Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5MDC1

Protein Details
Accession C5MDC1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-42RHSHITFGKRHKKDRDIIKELBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 8, E.R. 7, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3, nucl 2, mito 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_04222  -  
Amino Acid Sequences MSLFKPTLAVALLSADLNYKLRHSHITFGKRHKKDRDIIKELTPKAWSFSIKETNQNFMLFVISIIMILSLEIIFVPSKRLTLILPILITGLLSALQIVDLEYSSLPANPESILKIERVLLKHATIRNGILDANYSTKRVDVNFREVVDDGLHIKARDLLLDEGIQIIAVGECQFKTGSKKIHEKLYPIVNLQLPGNINRTYIGLSPCSYISLLSDINELIRLKDHSPTGHSQWLTYSLNENTGVWKRDWVKSEEDSHSGPNVLNNWWKHISDKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.25
10 0.26
11 0.33
12 0.4
13 0.49
14 0.56
15 0.64
16 0.73
17 0.72
18 0.79
19 0.8
20 0.8
21 0.79
22 0.82
23 0.81
24 0.78
25 0.74
26 0.74
27 0.73
28 0.66
29 0.61
30 0.52
31 0.42
32 0.38
33 0.38
34 0.31
35 0.25
36 0.31
37 0.37
38 0.36
39 0.45
40 0.43
41 0.45
42 0.44
43 0.42
44 0.35
45 0.26
46 0.24
47 0.15
48 0.13
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.13
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.07
78 0.05
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.11
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.18
128 0.17
129 0.23
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.25
134 0.24
135 0.18
136 0.15
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.12
164 0.17
165 0.23
166 0.29
167 0.38
168 0.41
169 0.5
170 0.51
171 0.49
172 0.49
173 0.5
174 0.45
175 0.37
176 0.37
177 0.29
178 0.28
179 0.25
180 0.22
181 0.16
182 0.16
183 0.19
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.15
211 0.19
212 0.22
213 0.2
214 0.25
215 0.3
216 0.32
217 0.37
218 0.36
219 0.32
220 0.31
221 0.35
222 0.32
223 0.28
224 0.28
225 0.21
226 0.24
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.28
231 0.29
232 0.25
233 0.31
234 0.33
235 0.39
236 0.43
237 0.41
238 0.41
239 0.43
240 0.5
241 0.47
242 0.47
243 0.42
244 0.4
245 0.38
246 0.33
247 0.28
248 0.25
249 0.22
250 0.23
251 0.29
252 0.27
253 0.32
254 0.35
255 0.36