Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH79

Protein Details
Accession C5MH79    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-171NEDDESKAKKKQKTNKKRKDDEVSAVHydrophilic
300-328KEPKPVIKMKKIKKRKPAKVSKQRKLDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-164KAKKKQKTNKKRK
302-324PKPVIKMKKIKKRKPAKVSKQRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ctp:CTRG_05433  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDINGASTKTTAVTMSQEISLSIEETNILRVKAGLKPIPVPVNDQQEKKKDEDGVISLSIEETNKLRARIGLPLIPTESTILDSDVKNFEKHQQEISNKQKNDELQQRINDAKFKANKRKLVSNETLIDRSKELDTDDWLSKLTNNEDDESKAKKKQKTNKKRKDDEVSAVIGHSAKELRSIGDNEILTLKDTGLFDEDSEDILTSETLSRQAKLKRDLAERKEAESIKFNGRHYRNNDDEGDGEDNDLDNSALIGNDRVIINKNTVNLPQVQPSKAESDKSNIAKFNNLFDEIDDIEDKEPKPVIKMKKIKKRKPAKVSKQRKLDDEVSVQLISMEDESGDEDSDISQSLANFRTKKLNLQANFTPEKLAEEIAANRRWEFERKLEKESLTKNIYDDTVGFLNNLENNILSDDEKPREDIQDDPHSNGVSKSGDTDTFVEKSTTPKFSGGLADTLKFLKSKNIIESPSNNSQVKSQELERQEVAKKSELLKMKISIEERILREELTKNKEYILMPKSEKASYFEKLLDSRLKEKGIVIKDDDLKVYNPKVQITYKDRMGNVLDRKKAWKEFSHQYHGTGLDKNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.16
8 0.13
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.16
18 0.18
19 0.22
20 0.29
21 0.28
22 0.29
23 0.32
24 0.38
25 0.42
26 0.4
27 0.42
28 0.41
29 0.48
30 0.51
31 0.54
32 0.56
33 0.58
34 0.61
35 0.58
36 0.57
37 0.5
38 0.48
39 0.47
40 0.42
41 0.37
42 0.34
43 0.31
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.15
48 0.13
49 0.11
50 0.17
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.24
55 0.26
56 0.31
57 0.35
58 0.31
59 0.29
60 0.31
61 0.31
62 0.28
63 0.26
64 0.21
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.21
73 0.23
74 0.22
75 0.23
76 0.29
77 0.34
78 0.35
79 0.39
80 0.42
81 0.46
82 0.56
83 0.65
84 0.66
85 0.6
86 0.6
87 0.57
88 0.52
89 0.55
90 0.55
91 0.52
92 0.49
93 0.51
94 0.54
95 0.55
96 0.53
97 0.49
98 0.42
99 0.42
100 0.44
101 0.5
102 0.57
103 0.6
104 0.66
105 0.66
106 0.73
107 0.71
108 0.72
109 0.68
110 0.63
111 0.6
112 0.56
113 0.54
114 0.47
115 0.42
116 0.33
117 0.29
118 0.24
119 0.19
120 0.18
121 0.15
122 0.17
123 0.2
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.22
134 0.23
135 0.25
136 0.27
137 0.3
138 0.32
139 0.34
140 0.4
141 0.46
142 0.54
143 0.62
144 0.7
145 0.75
146 0.82
147 0.86
148 0.89
149 0.9
150 0.9
151 0.9
152 0.85
153 0.8
154 0.72
155 0.63
156 0.52
157 0.43
158 0.35
159 0.25
160 0.18
161 0.13
162 0.1
163 0.08
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.14
168 0.16
169 0.16
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.11
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.17
199 0.22
200 0.28
201 0.33
202 0.38
203 0.4
204 0.49
205 0.57
206 0.56
207 0.61
208 0.56
209 0.53
210 0.53
211 0.48
212 0.41
213 0.37
214 0.35
215 0.32
216 0.35
217 0.34
218 0.37
219 0.39
220 0.45
221 0.46
222 0.5
223 0.46
224 0.46
225 0.46
226 0.38
227 0.35
228 0.3
229 0.27
230 0.19
231 0.16
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.06
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.2
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.24
263 0.22
264 0.23
265 0.18
266 0.19
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.26
271 0.25
272 0.28
273 0.27
274 0.26
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.15
279 0.17
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.13
291 0.19
292 0.24
293 0.32
294 0.41
295 0.49
296 0.59
297 0.69
298 0.75
299 0.79
300 0.84
301 0.84
302 0.86
303 0.88
304 0.89
305 0.89
306 0.92
307 0.9
308 0.89
309 0.82
310 0.74
311 0.69
312 0.61
313 0.54
314 0.45
315 0.38
316 0.3
317 0.26
318 0.23
319 0.17
320 0.13
321 0.09
322 0.07
323 0.05
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.08
338 0.11
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.25
343 0.25
344 0.3
345 0.36
346 0.41
347 0.38
348 0.43
349 0.45
350 0.43
351 0.44
352 0.39
353 0.32
354 0.24
355 0.24
356 0.19
357 0.16
358 0.1
359 0.1
360 0.14
361 0.18
362 0.21
363 0.2
364 0.19
365 0.21
366 0.23
367 0.26
368 0.26
369 0.3
370 0.37
371 0.4
372 0.46
373 0.47
374 0.47
375 0.48
376 0.48
377 0.47
378 0.38
379 0.36
380 0.31
381 0.29
382 0.27
383 0.21
384 0.18
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.09
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.14
401 0.16
402 0.17
403 0.19
404 0.19
405 0.21
406 0.22
407 0.22
408 0.25
409 0.33
410 0.34
411 0.33
412 0.34
413 0.31
414 0.31
415 0.28
416 0.24
417 0.14
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.16
423 0.18
424 0.18
425 0.18
426 0.19
427 0.17
428 0.16
429 0.21
430 0.24
431 0.25
432 0.23
433 0.23
434 0.23
435 0.23
436 0.27
437 0.23
438 0.23
439 0.21
440 0.2
441 0.2
442 0.2
443 0.2
444 0.16
445 0.15
446 0.17
447 0.21
448 0.24
449 0.3
450 0.35
451 0.37
452 0.41
453 0.46
454 0.46
455 0.48
456 0.5
457 0.44
458 0.39
459 0.4
460 0.38
461 0.37
462 0.33
463 0.29
464 0.31
465 0.33
466 0.36
467 0.35
468 0.37
469 0.38
470 0.39
471 0.39
472 0.36
473 0.36
474 0.35
475 0.39
476 0.41
477 0.4
478 0.4
479 0.41
480 0.39
481 0.41
482 0.4
483 0.37
484 0.36
485 0.39
486 0.36
487 0.36
488 0.34
489 0.29
490 0.31
491 0.34
492 0.37
493 0.37
494 0.39
495 0.35
496 0.35
497 0.4
498 0.38
499 0.4
500 0.37
501 0.37
502 0.36
503 0.41
504 0.43
505 0.4
506 0.41
507 0.36
508 0.37
509 0.32
510 0.32
511 0.3
512 0.3
513 0.29
514 0.33
515 0.36
516 0.36
517 0.38
518 0.4
519 0.4
520 0.37
521 0.39
522 0.42
523 0.4
524 0.4
525 0.39
526 0.41
527 0.44
528 0.45
529 0.43
530 0.37
531 0.34
532 0.35
533 0.35
534 0.33
535 0.3
536 0.31
537 0.35
538 0.37
539 0.44
540 0.45
541 0.49
542 0.51
543 0.55
544 0.52
545 0.51
546 0.51
547 0.5
548 0.53
549 0.55
550 0.53
551 0.5
552 0.57
553 0.61
554 0.64
555 0.62
556 0.6
557 0.59
558 0.64
559 0.7
560 0.73
561 0.67
562 0.61
563 0.59
564 0.54
565 0.49
566 0.45
567 0.45