Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHM8

Protein Details
Accession C5MHM8    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-69GKPSATKTEHRRPTPNRPIDPVVARLKEKRRLEREEKERAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-85HRRPTPNRPIDPVVARLKEKRRLEREEKERAERERKGLKPVQKKSTAN
306-320REKRLQALKKKRLGR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG ctp:CTRG_05571  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MGLSSILSRIEKKGKVESAKPVTPSTNNGKPSATKTEHRRPTPNRPIDPVVARLKEKRRLEREEKERAERERKGLKPVQKKSTANKSTTGRSAPRQKQQVTSQQNRAAASQALPPRPAPKKQLNYAELMKKASAINTEKLSINLLNKSKSPEAEQQRKSASPVPPKPTPHKPTGTSVKPVKKQTSVPAPRPPKLVVRTPLPTRQPSNKIKERLEQKKMAKSVHERDDYDDDDDLDSFVEDDEEEEDDYNDNHRSEIWAMFNRGKKRSYYADDYDSDDMEATGAEIFDEEFQSRLDAEMEDRKEMEREKRLQALKKKRLGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.54
3 0.58
4 0.62
5 0.62
6 0.63
7 0.61
8 0.56
9 0.53
10 0.48
11 0.49
12 0.47
13 0.46
14 0.45
15 0.44
16 0.43
17 0.42
18 0.45
19 0.48
20 0.45
21 0.46
22 0.52
23 0.61
24 0.68
25 0.71
26 0.75
27 0.74
28 0.8
29 0.83
30 0.83
31 0.78
32 0.75
33 0.73
34 0.68
35 0.64
36 0.59
37 0.56
38 0.5
39 0.49
40 0.5
41 0.53
42 0.57
43 0.62
44 0.65
45 0.65
46 0.71
47 0.77
48 0.79
49 0.8
50 0.82
51 0.79
52 0.77
53 0.75
54 0.73
55 0.73
56 0.67
57 0.66
58 0.65
59 0.61
60 0.62
61 0.63
62 0.65
63 0.66
64 0.71
65 0.71
66 0.71
67 0.73
68 0.73
69 0.77
70 0.74
71 0.66
72 0.64
73 0.59
74 0.55
75 0.54
76 0.5
77 0.43
78 0.45
79 0.53
80 0.54
81 0.58
82 0.62
83 0.6
84 0.62
85 0.65
86 0.67
87 0.66
88 0.66
89 0.65
90 0.61
91 0.61
92 0.55
93 0.49
94 0.4
95 0.31
96 0.25
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.28
103 0.32
104 0.35
105 0.36
106 0.41
107 0.46
108 0.52
109 0.6
110 0.54
111 0.54
112 0.56
113 0.53
114 0.45
115 0.4
116 0.33
117 0.26
118 0.24
119 0.2
120 0.2
121 0.18
122 0.19
123 0.19
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.17
129 0.16
130 0.18
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.24
138 0.27
139 0.34
140 0.43
141 0.44
142 0.44
143 0.45
144 0.45
145 0.42
146 0.41
147 0.38
148 0.37
149 0.42
150 0.44
151 0.46
152 0.5
153 0.54
154 0.58
155 0.56
156 0.53
157 0.51
158 0.48
159 0.5
160 0.54
161 0.51
162 0.48
163 0.51
164 0.52
165 0.53
166 0.56
167 0.53
168 0.48
169 0.48
170 0.48
171 0.51
172 0.51
173 0.51
174 0.55
175 0.57
176 0.55
177 0.56
178 0.51
179 0.47
180 0.44
181 0.45
182 0.4
183 0.39
184 0.42
185 0.43
186 0.48
187 0.46
188 0.46
189 0.45
190 0.48
191 0.52
192 0.55
193 0.6
194 0.62
195 0.64
196 0.63
197 0.65
198 0.68
199 0.68
200 0.67
201 0.66
202 0.64
203 0.65
204 0.66
205 0.61
206 0.57
207 0.56
208 0.57
209 0.57
210 0.56
211 0.49
212 0.49
213 0.51
214 0.46
215 0.4
216 0.32
217 0.24
218 0.2
219 0.19
220 0.14
221 0.1
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.18
243 0.21
244 0.23
245 0.27
246 0.33
247 0.39
248 0.43
249 0.45
250 0.45
251 0.42
252 0.43
253 0.48
254 0.49
255 0.51
256 0.5
257 0.51
258 0.5
259 0.52
260 0.48
261 0.4
262 0.33
263 0.25
264 0.19
265 0.13
266 0.11
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.13
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.25
288 0.26
289 0.29
290 0.34
291 0.39
292 0.4
293 0.44
294 0.48
295 0.56
296 0.63
297 0.68
298 0.73
299 0.75
300 0.76