Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M1R6

Protein Details
Accession C5M1R6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58VVIFKSLSKKDPKTKEKALQELLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039795  LTN1/Rkr1  
IPR039804  RING-CH-C4HC3_LTN1  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ctp:CTRG_00005  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16491  RING-CH-C4HC3_LTN1  
Amino Acid Sequences MSLDHMGDLGYNDFPVSLNYITALPDVSLIPNPDIVVIFKSLSKKDPKTKEKALQELLGVTDVEDMTIISWIQMYPKLALDNSRVVRSLCHQIQERFLSIVGGKAFSKYLKSSLPIWLMGLYDTDKSVSSTAFKTLSSTFDSEKLEKTWMIFKEQIINLIATIINIETEETLSDKRYTNESEMTMKYNRALIGAINMLAKYPLEQVNVLNSDQVWDHMRTDDLALLRTLLSLIISMPNEAMESLYKLISKKFFKIKLKSSQPIIYSNVILQFWQSILKMTMFGIDHKLKKNFWDYGGSKASSKFYEYFKVGSCNSSGKYYELVKQVFIQLKEMNMVIDFTSQEEFDFIIGVLIKESRFKAAALDCIFTVIECFQVNTNFSTILTKVLQFMPRDNSEVLKVLSDNYKEDMKDCFVIEKPDQAIMGNYFKVLRSVGLTDVLEDIVRSAVEEASFDIIALYIQQESHPIPEVQEFLSELPSYLEEDHIDPVLNLFFTAKSAEIPVNDFFFKLSIVKPDLVDSFLQKLDLAVNKQDHPDIYSYLVEVSKRGVNETVIRLCKDKDILSNMDLTVDIINKYNLLSTIIDQDISSVMQSAWSSLNQQFLFELKQHQDKYVTSMMRYLKSTTTETDLSDFYEFVKDGPLPNFDEELQRSMEQIDKSTVAVSNPLASMVYLCHSTPGSINDFIPVIGNLLTHESNVSQLMLLVREYIADYLLIKENPSEPVVDVLSKLEGRIAVHFNQYTFAELIDSEGPLQSCFVLAEGNDVQAFYAARIIKRALENSVESESVLDYEIKTSLVKTPLKFAGIINGVLKFITKYDRLKNYIFSEILSVKKEEQIMSDGLTWVSLCLAFMQTGESSFPIHKLTMVFNLMNDWLDSTLAYDDEFIDMRVQLVRFLGYINQSDLPDVYYELTEKLIENNLEIIQLQPERLDLLYYTLKFIKQGFDQELLDIFLDFTPKENQASVLVQDTLHRALQRREVKPRKEQVMEIFSKSKSVDTQRMCAWYLFKIILADQSDFVVEYQLSKDDKQAEISSGFMNMINDKNFDITRYLWTWYLIFSHFEDVTLKIKSDYVNQISHDLLILLDFIFDYLQFDEKFFSTLIVGEENIIPQYDLIETSKSEPLDYELKYLAVNIYYKCVQYCGSQVQLWFKEIRDKQFKNKVEKFTINYVSPILISHVLDQVTKEKDRIQGSDENMKIKVNLVAKEIRLTYLIDDQKMEMVVRVPSNYPLDNVTVDGPLRLGVKENQWKAWLLASRRVISFGSIVEAIELFCKNVNLHFSGFEDCAICYSILHQDTSLPSKTCPTCSNKFHAACLYKWFKSSGSATCPLCRSAFNFKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.22
28 0.24
29 0.31
30 0.39
31 0.46
32 0.54
33 0.64
34 0.7
35 0.75
36 0.82
37 0.84
38 0.83
39 0.84
40 0.79
41 0.71
42 0.63
43 0.55
44 0.46
45 0.37
46 0.28
47 0.19
48 0.16
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.07
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.2
65 0.2
66 0.24
67 0.26
68 0.32
69 0.33
70 0.34
71 0.34
72 0.31
73 0.33
74 0.34
75 0.39
76 0.34
77 0.37
78 0.41
79 0.43
80 0.5
81 0.52
82 0.49
83 0.4
84 0.37
85 0.32
86 0.26
87 0.27
88 0.2
89 0.18
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.21
95 0.19
96 0.22
97 0.24
98 0.27
99 0.28
100 0.34
101 0.36
102 0.32
103 0.31
104 0.27
105 0.24
106 0.21
107 0.2
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.23
125 0.25
126 0.23
127 0.27
128 0.32
129 0.31
130 0.32
131 0.31
132 0.29
133 0.27
134 0.27
135 0.3
136 0.27
137 0.31
138 0.31
139 0.31
140 0.37
141 0.37
142 0.38
143 0.32
144 0.3
145 0.24
146 0.22
147 0.21
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.12
160 0.15
161 0.16
162 0.18
163 0.23
164 0.26
165 0.28
166 0.31
167 0.32
168 0.34
169 0.34
170 0.37
171 0.35
172 0.32
173 0.29
174 0.28
175 0.25
176 0.2
177 0.19
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.23
194 0.25
195 0.24
196 0.21
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.17
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.17
235 0.24
236 0.27
237 0.32
238 0.4
239 0.48
240 0.56
241 0.64
242 0.68
243 0.71
244 0.77
245 0.76
246 0.72
247 0.69
248 0.62
249 0.57
250 0.53
251 0.44
252 0.35
253 0.31
254 0.28
255 0.23
256 0.2
257 0.16
258 0.13
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.15
268 0.13
269 0.15
270 0.2
271 0.24
272 0.29
273 0.35
274 0.39
275 0.36
276 0.41
277 0.46
278 0.42
279 0.39
280 0.43
281 0.38
282 0.42
283 0.47
284 0.42
285 0.38
286 0.36
287 0.36
288 0.28
289 0.3
290 0.26
291 0.23
292 0.28
293 0.28
294 0.28
295 0.27
296 0.31
297 0.28
298 0.27
299 0.26
300 0.23
301 0.23
302 0.24
303 0.23
304 0.2
305 0.22
306 0.23
307 0.27
308 0.3
309 0.29
310 0.27
311 0.27
312 0.32
313 0.33
314 0.31
315 0.29
316 0.23
317 0.23
318 0.24
319 0.22
320 0.17
321 0.12
322 0.12
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.16
347 0.17
348 0.24
349 0.22
350 0.23
351 0.2
352 0.21
353 0.2
354 0.16
355 0.15
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.17
374 0.21
375 0.2
376 0.23
377 0.26
378 0.26
379 0.29
380 0.27
381 0.25
382 0.22
383 0.24
384 0.21
385 0.16
386 0.14
387 0.13
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.16
392 0.19
393 0.18
394 0.19
395 0.2
396 0.18
397 0.19
398 0.17
399 0.18
400 0.16
401 0.21
402 0.21
403 0.22
404 0.21
405 0.2
406 0.2
407 0.17
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.13
412 0.13
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.09
427 0.08
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.07
449 0.07
450 0.09
451 0.11
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.14
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.09
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.11
493 0.1
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.11
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.13
506 0.13
507 0.12
508 0.12
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.13
513 0.13
514 0.15
515 0.17
516 0.18
517 0.19
518 0.2
519 0.17
520 0.16
521 0.16
522 0.13
523 0.13
524 0.12
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.11
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.14
537 0.18
538 0.22
539 0.22
540 0.23
541 0.23
542 0.23
543 0.23
544 0.22
545 0.2
546 0.18
547 0.2
548 0.21
549 0.21
550 0.22
551 0.2
552 0.18
553 0.16
554 0.13
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.1
571 0.1
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.05
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.1
583 0.11
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.14
588 0.15
589 0.15
590 0.14
591 0.16
592 0.14
593 0.2
594 0.2
595 0.21
596 0.23
597 0.22
598 0.26
599 0.28
600 0.26
601 0.2
602 0.24
603 0.25
604 0.25
605 0.26
606 0.23
607 0.18
608 0.2
609 0.21
610 0.17
611 0.19
612 0.18
613 0.17
614 0.17
615 0.16
616 0.14
617 0.13
618 0.12
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.09
626 0.1
627 0.12
628 0.12
629 0.13
630 0.14
631 0.13
632 0.15
633 0.14
634 0.15
635 0.14
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.15
640 0.12
641 0.13
642 0.12
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.08
648 0.09
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.06
662 0.07
663 0.07
664 0.09
665 0.12
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.11
671 0.1
672 0.08
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.07
681 0.06
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.06
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.08
703 0.09
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.08
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.07
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.06
717 0.07
718 0.07
719 0.09
720 0.12
721 0.12
722 0.14
723 0.15
724 0.14
725 0.15
726 0.15
727 0.14
728 0.11
729 0.1
730 0.07
731 0.07
732 0.09
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.07
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.08
753 0.08
754 0.04
755 0.08
756 0.09
757 0.09
758 0.11
759 0.12
760 0.14
761 0.16
762 0.17
763 0.15
764 0.16
765 0.16
766 0.17
767 0.18
768 0.15
769 0.14
770 0.13
771 0.11
772 0.09
773 0.09
774 0.07
775 0.05
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.1
782 0.16
783 0.19
784 0.19
785 0.23
786 0.24
787 0.25
788 0.25
789 0.22
790 0.21
791 0.19
792 0.2
793 0.16
794 0.15
795 0.14
796 0.13
797 0.13
798 0.07
799 0.07
800 0.1
801 0.13
802 0.17
803 0.24
804 0.31
805 0.35
806 0.36
807 0.4
808 0.4
809 0.4
810 0.35
811 0.28
812 0.25
813 0.23
814 0.24
815 0.2
816 0.18
817 0.15
818 0.17
819 0.19
820 0.16
821 0.15
822 0.15
823 0.14
824 0.14
825 0.14
826 0.12
827 0.11
828 0.1
829 0.09
830 0.06
831 0.06
832 0.04
833 0.04
834 0.04
835 0.05
836 0.05
837 0.05
838 0.06
839 0.06
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.08
844 0.08
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.1
849 0.11
850 0.12
851 0.14
852 0.17
853 0.15
854 0.14
855 0.15
856 0.14
857 0.13
858 0.12
859 0.09
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.05
868 0.05
869 0.06
870 0.07
871 0.06
872 0.07
873 0.06
874 0.07
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.09
880 0.08
881 0.09
882 0.1
883 0.1
884 0.11
885 0.12
886 0.14
887 0.14
888 0.14
889 0.14
890 0.12
891 0.1
892 0.1
893 0.09
894 0.07
895 0.08
896 0.08
897 0.08
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.11
902 0.11
903 0.11
904 0.12
905 0.11
906 0.11
907 0.11
908 0.1
909 0.1
910 0.1
911 0.1
912 0.08
913 0.08
914 0.09
915 0.09
916 0.09
917 0.06
918 0.1
919 0.14
920 0.14
921 0.16
922 0.17
923 0.17
924 0.18
925 0.19
926 0.19
927 0.17
928 0.21
929 0.22
930 0.23
931 0.24
932 0.23
933 0.22
934 0.19
935 0.17
936 0.12
937 0.09
938 0.07
939 0.08
940 0.07
941 0.08
942 0.11
943 0.12
944 0.13
945 0.13
946 0.14
947 0.15
948 0.16
949 0.15
950 0.14
951 0.14
952 0.13
953 0.14
954 0.15
955 0.14
956 0.15
957 0.16
958 0.17
959 0.19
960 0.29
961 0.37
962 0.41
963 0.5
964 0.58
965 0.63
966 0.7
967 0.76
968 0.74
969 0.68
970 0.65
971 0.61
972 0.61
973 0.57
974 0.51
975 0.46
976 0.38
977 0.37
978 0.34
979 0.28
980 0.24
981 0.27
982 0.32
983 0.31
984 0.35
985 0.36
986 0.39
987 0.39
988 0.35
989 0.3
990 0.23
991 0.23
992 0.19
993 0.17
994 0.14
995 0.13
996 0.16
997 0.17
998 0.16
999 0.14
1000 0.14
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.12
1004 0.09
1005 0.07
1006 0.07
1007 0.08
1008 0.12
1009 0.13
1010 0.14
1011 0.18
1012 0.2
1013 0.21
1014 0.24
1015 0.24
1016 0.23
1017 0.22
1018 0.22
1019 0.19
1020 0.16
1021 0.15
1022 0.12
1023 0.12
1024 0.11
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.14
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.16
1032 0.16
1033 0.15
1034 0.18
1035 0.19
1036 0.21
1037 0.19
1038 0.2
1039 0.19
1040 0.17
1041 0.18
1042 0.15
1043 0.15
1044 0.15
1045 0.18
1046 0.16
1047 0.17
1048 0.17
1049 0.17
1050 0.19
1051 0.18
1052 0.17
1053 0.14
1054 0.16
1055 0.16
1056 0.21
1057 0.27
1058 0.28
1059 0.3
1060 0.31
1061 0.32
1062 0.31
1063 0.3
1064 0.24
1065 0.16
1066 0.11
1067 0.08
1068 0.07
1069 0.05
1070 0.05
1071 0.04
1072 0.04
1073 0.04
1074 0.04
1075 0.06
1076 0.06
1077 0.1
1078 0.1
1079 0.11
1080 0.13
1081 0.13
1082 0.15
1083 0.13
1084 0.13
1085 0.1
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.11
1089 0.1
1090 0.1
1091 0.1
1092 0.1
1093 0.1
1094 0.09
1095 0.08
1096 0.07
1097 0.08
1098 0.07
1099 0.08
1100 0.09
1101 0.1
1102 0.11
1103 0.14
1104 0.18
1105 0.17
1106 0.17
1107 0.16
1108 0.19
1109 0.23
1110 0.23
1111 0.22
1112 0.19
1113 0.2
1114 0.19
1115 0.2
1116 0.17
1117 0.14
1118 0.16
1119 0.13
1120 0.17
1121 0.19
1122 0.2
1123 0.19
1124 0.2
1125 0.19
1126 0.18
1127 0.23
1128 0.23
1129 0.25
1130 0.26
1131 0.28
1132 0.35
1133 0.35
1134 0.36
1135 0.32
1136 0.28
1137 0.34
1138 0.37
1139 0.45
1140 0.48
1141 0.5
1142 0.58
1143 0.66
1144 0.73
1145 0.74
1146 0.77
1147 0.76
1148 0.73
1149 0.75
1150 0.7
1151 0.68
1152 0.67
1153 0.57
1154 0.5
1155 0.43
1156 0.35
1157 0.28
1158 0.23
1159 0.18
1160 0.14
1161 0.14
1162 0.14
1163 0.16
1164 0.16
1165 0.17
1166 0.18
1167 0.21
1168 0.24
1169 0.25
1170 0.25
1171 0.26
1172 0.33
1173 0.36
1174 0.37
1175 0.36
1176 0.37
1177 0.41
1178 0.49
1179 0.47
1180 0.43
1181 0.4
1182 0.38
1183 0.33
1184 0.28
1185 0.29
1186 0.25
1187 0.24
1188 0.26
1189 0.3
1190 0.3
1191 0.34
1192 0.33
1193 0.29
1194 0.25
1195 0.23
1196 0.21
1197 0.25
1198 0.28
1199 0.25
1200 0.25
1201 0.24
1202 0.25
1203 0.25
1204 0.23
1205 0.15
1206 0.14
1207 0.16
1208 0.17
1209 0.19
1210 0.18
1211 0.22
1212 0.26
1213 0.25
1214 0.24
1215 0.22
1216 0.23
1217 0.21
1218 0.22
1219 0.18
1220 0.17
1221 0.16
1222 0.15
1223 0.13
1224 0.13
1225 0.13
1226 0.12
1227 0.15
1228 0.16
1229 0.25
1230 0.35
1231 0.38
1232 0.39
1233 0.4
1234 0.42
1235 0.39
1236 0.42
1237 0.39
1238 0.34
1239 0.39
1240 0.43
1241 0.44
1242 0.43
1243 0.44
1244 0.38
1245 0.33
1246 0.3
1247 0.22
1248 0.19
1249 0.15
1250 0.15
1251 0.13
1252 0.13
1253 0.11
1254 0.12
1255 0.12
1256 0.09
1257 0.1
1258 0.12
1259 0.12
1260 0.15
1261 0.2
1262 0.2
1263 0.21
1264 0.22
1265 0.23
1266 0.25
1267 0.25
1268 0.22
1269 0.19
1270 0.16
1271 0.16
1272 0.16
1273 0.14
1274 0.11
1275 0.12
1276 0.19
1277 0.19
1278 0.2
1279 0.19
1280 0.2
1281 0.25
1282 0.31
1283 0.34
1284 0.27
1285 0.27
1286 0.35
1287 0.38
1288 0.4
1289 0.43
1290 0.45
1291 0.49
1292 0.54
1293 0.61
1294 0.63
1295 0.61
1296 0.61
1297 0.62
1298 0.59
1299 0.51
1300 0.55
1301 0.55
1302 0.47
1303 0.47
1304 0.45
1305 0.36
1306 0.38
1307 0.42
1308 0.39
1309 0.38
1310 0.43
1311 0.44
1312 0.48
1313 0.49
1314 0.45
1315 0.42
1316 0.37
1317 0.35