Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SYC0

Protein Details
Accession A0A5N6SYC0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
527-555DQPEKLSKSAARNKKKREAKKLKDGEDGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
533-573SKSAARNKKKREAKKLKDGEDGQPARGPESHADKGHHERSR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_mito 10.5, mito 8.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MAAPTQIAFRTVKGIGILDAAPVYEPLSGFERPEGNLRCSAYSPCGRYFAWASPEKVTIIDPSVGHIITNIPADNVFELGFSPLGTYLITWQRPAKDANGDAVKNLKVWKIVETTPDSNGDEHTIVGSYVQKSQTGWNLQYTSDERYCARVVTNEVQFYQSDNLFKVWNKLRVEGVIDFAVSPGKSQSVAVFVPERKGQPAAVKVFMVPQFGAPVSQKTFFKGDKVQLKWNASGTTLLVLAQTDVDRTGKSYYGETTLYLLGATGGFDSRVDLDKEGPIHDVTWSPNSREFGVVYGYMPAKTTIFNFRGVPQHSFPLAPRNTISFSPHGRFVLVAGFGNLAGQMDIYDLEKNYFKIATVEASNASVCEWSPDGKYILTATTSPRLRVDNGVRLWHVSGALVYNEDMNELYDVFWRPQSTTQHPLGDPFHPLPTPHPSAVAYLSTRKAPVKPAGAYRPPGARGQLTPLAFKREDQGGATFVRDGANGGALNGLGKPRRREVPGADPAEEYLPPGAAPGGGVALPPGADQPEKLSKSAARNKKKREAKKLKDGEDGQPARGPESHADKGHHERSRSKANNSERKNANQANGASPASTKPNNNTAAEAAGAPTAQEKKIRGLLKKIRAIDELKMRLAGGEKLEDTQLKKIQTEESVRKELESLGFNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.18
4 0.17
5 0.13
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.3
21 0.32
22 0.31
23 0.36
24 0.37
25 0.36
26 0.36
27 0.37
28 0.36
29 0.39
30 0.4
31 0.37
32 0.39
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.39
38 0.4
39 0.4
40 0.39
41 0.41
42 0.37
43 0.34
44 0.29
45 0.23
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.15
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.11
75 0.19
76 0.2
77 0.22
78 0.26
79 0.28
80 0.31
81 0.33
82 0.32
83 0.32
84 0.32
85 0.37
86 0.4
87 0.37
88 0.36
89 0.38
90 0.34
91 0.29
92 0.3
93 0.24
94 0.21
95 0.22
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.3
100 0.35
101 0.35
102 0.33
103 0.36
104 0.33
105 0.29
106 0.28
107 0.25
108 0.18
109 0.16
110 0.14
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.12
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.22
121 0.28
122 0.29
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.34
128 0.33
129 0.32
130 0.28
131 0.28
132 0.23
133 0.26
134 0.27
135 0.23
136 0.22
137 0.18
138 0.23
139 0.28
140 0.31
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.2
148 0.17
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.24
154 0.28
155 0.33
156 0.33
157 0.34
158 0.35
159 0.34
160 0.37
161 0.29
162 0.25
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.13
178 0.17
179 0.17
180 0.2
181 0.22
182 0.22
183 0.2
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.27
188 0.27
189 0.26
190 0.25
191 0.24
192 0.28
193 0.27
194 0.23
195 0.17
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.15
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.24
207 0.23
208 0.26
209 0.28
210 0.33
211 0.38
212 0.41
213 0.46
214 0.48
215 0.5
216 0.48
217 0.45
218 0.39
219 0.31
220 0.28
221 0.2
222 0.15
223 0.12
224 0.1
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.2
277 0.19
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.14
291 0.15
292 0.17
293 0.17
294 0.19
295 0.25
296 0.27
297 0.28
298 0.23
299 0.24
300 0.23
301 0.23
302 0.21
303 0.24
304 0.22
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.17
312 0.2
313 0.2
314 0.21
315 0.2
316 0.18
317 0.17
318 0.14
319 0.13
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.18
371 0.19
372 0.2
373 0.25
374 0.27
375 0.28
376 0.29
377 0.31
378 0.29
379 0.28
380 0.27
381 0.22
382 0.17
383 0.1
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.07
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.18
404 0.23
405 0.27
406 0.32
407 0.34
408 0.37
409 0.36
410 0.38
411 0.35
412 0.3
413 0.29
414 0.24
415 0.22
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.23
420 0.26
421 0.22
422 0.23
423 0.21
424 0.22
425 0.23
426 0.22
427 0.17
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.23
435 0.27
436 0.29
437 0.31
438 0.36
439 0.42
440 0.44
441 0.45
442 0.43
443 0.41
444 0.37
445 0.36
446 0.32
447 0.26
448 0.22
449 0.26
450 0.28
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.31
455 0.29
456 0.29
457 0.26
458 0.24
459 0.24
460 0.22
461 0.22
462 0.18
463 0.18
464 0.18
465 0.15
466 0.12
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.07
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.1
479 0.12
480 0.17
481 0.2
482 0.25
483 0.31
484 0.34
485 0.39
486 0.42
487 0.48
488 0.53
489 0.53
490 0.5
491 0.44
492 0.41
493 0.38
494 0.31
495 0.22
496 0.13
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.05
505 0.04
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.13
516 0.22
517 0.23
518 0.24
519 0.26
520 0.29
521 0.39
522 0.49
523 0.54
524 0.56
525 0.64
526 0.73
527 0.81
528 0.86
529 0.86
530 0.88
531 0.89
532 0.88
533 0.9
534 0.9
535 0.85
536 0.84
537 0.78
538 0.72
539 0.71
540 0.63
541 0.53
542 0.47
543 0.41
544 0.34
545 0.32
546 0.28
547 0.23
548 0.29
549 0.33
550 0.33
551 0.36
552 0.39
553 0.47
554 0.53
555 0.53
556 0.49
557 0.5
558 0.54
559 0.63
560 0.63
561 0.61
562 0.61
563 0.67
564 0.73
565 0.73
566 0.76
567 0.71
568 0.7
569 0.73
570 0.69
571 0.62
572 0.59
573 0.55
574 0.49
575 0.47
576 0.41
577 0.31
578 0.28
579 0.26
580 0.26
581 0.28
582 0.27
583 0.29
584 0.36
585 0.41
586 0.41
587 0.41
588 0.36
589 0.33
590 0.3
591 0.25
592 0.18
593 0.13
594 0.11
595 0.09
596 0.12
597 0.14
598 0.16
599 0.2
600 0.21
601 0.26
602 0.34
603 0.41
604 0.42
605 0.5
606 0.58
607 0.63
608 0.69
609 0.68
610 0.65
611 0.63
612 0.61
613 0.57
614 0.57
615 0.52
616 0.46
617 0.42
618 0.37
619 0.34
620 0.33
621 0.29
622 0.21
623 0.21
624 0.2
625 0.21
626 0.24
627 0.27
628 0.27
629 0.31
630 0.33
631 0.32
632 0.33
633 0.34
634 0.35
635 0.39
636 0.46
637 0.48
638 0.51
639 0.55
640 0.54
641 0.52
642 0.48
643 0.44
644 0.39