRLNTSSRKNLQASLVQSLSTPTDLEHNSPPPVRIISPILKSKASFANIQTEITDDEEGEEDDDENDFSDFTQPPPPVIGSSIAGNVGLRSISNTSSTSSHGSHHGLPVMNVFRHNSASTVAPSVQSSQPLKKPMKKTRRKSSTATRTTANANANRISSKSSTDSTKTESESGEDFDVGVTPVKKKHTRRRLLPRSKKGCWICRIKHLKCDEVTPVCGGCAKFGLQCDYSPEKPDYVTDKFLRQQKLEEVSLIRKRNQAKTRIPRKKSKKDLKKSTLSGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.38
7 0.38
8 0.33
9 0.34
10 0.37
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.25
15 0.21
16 0.21
17 0.18
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.22
31 0.23
32 0.27
33 0.31
34 0.35
35 0.31
36 0.35
37 0.39
38 0.45
39 0.44
40 0.45
41 0.41
42 0.37
43 0.38
44 0.39
45 0.38
46 0.35
47 0.39
48 0.42
49 0.43
50 0.43
51 0.42
52 0.41
53 0.47
54 0.5
55 0.44
56 0.36
57 0.35
58 0.36
59 0.39
60 0.36
61 0.28
62 0.21
63 0.22
64 0.22
65 0.21
66 0.22
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.21
71 0.21
72 0.22
73 0.21
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.15
79 0.13
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.15
89 0.23
90 0.27
91 0.26
92 0.26
93 0.26
94 0.25
95 0.28
96 0.3
97 0.24
98 0.29
99 0.33
100 0.37
101 0.44
102 0.48
103 0.46
104 0.48
105 0.5
106 0.44
107 0.43
108 0.43
109 0.43
110 0.44
111 0.46
112 0.46
113 0.46
114 0.48
115 0.5
116 0.53
117 0.49
118 0.51
119 0.47
120 0.5
121 0.54
122 0.52
123 0.48
124 0.42
125 0.38
126 0.33
127 0.32
128 0.27
129 0.25
130 0.23
131 0.21
132 0.22
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.2
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.21
141 0.23
142 0.27
143 0.29
144 0.33
145 0.33
146 0.36
147 0.37
148 0.34
149 0.31
150 0.28
151 0.29
152 0.26
153 0.25
154 0.2
155 0.18
156 0.19
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.24
164 0.26
165 0.25
166 0.3
167 0.29
168 0.33
169 0.32
170 0.32
171 0.3
172 0.27
173 0.24
174 0.19
175 0.2
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.16
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.22
199 0.21
200 0.21
201 0.17
202 0.15
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.16
223 0.13
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.13
232 0.15
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.15
256 0.18
257 0.19
258 0.22
259 0.29
260 0.34
261 0.36
262 0.38
263 0.35
264 0.32
265 0.32
266 0.28
267 0.22
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.2
280 0.19
281 0.22
282 0.24
283 0.24
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.13
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.12
306 0.14
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.16
312 0.15
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.23
317 0.26
318 0.29
319 0.31
320 0.32
321 0.25
322 0.26
323 0.28
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.26
328 0.28
329 0.29
330 0.28
331 0.27
332 0.26
333 0.25
334 0.25
335 0.29
336 0.25
337 0.24
338 0.25
339 0.27
340 0.31
341 0.34
342 0.36
343 0.39
344 0.48
345 0.54
346 0.61
347 0.66
348 0.69
349 0.73
350 0.76
351 0.77
352 0.77
353 0.74
354 0.7
355 0.66
356 0.63
357 0.61
358 0.56
359 0.53
360 0.48
361 0.49
362 0.45
363 0.41
364 0.36
365 0.35
366 0.34
367 0.3
368 0.26
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.16
373 0.11
374 0.09
375 0.06
376 0.1
377 0.11
378 0.13
379 0.16
380 0.17
381 0.2
382 0.21
383 0.21
384 0.18
385 0.19
386 0.17
387 0.16
388 0.19
389 0.21
390 0.25
391 0.29
392 0.3
393 0.29
394 0.29
395 0.3
396 0.29
397 0.27
398 0.25
399 0.22
400 0.27
401 0.27
402 0.27
403 0.24
404 0.2
405 0.19
406 0.17
407 0.16
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.16
426 0.16
427 0.16
428 0.18
429 0.18
430 0.15
431 0.16
432 0.15
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.14
450 0.16
451 0.18
452 0.17
453 0.18
454 0.2
455 0.22
456 0.22
457 0.22
458 0.24
459 0.21
460 0.2
461 0.23
462 0.24
463 0.21
464 0.21
465 0.21
466 0.19
467 0.21
468 0.21
469 0.17
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.17
474 0.16
475 0.14
476 0.15
477 0.17
478 0.17
479 0.21
480 0.24
481 0.27
482 0.31
483 0.39
484 0.46
485 0.51
486 0.61
487 0.66
488 0.73
489 0.78
490 0.84
491 0.87
492 0.89
493 0.87
494 0.84
495 0.84
496 0.84
497 0.82
498 0.74
499 0.65
500 0.57
501 0.55
502 0.53
503 0.48
504 0.41
505 0.36
506 0.35
507 0.35
508 0.34
509 0.31
510 0.29
511 0.23
512 0.24
513 0.24
514 0.25
515 0.28
516 0.31
517 0.32
518 0.33
519 0.36
520 0.34
521 0.33
522 0.3
523 0.28
524 0.26
525 0.25
526 0.21
527 0.17
528 0.15
529 0.13
530 0.13
531 0.11
532 0.13
533 0.12
534 0.14
535 0.18
536 0.26
537 0.35
538 0.45
539 0.55
540 0.63
541 0.72
542 0.8
543 0.87
544 0.9
545 0.93
546 0.94
547 0.94
548 0.93
549 0.87
550 0.86
551 0.84
552 0.81
553 0.79
554 0.79
555 0.73
556 0.74
557 0.81
558 0.75
559 0.74
560 0.71
561 0.69
562 0.6
563 0.59
564 0.57
565 0.51
566 0.49
567 0.42
568 0.36
569 0.29
570 0.31
571 0.27
572 0.19
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.19
577 0.24
578 0.21
579 0.22
580 0.28
581 0.33
582 0.34
583 0.36
584 0.36
585 0.32
586 0.31
587 0.36
588 0.35
589 0.33
590 0.38
591 0.37
592 0.41
593 0.46
594 0.53
595 0.55
596 0.51
597 0.51
598 0.51
599 0.55
600 0.5
601 0.47
602 0.44
603 0.46
604 0.53
605 0.53
606 0.49
607 0.5
608 0.56
609 0.62
610 0.66
611 0.67
612 0.69
613 0.75
614 0.83
615 0.87
616 0.88
617 0.89
618 0.91
619 0.92
620 0.93
621 0.93
622 0.93
623 0.93
624 0.96
625 0.95
626 0.94