Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6SJP1

Protein Details
Accession A0A5N6SJP1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-369LPFARKAQTTIKKPNEQQNNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, cyto 7.5, cyto_mito 5.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MSSELGLSPGVLRIPRTDDPESYVLVHITRTSSSLVDLNITATEGENPYIGTVRKSHLRDFRSKNYEGNDEEWAEIVSHVFGQLDESAAKVKLCGIESSASVIGASDSEDKELVITIRKRIQTITQRLGSVTLRQDDQQAIQLFDWAGIAAVRSYTLEQRFASLLVRYHSAENTIRQLNKQLEEFISAKTQHEEQLIVNFVQLLNEKKLKIRNQQRLLASAKVDREKVSWIQNATSDQHIRPHKNIRAAKRTAAEMSDGEAESEEEFETMEFNQTMHPIDFEEANETTDERSSTPQPLEEWGENATDEGSPAPSDLIGGEDEMHMFEQRCPAGPPVMKESPAPPPRRELPFARKAQTTIKKPNEQQNNTEDTTGETDDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.33
4 0.35
5 0.34
6 0.39
7 0.39
8 0.38
9 0.33
10 0.3
11 0.24
12 0.21
13 0.2
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.17
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.09
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.13
37 0.14
38 0.13
39 0.15
40 0.19
41 0.27
42 0.3
43 0.37
44 0.43
45 0.49
46 0.57
47 0.62
48 0.68
49 0.68
50 0.67
51 0.63
52 0.6
53 0.59
54 0.52
55 0.46
56 0.4
57 0.33
58 0.31
59 0.27
60 0.22
61 0.16
62 0.13
63 0.11
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.18
86 0.16
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.09
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.13
102 0.15
103 0.19
104 0.25
105 0.27
106 0.27
107 0.28
108 0.36
109 0.39
110 0.45
111 0.48
112 0.45
113 0.44
114 0.43
115 0.44
116 0.37
117 0.31
118 0.26
119 0.21
120 0.19
121 0.19
122 0.2
123 0.19
124 0.19
125 0.21
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.05
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.13
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.18
161 0.2
162 0.2
163 0.19
164 0.25
165 0.24
166 0.24
167 0.23
168 0.2
169 0.17
170 0.2
171 0.21
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.14
193 0.14
194 0.18
195 0.24
196 0.3
197 0.38
198 0.46
199 0.53
200 0.57
201 0.63
202 0.61
203 0.59
204 0.56
205 0.48
206 0.4
207 0.32
208 0.3
209 0.26
210 0.26
211 0.22
212 0.2
213 0.21
214 0.23
215 0.26
216 0.25
217 0.23
218 0.23
219 0.24
220 0.26
221 0.24
222 0.25
223 0.22
224 0.19
225 0.26
226 0.31
227 0.33
228 0.36
229 0.43
230 0.44
231 0.51
232 0.57
233 0.58
234 0.61
235 0.6
236 0.6
237 0.52
238 0.5
239 0.42
240 0.36
241 0.29
242 0.2
243 0.19
244 0.17
245 0.15
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.14
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.14
279 0.15
280 0.19
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.24
285 0.27
286 0.24
287 0.23
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.14
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.16
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.22
319 0.27
320 0.29
321 0.32
322 0.35
323 0.37
324 0.37
325 0.36
326 0.37
327 0.4
328 0.46
329 0.48
330 0.42
331 0.46
332 0.52
333 0.57
334 0.6
335 0.59
336 0.6
337 0.64
338 0.69
339 0.67
340 0.62
341 0.59
342 0.63
343 0.64
344 0.63
345 0.64
346 0.67
347 0.71
348 0.76
349 0.82
350 0.83
351 0.78
352 0.76
353 0.72
354 0.69
355 0.62
356 0.55
357 0.45
358 0.38
359 0.36
360 0.31
361 0.24