Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6HW38

Protein Details
Accession A0A5N6HW38    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-139VDTKTWLQQTKKRQKKIEKERARKLAEEHydrophilic
283-308DVSEIKVKKPKKKKAKTTKQRAVMDEHydrophilic
360-380SLTRQRRAAFKKRQKARPEDIHydrophilic
629-652KGSGKMKTEKRLKKIEEEKKREAMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-89KRKREERNAAIRKA
122-135KKRQKKIEKERARK
288-301KVKKPKKKKAKTTK
366-376RAAFKKRQKAR
629-649KGSGKMKTEKRLKKIEEEKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPGADASGPTFKDSEHDGSSSSSEDDEPGSTLESREALASSNWKKMQDEAEAKRKREERNAAIRKAREEAQRNMKLQGATLGEAADAEVDTKTWLQQTKKRQKKIEKERARKLAEELEERARAAEYTAEDLAGVKVGHAVGDFDGGEDHILTLKDTTIDENEEEGDELENLELKEKEKTTEKLELKKRKPVYDPTEENTGILAQYDEEIEGKKRKRFTLDAQGSTAEEREAMRQEVSEKLKKNVISLDFAEETPISDYMDVSEIKVKKPKKKKAKTTKQRAVMDEDDIFPTAEATGTPNGSSMEVDASNGEPVPAPASRKSLNEDISFVDDDDLQASLTRQRRAAFKKRQKARPEDIARQLREEASQTPMDVEGSGENEEEPGLVIDETSEFVSNLQKPTLPERRERRSTTPVEEPRASSEGPGMKDEPVEDGDVDMERSYNDIEDEEDLKARIKSEEATANQQISGTGLEEESTLDQGLGATLSMLKQRGLVKSSDAADHNSLIRDRQRFLQEKNRLETEAEKRARLQRERDRASGKLNQMSAREREEYARWENKQRDQQDARHMAEVFNKEYKPDVQLKYVDEFGRMMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKMKTEKRLKKIEEEKKREAMSALDSSQHTGMNNAMGATARKNRQAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.26
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.34
9 0.32
10 0.27
11 0.24
12 0.17
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.21
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.15
22 0.18
23 0.22
24 0.24
25 0.23
26 0.23
27 0.23
28 0.25
29 0.26
30 0.25
31 0.2
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.13
49 0.22
50 0.24
51 0.32
52 0.34
53 0.35
54 0.36
55 0.39
56 0.42
57 0.42
58 0.48
59 0.48
60 0.56
61 0.61
62 0.62
63 0.66
64 0.67
65 0.64
66 0.65
67 0.67
68 0.66
69 0.7
70 0.77
71 0.77
72 0.79
73 0.75
74 0.68
75 0.62
76 0.59
77 0.57
78 0.54
79 0.55
80 0.58
81 0.63
82 0.62
83 0.59
84 0.57
85 0.48
86 0.42
87 0.38
88 0.29
89 0.22
90 0.2
91 0.18
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.08
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.12
104 0.18
105 0.24
106 0.31
107 0.43
108 0.53
109 0.63
110 0.71
111 0.76
112 0.82
113 0.86
114 0.91
115 0.91
116 0.91
117 0.91
118 0.92
119 0.92
120 0.85
121 0.75
122 0.68
123 0.64
124 0.58
125 0.52
126 0.46
127 0.42
128 0.39
129 0.37
130 0.33
131 0.26
132 0.21
133 0.17
134 0.16
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.15
185 0.15
186 0.19
187 0.22
188 0.25
189 0.28
190 0.37
191 0.42
192 0.47
193 0.56
194 0.63
195 0.63
196 0.69
197 0.7
198 0.66
199 0.67
200 0.68
201 0.65
202 0.64
203 0.64
204 0.58
205 0.59
206 0.53
207 0.47
208 0.37
209 0.29
210 0.19
211 0.15
212 0.11
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.1
220 0.17
221 0.22
222 0.26
223 0.3
224 0.33
225 0.38
226 0.43
227 0.47
228 0.51
229 0.55
230 0.53
231 0.5
232 0.47
233 0.42
234 0.36
235 0.29
236 0.17
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.18
246 0.23
247 0.27
248 0.27
249 0.29
250 0.33
251 0.33
252 0.33
253 0.31
254 0.28
255 0.25
256 0.24
257 0.25
258 0.22
259 0.22
260 0.21
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.22
276 0.28
277 0.35
278 0.46
279 0.56
280 0.61
281 0.71
282 0.8
283 0.85
284 0.91
285 0.92
286 0.93
287 0.92
288 0.9
289 0.85
290 0.75
291 0.7
292 0.6
293 0.52
294 0.41
295 0.33
296 0.24
297 0.2
298 0.17
299 0.11
300 0.09
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.04
322 0.04
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.2
331 0.22
332 0.24
333 0.23
334 0.23
335 0.2
336 0.21
337 0.2
338 0.16
339 0.12
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.1
348 0.14
349 0.16
350 0.17
351 0.19
352 0.27
353 0.35
354 0.46
355 0.51
356 0.57
357 0.65
358 0.73
359 0.8
360 0.8
361 0.81
362 0.77
363 0.76
364 0.73
365 0.7
366 0.71
367 0.69
368 0.62
369 0.55
370 0.49
371 0.39
372 0.33
373 0.27
374 0.19
375 0.15
376 0.15
377 0.13
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.08
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.24
410 0.32
411 0.31
412 0.38
413 0.46
414 0.54
415 0.6
416 0.64
417 0.63
418 0.62
419 0.64
420 0.6
421 0.62
422 0.59
423 0.57
424 0.53
425 0.47
426 0.42
427 0.4
428 0.34
429 0.24
430 0.23
431 0.21
432 0.21
433 0.22
434 0.19
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.15
439 0.12
440 0.12
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.12
466 0.15
467 0.21
468 0.22
469 0.27
470 0.29
471 0.28
472 0.27
473 0.26
474 0.22
475 0.16
476 0.14
477 0.09
478 0.07
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.03
493 0.04
494 0.05
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.12
499 0.16
500 0.2
501 0.22
502 0.22
503 0.22
504 0.26
505 0.27
506 0.27
507 0.24
508 0.24
509 0.23
510 0.24
511 0.22
512 0.21
513 0.2
514 0.2
515 0.25
516 0.25
517 0.26
518 0.31
519 0.39
520 0.42
521 0.48
522 0.55
523 0.58
524 0.61
525 0.65
526 0.61
527 0.53
528 0.49
529 0.5
530 0.47
531 0.48
532 0.43
533 0.39
534 0.42
535 0.48
536 0.56
537 0.55
538 0.58
539 0.58
540 0.66
541 0.71
542 0.73
543 0.7
544 0.63
545 0.63
546 0.61
547 0.56
548 0.51
549 0.48
550 0.45
551 0.44
552 0.47
553 0.44
554 0.41
555 0.37
556 0.33
557 0.34
558 0.34
559 0.35
560 0.39
561 0.43
562 0.42
563 0.49
564 0.55
565 0.6
566 0.66
567 0.63
568 0.65
569 0.63
570 0.66
571 0.68
572 0.69
573 0.62
574 0.57
575 0.55
576 0.46
577 0.46
578 0.44
579 0.37
580 0.35
581 0.32
582 0.29
583 0.31
584 0.32
585 0.31
586 0.36
587 0.35
588 0.35
589 0.39
590 0.41
591 0.41
592 0.44
593 0.38
594 0.31
595 0.29
596 0.24
597 0.29
598 0.28
599 0.27
600 0.28
601 0.32
602 0.34
603 0.36
604 0.42
605 0.36
606 0.35
607 0.41
608 0.43
609 0.46
610 0.46
611 0.51
612 0.48
613 0.47
614 0.54
615 0.5
616 0.49
617 0.47
618 0.5
619 0.48
620 0.53
621 0.57
622 0.59
623 0.66
624 0.68
625 0.71
626 0.75
627 0.75
628 0.77
629 0.81
630 0.82
631 0.82
632 0.82
633 0.82
634 0.79
635 0.76
636 0.67
637 0.57
638 0.49
639 0.44
640 0.4
641 0.34
642 0.3
643 0.29
644 0.3
645 0.3
646 0.28
647 0.22
648 0.18
649 0.18
650 0.16
651 0.16
652 0.13
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.19
657 0.26
658 0.28
659 0.34
660 0.36
661 0.39
662 0.45