Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MGA2

Protein Details
Accession C5MGA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-74SNSQDSSSTKKKSKKSKKSKSSPEPTTSSQHydrophilic
565-584EATKMQKRIKNDPILNNKIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-64KKKSKKSKKSK
Subcellular Location(s) nucl 8.5cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 6, E.R. 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_05095  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSDNFFIKNKTAIIVTALTAFSAAGAYYYYTQQQETGSVNRSDKSNSQDSSSTKKKSKKSKKSKSSPEPTTSSQDDKSTASAKYPTDSQGLPALTEDVISKLSDAEKEEWAMQLKEDGNNEFKNKAYKRAIEFYSAALDLKHDPIYYSNRSACYAALEDHENVIKDTTEAIKMKPDYTKCILRRATSYEVLEQYEDAMFDLTALTIYGGFSNKSIEQVLERVLRKHSIKIVESKPKTLALPSAATIGSFFGAFVEESEPEGINENSEGGAKFLYDALQKINANTQHGYEEADTLINQAVSNLEDEDPVKAVALEYLAAFQFLKNDPTSAFESIEKAISLKPRARAYVFRALINADKSSYDAALKDFKAAEDLDSECPDIFYHLGQLHYLTGDLANAETNFNKAKELHPDNVYAYIQLACITYKNGQTDLANEKFTEAKLKFPTSPEVPNYYGEILADKGDIQGACKQFEIASRLQEKLDRFSVGALPLINEATVISRESLERIGEAEELLTKACAIDPKSELARISLAQIKLQKDEVDDAVVLFEESSDLARSIEEKIQATSFAEATKMQKRIKNDPILNNKIAELMRGSGAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.18
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.09
9 0.08
10 0.07
11 0.04
12 0.05
13 0.07
14 0.08
15 0.1
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.2
22 0.22
23 0.25
24 0.27
25 0.31
26 0.32
27 0.33
28 0.34
29 0.35
30 0.36
31 0.38
32 0.41
33 0.37
34 0.39
35 0.43
36 0.45
37 0.5
38 0.54
39 0.55
40 0.55
41 0.62
42 0.67
43 0.72
44 0.8
45 0.82
46 0.85
47 0.88
48 0.91
49 0.94
50 0.96
51 0.96
52 0.95
53 0.93
54 0.88
55 0.83
56 0.77
57 0.73
58 0.66
59 0.59
60 0.51
61 0.45
62 0.39
63 0.35
64 0.33
65 0.3
66 0.26
67 0.24
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.25
77 0.25
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.15
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.2
96 0.21
97 0.23
98 0.21
99 0.17
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.23
104 0.24
105 0.25
106 0.29
107 0.31
108 0.27
109 0.27
110 0.33
111 0.33
112 0.39
113 0.41
114 0.44
115 0.48
116 0.54
117 0.54
118 0.49
119 0.48
120 0.4
121 0.36
122 0.3
123 0.24
124 0.17
125 0.16
126 0.13
127 0.15
128 0.15
129 0.12
130 0.12
131 0.16
132 0.23
133 0.25
134 0.29
135 0.3
136 0.3
137 0.32
138 0.32
139 0.28
140 0.24
141 0.21
142 0.17
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.15
149 0.14
150 0.14
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.21
159 0.22
160 0.25
161 0.29
162 0.29
163 0.3
164 0.35
165 0.43
166 0.39
167 0.47
168 0.48
169 0.44
170 0.46
171 0.46
172 0.46
173 0.41
174 0.41
175 0.35
176 0.33
177 0.32
178 0.28
179 0.22
180 0.17
181 0.13
182 0.12
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.26
211 0.26
212 0.28
213 0.3
214 0.29
215 0.3
216 0.37
217 0.43
218 0.48
219 0.48
220 0.47
221 0.44
222 0.4
223 0.38
224 0.31
225 0.25
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.1
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.16
268 0.16
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.13
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.12
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.17
326 0.19
327 0.23
328 0.25
329 0.28
330 0.29
331 0.32
332 0.34
333 0.4
334 0.38
335 0.33
336 0.31
337 0.3
338 0.3
339 0.28
340 0.22
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.1
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.15
391 0.23
392 0.28
393 0.31
394 0.31
395 0.33
396 0.32
397 0.34
398 0.31
399 0.22
400 0.18
401 0.14
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.07
406 0.08
407 0.1
408 0.12
409 0.15
410 0.16
411 0.16
412 0.18
413 0.18
414 0.22
415 0.27
416 0.26
417 0.24
418 0.22
419 0.23
420 0.22
421 0.22
422 0.26
423 0.19
424 0.23
425 0.27
426 0.31
427 0.32
428 0.33
429 0.39
430 0.34
431 0.4
432 0.37
433 0.37
434 0.35
435 0.35
436 0.34
437 0.29
438 0.25
439 0.19
440 0.17
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.08
445 0.07
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.15
450 0.17
451 0.18
452 0.18
453 0.18
454 0.17
455 0.21
456 0.24
457 0.2
458 0.26
459 0.28
460 0.29
461 0.3
462 0.33
463 0.31
464 0.31
465 0.32
466 0.26
467 0.23
468 0.24
469 0.25
470 0.22
471 0.21
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.11
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.09
501 0.13
502 0.13
503 0.18
504 0.19
505 0.24
506 0.27
507 0.29
508 0.27
509 0.25
510 0.25
511 0.21
512 0.23
513 0.25
514 0.23
515 0.26
516 0.31
517 0.31
518 0.31
519 0.33
520 0.3
521 0.26
522 0.29
523 0.26
524 0.23
525 0.21
526 0.18
527 0.16
528 0.15
529 0.12
530 0.08
531 0.07
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.1
540 0.13
541 0.17
542 0.2
543 0.2
544 0.22
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.22
549 0.19
550 0.15
551 0.16
552 0.16
553 0.21
554 0.28
555 0.34
556 0.38
557 0.42
558 0.48
559 0.57
560 0.64
561 0.69
562 0.7
563 0.72
564 0.77
565 0.8
566 0.76
567 0.67
568 0.57
569 0.52
570 0.44
571 0.35
572 0.27
573 0.21