Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MEC3

Protein Details
Accession C5MEC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-33TTKLTPDQLARQRRKIEKDKRKKVYDDQQVQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-24QRRKIEKDKRKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015915  Kelch-typ_b-propeller  
IPR006652  Kelch_1  
IPR007213  Ppm1/Ppm2/Tcmp  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0008175  F:tRNA methyltransferase activity  
GO:0031591  P:wybutosine biosynthetic process  
KEGG ctp:CTRG_04416  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13418  Kelch_4  
PF04072  LCM  
Amino Acid Sequences MTTKLTPDQLARQRRKIEKDKRKKVYDDQQVQGTNNSSIVSKRSVEKLYSLSLQPELGEFFKYFVPKGKRRSPAINRGYWIRMESIRQMVIRIIEQNIDKSVNIINLGCGFDPLAFQLLNIYNQTNKNLNFIDIDYPDLIKNKYDMIQKSEEIKQLIGEQNPIELDCLINTNNYKLVGCDLKHTDKYEEILQRLITNKEDINIFIAEVSLAYMKPVYANSIIEISSKINNSHFLILEQIMPDGPNNSFATKMLYHFNHLRSPIQCVENYSTKELQLSRFKQYYKYAEIKNLFENWKYLIDYEMKEKISKIEEFDEWEEFIIFCQHYIIVHASNIDQMIYEVENEEPKEEVIYKIDESYKMVHDDRFPDEQFELKFPATSSINNKIYVHGGLKQTRNDDTLEIDIQKGTVTQLEKASDTPSPRMCHTLTKINNNELVLIGGRSRPGQYMKDTYKLKENQWIKLADLPCGRSRHSTVAINKHQILIFGGLAEDNNEDLFILYDSNDNSYKSLKIIGDNPGNLKSSCMNFENNHTFGLIIGGVSDDNVPQVNDKLYKFTIDRDGGTICIEEIFQHKLLARIGSRFEFVGQDKIIIVGGVSPIQLFTQLTNIMSLNLQTLEFESIKIPEYIYETVPPIFVGFELVESGEKDEEDEEKGLYIVGGGAVCYSFGSCYNSVYKLVKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.82
3 0.83
4 0.85
5 0.86
6 0.89
7 0.91
8 0.92
9 0.92
10 0.89
11 0.88
12 0.88
13 0.87
14 0.85
15 0.79
16 0.76
17 0.71
18 0.64
19 0.58
20 0.5
21 0.4
22 0.31
23 0.27
24 0.2
25 0.18
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.24
30 0.3
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.36
35 0.37
36 0.38
37 0.35
38 0.31
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.2
43 0.18
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.25
52 0.34
53 0.39
54 0.48
55 0.56
56 0.62
57 0.66
58 0.76
59 0.77
60 0.79
61 0.79
62 0.76
63 0.7
64 0.67
65 0.63
66 0.54
67 0.46
68 0.39
69 0.33
70 0.3
71 0.32
72 0.31
73 0.32
74 0.3
75 0.3
76 0.27
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.19
87 0.18
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.12
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.2
110 0.22
111 0.26
112 0.28
113 0.26
114 0.3
115 0.29
116 0.29
117 0.26
118 0.25
119 0.26
120 0.2
121 0.22
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.2
131 0.26
132 0.27
133 0.31
134 0.34
135 0.35
136 0.4
137 0.42
138 0.41
139 0.35
140 0.32
141 0.27
142 0.28
143 0.31
144 0.27
145 0.24
146 0.2
147 0.2
148 0.2
149 0.19
150 0.15
151 0.1
152 0.09
153 0.07
154 0.09
155 0.08
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.16
164 0.18
165 0.17
166 0.22
167 0.26
168 0.31
169 0.34
170 0.36
171 0.34
172 0.31
173 0.33
174 0.35
175 0.34
176 0.29
177 0.28
178 0.26
179 0.26
180 0.28
181 0.27
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.12
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.15
237 0.14
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.22
242 0.26
243 0.28
244 0.28
245 0.29
246 0.32
247 0.26
248 0.31
249 0.3
250 0.28
251 0.26
252 0.26
253 0.28
254 0.3
255 0.31
256 0.29
257 0.26
258 0.24
259 0.26
260 0.24
261 0.26
262 0.29
263 0.31
264 0.33
265 0.36
266 0.37
267 0.38
268 0.43
269 0.42
270 0.4
271 0.43
272 0.39
273 0.43
274 0.45
275 0.42
276 0.39
277 0.38
278 0.33
279 0.27
280 0.26
281 0.2
282 0.19
283 0.17
284 0.15
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.17
289 0.2
290 0.18
291 0.19
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.17
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.21
352 0.23
353 0.22
354 0.2
355 0.2
356 0.21
357 0.2
358 0.18
359 0.17
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.15
366 0.18
367 0.24
368 0.26
369 0.27
370 0.28
371 0.25
372 0.26
373 0.25
374 0.21
375 0.17
376 0.2
377 0.24
378 0.27
379 0.28
380 0.3
381 0.3
382 0.3
383 0.26
384 0.22
385 0.18
386 0.17
387 0.16
388 0.14
389 0.13
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.1
398 0.12
399 0.13
400 0.14
401 0.14
402 0.16
403 0.16
404 0.17
405 0.19
406 0.22
407 0.23
408 0.23
409 0.27
410 0.26
411 0.29
412 0.3
413 0.36
414 0.36
415 0.43
416 0.45
417 0.44
418 0.45
419 0.39
420 0.36
421 0.27
422 0.23
423 0.14
424 0.11
425 0.09
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.11
431 0.14
432 0.16
433 0.2
434 0.28
435 0.3
436 0.37
437 0.39
438 0.38
439 0.44
440 0.45
441 0.43
442 0.44
443 0.44
444 0.41
445 0.44
446 0.43
447 0.35
448 0.37
449 0.36
450 0.32
451 0.31
452 0.29
453 0.3
454 0.31
455 0.31
456 0.29
457 0.31
458 0.32
459 0.33
460 0.37
461 0.39
462 0.47
463 0.51
464 0.52
465 0.5
466 0.47
467 0.42
468 0.36
469 0.3
470 0.22
471 0.16
472 0.11
473 0.1
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.07
488 0.07
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.14
496 0.18
497 0.16
498 0.18
499 0.21
500 0.28
501 0.31
502 0.32
503 0.34
504 0.32
505 0.33
506 0.3
507 0.27
508 0.23
509 0.21
510 0.23
511 0.22
512 0.24
513 0.23
514 0.32
515 0.36
516 0.34
517 0.32
518 0.28
519 0.26
520 0.21
521 0.21
522 0.13
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.09
535 0.13
536 0.17
537 0.17
538 0.22
539 0.22
540 0.25
541 0.25
542 0.27
543 0.32
544 0.3
545 0.31
546 0.28
547 0.28
548 0.25
549 0.25
550 0.21
551 0.12
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.1
556 0.13
557 0.13
558 0.14
559 0.15
560 0.18
561 0.2
562 0.24
563 0.23
564 0.23
565 0.26
566 0.26
567 0.27
568 0.24
569 0.23
570 0.23
571 0.23
572 0.25
573 0.21
574 0.2
575 0.19
576 0.19
577 0.18
578 0.13
579 0.11
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.09
588 0.08
589 0.08
590 0.11
591 0.12
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.13
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.09
602 0.11
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.14
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.15
611 0.12
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.2
616 0.2
617 0.2
618 0.2
619 0.19
620 0.14
621 0.13
622 0.1
623 0.1
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.1
630 0.12
631 0.11
632 0.11
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.15
637 0.16
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.13
642 0.11
643 0.09
644 0.06
645 0.07
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.06
654 0.08
655 0.14
656 0.14
657 0.18
658 0.22
659 0.24
660 0.28