Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TD28

Protein Details
Accession A0A5N6TD28    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-243GKVERARKKERGVKERKVVVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-239RARKKERGVKERK
Subcellular Location(s) cyto 7, plas 6, cyto_nucl 5.333, cyto_mito 5.333, E.R. 4, extr 3, nucl 2.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021013  ATPase_Vma12  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF11712  Vma12  
Amino Acid Sequences MVQLITTTRILSALEAIPTSDRKDLDLPSNPSLDSPITHDQLIRLSRYFRAENATSNAETRSLNSLLHGTKVYVPPPPPKPEPSPEYLALKARLLAAYETDTYNQMTASSNTTNGPSPIFTSSTPTVSALHEDDAHSDADTLTPGLVLNIFLSVVITGFSVYWALTSFSTPELLTEAVSSVWDQNHGSKRGGGVSEAVKVLVSFGAAVGVGVAEVAIYAIYLGKVERARKKERGVKERKVVVGREVLGRRDESESVQRVDGEKEEIWGRGPNGGLRRRVRERWEEKEKEGDGDGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.16
5 0.17
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.21
10 0.24
11 0.27
12 0.32
13 0.39
14 0.42
15 0.41
16 0.42
17 0.39
18 0.36
19 0.35
20 0.28
21 0.2
22 0.21
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.25
27 0.23
28 0.29
29 0.31
30 0.27
31 0.23
32 0.24
33 0.27
34 0.32
35 0.32
36 0.27
37 0.31
38 0.3
39 0.32
40 0.34
41 0.35
42 0.3
43 0.3
44 0.28
45 0.23
46 0.22
47 0.19
48 0.2
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.2
53 0.18
54 0.2
55 0.19
56 0.15
57 0.19
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.25
62 0.31
63 0.37
64 0.42
65 0.42
66 0.45
67 0.5
68 0.52
69 0.53
70 0.5
71 0.49
72 0.45
73 0.45
74 0.41
75 0.39
76 0.34
77 0.29
78 0.25
79 0.2
80 0.18
81 0.15
82 0.13
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.16
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.14
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.24
179 0.19
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.08
211 0.12
212 0.19
213 0.27
214 0.34
215 0.42
216 0.49
217 0.59
218 0.64
219 0.71
220 0.75
221 0.77
222 0.79
223 0.81
224 0.8
225 0.77
226 0.73
227 0.65
228 0.58
229 0.53
230 0.46
231 0.44
232 0.41
233 0.36
234 0.34
235 0.33
236 0.31
237 0.29
238 0.28
239 0.24
240 0.3
241 0.32
242 0.32
243 0.32
244 0.31
245 0.29
246 0.3
247 0.27
248 0.24
249 0.19
250 0.2
251 0.21
252 0.2
253 0.2
254 0.22
255 0.21
256 0.19
257 0.2
258 0.23
259 0.3
260 0.36
261 0.43
262 0.46
263 0.54
264 0.6
265 0.66
266 0.69
267 0.71
268 0.74
269 0.75
270 0.8
271 0.77
272 0.72
273 0.74
274 0.67
275 0.59