FuNGI

A0A5N6SZW7

Protein Details

Accession

A0A5N6SZW7

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
121-141	GQPEEEKKKKEKKTDIAQEGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
128-130	KKK
301-301	K
303-305	LRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSSIPDKRKQPSSLTGGTPYAKRSRPSYAEKEDEDEMAPTVAPYERPRNNPIYGQKSAFPGLDIAGDDELFYGPAEDGMEYLRMVRSEANSLPFLFTAPQPTDPPVEETKQSEAEQDSTEGQPEEEKKKKEKKTDIAQEGFYVDGVYVAAPSTTPKKQPDTTEPAQSDAQSSYYNLLHHRFLLLRSILKCTPPSTAIAALDESHPISLPRRSRDARKEWRRLLLVADPQTVQLACMDMDSVLGVLEVMAKLMSENIRSGDAERVRRIGAWAWGLLGKCRDVGQLASEEVGDIRDLGKRAAKILRKMREEDEKKRSAGTDGNLSSGESDDEHPADDQPRAEEETKENTEAPSDPPCESLDHDMPDVEQEPPAEDLEMAKARLQARIEQGDESKSTEPEAQEGESKTEDNAAEVAMQTRAMLDMIITVVGEYYGQRDLLLAREPWNESTTWF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.57
3	0.53
4	0.51
5	0.46
6	0.43
7	0.44
8	0.42
9	0.42
10	0.43
11	0.48
12	0.52
13	0.59
14	0.63
15	0.64
16	0.66
17	0.64
18	0.64
19	0.56
20	0.5
21	0.41
22	0.32
23	0.24
24	0.18
25	0.15
26	0.11
27	0.11
28	0.1
29	0.13
30	0.18
31	0.27
32	0.33
33	0.39
34	0.45
35	0.5
36	0.52
37	0.57
38	0.61
39	0.59
40	0.57
41	0.54
42	0.5
43	0.48
44	0.47
45	0.39
46	0.3
47	0.23
48	0.18
49	0.17
50	0.15
51	0.12
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.07
58	0.07
59	0.06
60	0.05
61	0.06
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.08
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.1
72	0.12
73	0.13
74	0.17
75	0.19
76	0.22
77	0.22
78	0.22
79	0.22
80	0.2
81	0.19
82	0.16
83	0.14
84	0.16
85	0.17
86	0.19
87	0.2
88	0.22
89	0.24
90	0.23
91	0.27
92	0.25
93	0.26
94	0.25
95	0.26
96	0.28
97	0.29
98	0.28
99	0.26
100	0.24
101	0.23
102	0.22
103	0.21
104	0.2
105	0.17
106	0.18
107	0.15
108	0.13
109	0.15
110	0.19
111	0.26
112	0.31
113	0.36
114	0.44
115	0.53
116	0.61
117	0.67
118	0.73
119	0.74
120	0.77
121	0.83
122	0.82
123	0.76
124	0.69
125	0.59
126	0.5
127	0.4
128	0.29
129	0.18
130	0.09
131	0.06
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.05
139	0.1
140	0.13
141	0.18
142	0.22
143	0.28
144	0.32
145	0.37
146	0.44
147	0.48
148	0.48
149	0.52
150	0.48
151	0.46
152	0.42
153	0.37
154	0.3
155	0.22
156	0.2
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.14
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.17
170	0.16
171	0.18
172	0.19
173	0.23
174	0.22
175	0.23
176	0.24
177	0.21
178	0.21
179	0.18
180	0.19
181	0.16
182	0.16
183	0.15
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.08
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.08
194	0.13
195	0.16
196	0.19
197	0.26
198	0.29
199	0.37
200	0.45
201	0.54
202	0.6
203	0.66
204	0.72
205	0.69
206	0.71
207	0.65
208	0.57
209	0.49
210	0.42
211	0.37
212	0.3
213	0.27
214	0.22
215	0.2
216	0.2
217	0.17
218	0.12
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.15
247	0.19
248	0.22
249	0.23
250	0.23
251	0.23
252	0.23
253	0.23
254	0.18
255	0.16
256	0.14
257	0.13
258	0.12
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.13
263	0.11
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.06
278	0.04
279	0.05
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.12
284	0.12
285	0.16
286	0.23
287	0.28
288	0.34
289	0.43
290	0.5
291	0.51
292	0.54
293	0.55
294	0.59
295	0.61
296	0.62
297	0.62
298	0.58
299	0.55
300	0.53
301	0.49
302	0.41
303	0.37
304	0.3
305	0.3
306	0.26
307	0.27
308	0.25
309	0.24
310	0.22
311	0.18
312	0.16
313	0.09
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.13
320	0.14
321	0.15
322	0.14
323	0.13
324	0.15
325	0.19
326	0.2
327	0.2
328	0.22
329	0.28
330	0.3
331	0.3
332	0.29
333	0.25
334	0.25
335	0.24
336	0.23
337	0.22
338	0.21
339	0.2
340	0.21
341	0.22
342	0.21
343	0.22
344	0.27
345	0.24
346	0.24
347	0.24
348	0.23
349	0.22
350	0.22
351	0.21
352	0.15
353	0.12
354	0.11
355	0.12
356	0.13
357	0.13
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.14
362	0.16
363	0.15
364	0.16
365	0.2
366	0.21
367	0.25
368	0.26
369	0.26
370	0.3
371	0.35
372	0.34
373	0.33
374	0.34
375	0.33
376	0.32
377	0.31
378	0.27
379	0.22
380	0.23
381	0.23
382	0.22
383	0.21
384	0.23
385	0.2
386	0.23
387	0.24
388	0.25
389	0.23
390	0.23
391	0.2
392	0.23
393	0.21
394	0.17
395	0.16
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.1
401	0.1
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.11
423	0.14
424	0.19
425	0.18
426	0.21
427	0.26
428	0.29
429	0.3
430	0.31

A0A5N6SZW7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer