Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDD7

Protein Details
Accession C5MDD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
447-469FGGNLRYHHHHHNHNHRSRKANSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
465-478RKANSLARKEKMPR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013320  ConA-like_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_04238  -  
Amino Acid Sequences MSLGISREEQELKVLDLMYQNFPSLSIDQDILVNWQVELSDKLTDFTSLSSIVSDNIIIDADMIEFDYVPDIANIINELEDAFDDDDDFKVIILEILICLISLSYRIKNVLHPVSDQLIDLFLKKLKSRNDFAIQEIQTPSVVSQYMRLIILFMDIGCNNKQFKLLINQLMCNKNPKTNLVLLELFHQMYTKYQCQFPLLSVVNQTNYSFNKDSSLKKVFTIHSWLKINHQFHSSKEDPITLFTLSSSGSTNDDANNGTLLKVQIINYNQFKIEIKNNINGSRIRYSFNQKLQDTNKNQGFIHFVLTYDNYATLNLYIDGEYSESIPCPDLHKFLRNWNKISVGETKDDITLKSDEIALRNLTILNTNLSYEWINLLYNLGLGFSWDTKDLTSETTFSLLSQLSYQGLFNVTVKFDEIKEKNKAHNNSNSHIFGAGHSSSRNSLAAFGGNLRYHHHHHNHNHRSRKANSLARKEKMPRIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.21
4 0.24
5 0.25
6 0.24
7 0.23
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.18
12 0.18
13 0.16
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.16
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.16
95 0.2
96 0.27
97 0.3
98 0.29
99 0.28
100 0.3
101 0.3
102 0.3
103 0.26
104 0.18
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.14
111 0.17
112 0.23
113 0.29
114 0.35
115 0.38
116 0.44
117 0.49
118 0.48
119 0.49
120 0.52
121 0.45
122 0.42
123 0.38
124 0.32
125 0.24
126 0.22
127 0.19
128 0.11
129 0.12
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.13
150 0.16
151 0.21
152 0.26
153 0.3
154 0.3
155 0.33
156 0.38
157 0.41
158 0.39
159 0.38
160 0.34
161 0.33
162 0.33
163 0.32
164 0.3
165 0.3
166 0.32
167 0.29
168 0.28
169 0.24
170 0.25
171 0.24
172 0.2
173 0.16
174 0.14
175 0.1
176 0.12
177 0.16
178 0.18
179 0.18
180 0.2
181 0.21
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.23
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.19
196 0.18
197 0.17
198 0.2
199 0.23
200 0.25
201 0.28
202 0.32
203 0.28
204 0.28
205 0.32
206 0.29
207 0.28
208 0.33
209 0.28
210 0.29
211 0.31
212 0.3
213 0.32
214 0.38
215 0.37
216 0.31
217 0.34
218 0.3
219 0.28
220 0.36
221 0.31
222 0.27
223 0.26
224 0.26
225 0.21
226 0.21
227 0.22
228 0.13
229 0.12
230 0.09
231 0.09
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.12
252 0.13
253 0.18
254 0.18
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.21
261 0.23
262 0.24
263 0.29
264 0.31
265 0.32
266 0.34
267 0.33
268 0.32
269 0.3
270 0.29
271 0.27
272 0.28
273 0.34
274 0.38
275 0.43
276 0.46
277 0.41
278 0.47
279 0.5
280 0.56
281 0.53
282 0.54
283 0.5
284 0.45
285 0.44
286 0.39
287 0.37
288 0.28
289 0.27
290 0.19
291 0.16
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.11
296 0.11
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.19
319 0.25
320 0.27
321 0.36
322 0.46
323 0.48
324 0.49
325 0.48
326 0.49
327 0.44
328 0.45
329 0.43
330 0.35
331 0.32
332 0.3
333 0.28
334 0.26
335 0.26
336 0.22
337 0.18
338 0.16
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.15
344 0.18
345 0.15
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.11
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.11
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.15
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.24
404 0.26
405 0.32
406 0.4
407 0.44
408 0.51
409 0.59
410 0.64
411 0.62
412 0.68
413 0.67
414 0.64
415 0.66
416 0.59
417 0.5
418 0.46
419 0.38
420 0.29
421 0.28
422 0.24
423 0.18
424 0.18
425 0.19
426 0.19
427 0.21
428 0.21
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.17
433 0.16
434 0.17
435 0.21
436 0.22
437 0.22
438 0.26
439 0.29
440 0.32
441 0.41
442 0.46
443 0.51
444 0.59
445 0.7
446 0.76
447 0.8
448 0.86
449 0.83
450 0.84
451 0.78
452 0.78
453 0.76
454 0.75
455 0.75
456 0.77
457 0.79
458 0.75
459 0.8
460 0.77