Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MB87

Protein Details
Accession C5MB87    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-210SSPITSAGKPKRKNRPGKKFGAKKRSWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-208GKPKRKNRPGKKFGAKKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003656  Znf_BED  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ctp:CTRG_03329  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02892  zf-BED  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50808  ZF_BED  
Amino Acid Sequences MMSFAYNSPVPIVTPFPFMYSYRDRTSTSAISPSMASSSSATTSPPQQPLQQVQLKQPPQTQQLLSAVEQHTQDRNQQLQQQQQQQQTQLDAAVRLHQLRNSQPTPPKLPSVEPSPSQSQSQSQSQSLSQLDKLAPQLPPLTPQLATPTLHQSVSKPQPLHQQHSPSSPLAQPFIQSPPAHEESSPITSAGKPKRKNRPGKKFGAKKRSWVWTWFDQDSSDPNVAGCNYCGKIIIRLASDKGSPKKLNEHLKTHKIDINSINYSRNPHIDGHGITYSNSGQPLDYPPNFRTFRVHDNSNHDDTTSETSGDENHNVKNTASTTTTITNINRSTSRVDLDNNRRLLSSEFDNSPYSPKKFRAHLLKFLTENKLPISVIKSNSFQQLIYDLRSDSISDLTELTTMYPTLIEVSRFSKEKSNDDNMTNALTEQFVNHVEPTLSQNNNNNIQDSTTINDTSNDNSSNTTVGNNDALDLKLDANVRSPGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.24
5 0.25
6 0.3
7 0.33
8 0.38
9 0.38
10 0.41
11 0.41
12 0.42
13 0.47
14 0.44
15 0.39
16 0.38
17 0.33
18 0.31
19 0.3
20 0.27
21 0.22
22 0.18
23 0.17
24 0.12
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.23
31 0.28
32 0.32
33 0.33
34 0.36
35 0.42
36 0.46
37 0.53
38 0.53
39 0.49
40 0.52
41 0.59
42 0.59
43 0.57
44 0.57
45 0.55
46 0.53
47 0.56
48 0.48
49 0.43
50 0.44
51 0.42
52 0.37
53 0.37
54 0.33
55 0.3
56 0.31
57 0.29
58 0.28
59 0.27
60 0.32
61 0.32
62 0.36
63 0.37
64 0.43
65 0.46
66 0.51
67 0.58
68 0.62
69 0.63
70 0.65
71 0.65
72 0.62
73 0.57
74 0.49
75 0.42
76 0.34
77 0.28
78 0.22
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.25
86 0.3
87 0.38
88 0.35
89 0.41
90 0.45
91 0.49
92 0.54
93 0.52
94 0.51
95 0.45
96 0.46
97 0.43
98 0.43
99 0.41
100 0.36
101 0.38
102 0.38
103 0.38
104 0.36
105 0.34
106 0.32
107 0.32
108 0.36
109 0.34
110 0.3
111 0.3
112 0.29
113 0.32
114 0.29
115 0.27
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.22
121 0.21
122 0.19
123 0.19
124 0.21
125 0.18
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.2
135 0.23
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.2
140 0.27
141 0.33
142 0.37
143 0.32
144 0.33
145 0.43
146 0.48
147 0.52
148 0.48
149 0.49
150 0.45
151 0.49
152 0.49
153 0.39
154 0.36
155 0.33
156 0.28
157 0.23
158 0.21
159 0.17
160 0.16
161 0.18
162 0.21
163 0.18
164 0.19
165 0.23
166 0.26
167 0.26
168 0.24
169 0.23
170 0.21
171 0.24
172 0.23
173 0.16
174 0.13
175 0.14
176 0.22
177 0.3
178 0.35
179 0.4
180 0.48
181 0.59
182 0.68
183 0.78
184 0.82
185 0.84
186 0.84
187 0.87
188 0.89
189 0.88
190 0.88
191 0.88
192 0.78
193 0.73
194 0.71
195 0.68
196 0.6
197 0.54
198 0.5
199 0.46
200 0.49
201 0.43
202 0.37
203 0.3
204 0.29
205 0.27
206 0.25
207 0.18
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.18
228 0.2
229 0.24
230 0.24
231 0.25
232 0.31
233 0.38
234 0.46
235 0.46
236 0.52
237 0.52
238 0.59
239 0.6
240 0.56
241 0.51
242 0.41
243 0.4
244 0.35
245 0.33
246 0.29
247 0.28
248 0.27
249 0.25
250 0.28
251 0.25
252 0.23
253 0.2
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.12
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.12
270 0.17
271 0.18
272 0.21
273 0.22
274 0.3
275 0.31
276 0.3
277 0.31
278 0.29
279 0.36
280 0.38
281 0.41
282 0.38
283 0.45
284 0.5
285 0.48
286 0.44
287 0.35
288 0.3
289 0.28
290 0.28
291 0.21
292 0.16
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.16
297 0.18
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.19
313 0.21
314 0.21
315 0.22
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.22
320 0.23
321 0.2
322 0.23
323 0.3
324 0.38
325 0.43
326 0.42
327 0.41
328 0.39
329 0.38
330 0.36
331 0.29
332 0.25
333 0.21
334 0.21
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.28
339 0.31
340 0.3
341 0.31
342 0.36
343 0.39
344 0.42
345 0.49
346 0.54
347 0.55
348 0.61
349 0.62
350 0.6
351 0.58
352 0.58
353 0.56
354 0.46
355 0.41
356 0.33
357 0.29
358 0.24
359 0.23
360 0.24
361 0.23
362 0.25
363 0.27
364 0.29
365 0.29
366 0.33
367 0.32
368 0.26
369 0.22
370 0.24
371 0.22
372 0.22
373 0.21
374 0.17
375 0.17
376 0.18
377 0.17
378 0.13
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.15
397 0.2
398 0.21
399 0.23
400 0.28
401 0.31
402 0.39
403 0.44
404 0.5
405 0.5
406 0.5
407 0.51
408 0.44
409 0.42
410 0.33
411 0.26
412 0.18
413 0.14
414 0.13
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.13
422 0.14
423 0.2
424 0.25
425 0.26
426 0.29
427 0.36
428 0.41
429 0.49
430 0.49
431 0.45
432 0.38
433 0.37
434 0.35
435 0.29
436 0.25
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.2
441 0.2
442 0.22
443 0.24
444 0.23
445 0.2
446 0.21
447 0.22
448 0.21
449 0.2
450 0.18
451 0.15
452 0.15
453 0.17
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.15
462 0.17
463 0.17
464 0.19