FuNGI

A0A5N6SR94

Protein Details

Accession

A0A5N6SR94

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPSGKVEKKRKRASNGHERPSKKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-23	VEKKRKRASNGHERPSKK
466-495	KGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSGKVEKKRKRASNGHERPSKKPALEFQDLPPLAASVVNDDSELAPVIITTPGVNVPQNLHLKPYLKDRADGSHSGRSTRNKGIVSSELLLQTSEHPKMDFVGREAEDDADSQLKHYIAVVDPEKKSWQFVEVRKVTLRGAVRRTKAAEDEEEEVESEDEEMKTMRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSNAPAGAASAAESAILSSMPLDSVTDIATKTAAVQAQVQANKPLPQANLAASHPSDVYPIDVLVPGGLSTLQQLPGMNEWQETVNSGEAVATTSRYVSRRVEAVVNSTNATQLQVLRFIFLLLELARALRSGKDSKSSGPGSKRLPPRDELRRILSSSTGAKTDSAELLPDPVIDAIRRKFAPQGSHITKNDITFLHTTICALSLHIPPQPAKDGGSSSQGGNAPNELATDPSDLRDDLRLDNTVITQYFRELGCRVDKPRETEFAKWGIKGGKAEANARRVARLRVPVEFPKVSRGGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.9
3	0.89
4	0.88
5	0.83
6	0.79
7	0.78
8	0.75
9	0.66
10	0.62
11	0.6
12	0.6
13	0.63
14	0.59
15	0.53
16	0.57
17	0.53
18	0.47
19	0.39
20	0.3
21	0.24
22	0.22
23	0.18
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.13
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.07
37	0.07
38	0.06
39	0.07
40	0.09
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.15
45	0.22
46	0.28
47	0.27
48	0.29
49	0.32
50	0.34
51	0.36
52	0.43
53	0.45
54	0.4
55	0.42
56	0.42
57	0.44
58	0.47
59	0.49
60	0.45
61	0.43
62	0.43
63	0.43
64	0.47
65	0.47
66	0.47
67	0.49
68	0.5
69	0.43
70	0.44
71	0.45
72	0.43
73	0.4
74	0.35
75	0.31
76	0.25
77	0.24
78	0.22
79	0.18
80	0.19
81	0.21
82	0.21
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.21
87	0.25
88	0.22
89	0.18
90	0.23
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.23
95	0.19
96	0.18
97	0.17
98	0.13
99	0.12
100	0.12
101	0.13
102	0.12
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.11
107	0.17
108	0.2
109	0.24
110	0.25
111	0.27
112	0.3
113	0.28
114	0.29
115	0.24
116	0.27
117	0.28
118	0.32
119	0.41
120	0.4
121	0.43
122	0.43
123	0.43
124	0.37
125	0.35
126	0.35
127	0.31
128	0.36
129	0.4
130	0.41
131	0.44
132	0.46
133	0.43
134	0.41
135	0.38
136	0.32
137	0.28
138	0.29
139	0.26
140	0.23
141	0.21
142	0.18
143	0.15
144	0.12
145	0.1
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.09
152	0.14
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.2
157	0.27
158	0.32
159	0.31
160	0.3
161	0.29
162	0.28
163	0.29
164	0.32
165	0.29
166	0.26
167	0.3
168	0.31
169	0.36
170	0.36
171	0.37
172	0.36
173	0.36
174	0.37
175	0.37
176	0.33
177	0.3
178	0.28
179	0.25
180	0.22
181	0.18
182	0.15
183	0.1
184	0.08
185	0.05
186	0.04
187	0.05
188	0.04
189	0.03
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.1
218	0.14
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.17
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.15
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.12
234	0.13
235	0.11
236	0.1
237	0.09
238	0.07
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.05
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.09
277	0.1
278	0.13
279	0.13
280	0.15
281	0.16
282	0.18
283	0.2
284	0.18
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.2
289	0.19
290	0.18
291	0.14
292	0.14
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.05
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.11
313	0.14
314	0.15
315	0.21
316	0.22
317	0.24
318	0.31
319	0.33
320	0.35
321	0.36
322	0.41
323	0.39
324	0.46
325	0.52
326	0.52
327	0.52
328	0.51
329	0.55
330	0.59
331	0.62
332	0.59
333	0.57
334	0.54
335	0.51
336	0.48
337	0.41
338	0.33
339	0.29
340	0.26
341	0.21
342	0.17
343	0.17
344	0.17
345	0.17
346	0.16
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.12
351	0.11
352	0.1
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.13
358	0.13
359	0.19
360	0.2
361	0.2
362	0.25
363	0.29
364	0.33
365	0.33
366	0.42
367	0.43
368	0.51
369	0.5
370	0.51
371	0.49
372	0.44
373	0.42
374	0.32
375	0.29
376	0.22
377	0.23
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.14
382	0.14
383	0.11
384	0.1
385	0.13
386	0.13
387	0.16
388	0.17
389	0.2
390	0.2
391	0.23
392	0.26
393	0.23
394	0.22
395	0.22
396	0.23
397	0.23
398	0.27
399	0.25
400	0.21
401	0.25
402	0.26
403	0.25
404	0.22
405	0.21
406	0.17
407	0.16
408	0.17
409	0.12
410	0.11
411	0.11
412	0.14
413	0.13
414	0.14
415	0.16
416	0.15
417	0.16
418	0.19
419	0.19
420	0.19
421	0.21
422	0.22
423	0.21
424	0.22
425	0.21
426	0.2
427	0.19
428	0.18
429	0.16
430	0.15
431	0.18
432	0.17
433	0.19
434	0.17
435	0.2
436	0.26
437	0.32
438	0.35
439	0.42
440	0.46
441	0.49
442	0.54
443	0.58
444	0.55
445	0.54
446	0.54
447	0.53
448	0.52
449	0.46
450	0.45
451	0.41
452	0.4
453	0.38
454	0.37
455	0.33
456	0.33
457	0.41
458	0.43
459	0.44
460	0.46
461	0.45
462	0.47
463	0.45
464	0.48
465	0.47
466	0.5
467	0.48
468	0.48
469	0.54
470	0.54
471	0.58
472	0.57
473	0.51
474	0.49
475	0.52

A0A5N6SR94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer