FuNGI

C5MA51

Protein Details

Accession

C5MA51

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
154-181	QVEIKRKGKIWRQQSKKKVHNQHLTEES	Hydrophilic
1213-1237	LVWLQQDDKKWRKLKKQFLETYGQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
159-165	RKGKIWR
1289-1299	PKPTPRRRGPG

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	ctp:CTRG_02363 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MVIPVELGETRVETIVDSGAESDFIDAKMAEQLKLEVKPLKGFQVGTAAEDEPGLQIQGFVQLKFKLCGMELNRLLFVVPNLRYDIYLGLGFCAEFQDSIDFHARTINGVYIDHLREEQNEEQKEKQNEEEKKNQNEEQKERTVPDGTIKEAVQVEIKRKGKIWRQQSKKKVHNQHLTEESQDRAKLVIKDHDRIKNLTDSNKEAPESTKEDHDDKIEETAEPGELATTIMMNNIELNRCLKKAETDVAIVLVKANSLPIKEEQVIPKFIEEEFSDVVTDELPRGLPPERPITHTITLIPGKPPPHKAPYRLTWEEKQELEVQISELLEKGFIVPQASPYGAPVIFVKKKDGSKRLCVDYRALNDITVKERFPIPLIDELFDSLSGATIFSTLDLHSGYHQVAIAKEDQEKTAFVTRFGQYAWKVMPFGLCNAPATFQRLMNDIFMDTFDKYLNIYLDDLIIYSRDRESHEKHVREVLTRLRKNGLIAKKKKCHFFQSSVKYLGHIITDKGIEPDEEKIAAIKNWPPIKSVKQAQSFLGLVGYYRKFIPQMSALCGPIHDFIAGKSNWGTDQQEGFDKLRESLTKSPILILPSQEDTFVVFTDASNSCSGAVLHQVDSAGKFKGVVAYDSYKFGVHELKYTVREKECLAVVKALRKWKHYLAGRRFILYTDHESLRSLHYNKDAFGRINRWIGFLAEYDMEIRHIKGSRNSVADAISRAHINEICVQPVEMGISVMSVQELDPVNVTEIKEGYKADSAFSKIYTVLKDKLEIPVELTNIVKHYVLVDELLYFGLLPSEKIRLCIPAGNIRNQLLYQAHDTTASAHQGALKMHESISRNYYWPKLFRSCRQYTDHCTTCQRSKASTVKTAGLLNPLPVPKARWSSISIDFLTGIPTTAAGYNMLMVVVDRLTKRAHFIPTVKTATAVDVAQLLLLHVVKYHGMPHSIVSDRDVRFNNSIWRTLTERLGISLKMSTSHNPQTDGQTERLNRVVKQTLQAICQNHPQDWDSCLPAAEFGYNNSYQASIKCTPFYADLGFHPRYSGVLAPASSFDAQASVLLGEDFADHQHQVIRVVQERMFEAQQQQMNQVDPHRGYVIFQKGDLVLLHRDILGGGEQDKFNFRYIGPYEVIEKVNDNSYKIKLPPGSRMHDTINVRHLRKYNPRVKDYINVPPTEAEEIRRNIEEVSSIVRVFEDGSCEVTWTDCDINNTLRIPLVWLQQDDKKWRKLKKQFLETYGQSLECNPEEERESINPPVVIPEEIRSRSELDFASRRVHALSQKKMASGDPRFQPKPTPRRRGPG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.1
4	0.1
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.09
9	0.1
10	0.1
11	0.1
12	0.11
13	0.1
14	0.1
15	0.17
16	0.18
17	0.17
18	0.17
19	0.2
20	0.24
21	0.25
22	0.29
23	0.28
24	0.29
25	0.34
26	0.36
27	0.38
28	0.36
29	0.35
30	0.32
31	0.35
32	0.33
33	0.29
34	0.3
35	0.25
36	0.21
37	0.21
38	0.19
39	0.11
40	0.12
41	0.1
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.15
46	0.17
47	0.16
48	0.2
49	0.23
50	0.26
51	0.27
52	0.28
53	0.21
54	0.2
55	0.28
56	0.28
57	0.35
58	0.36
59	0.37
60	0.36
61	0.34
62	0.33
63	0.26
64	0.24
65	0.22
66	0.2
67	0.2
68	0.22
69	0.23
70	0.23
71	0.23
72	0.22
73	0.17
74	0.17
75	0.15
76	0.12
77	0.12
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.11
85	0.11
86	0.15
87	0.22
88	0.2
89	0.2
90	0.24
91	0.23
92	0.21
93	0.23
94	0.22
95	0.16
96	0.16
97	0.19
98	0.2
99	0.21
100	0.21
101	0.21
102	0.19
103	0.2
104	0.26
105	0.31
106	0.34
107	0.38
108	0.4
109	0.44
110	0.51
111	0.54
112	0.51
113	0.52
114	0.53
115	0.57
116	0.62
117	0.66
118	0.67
119	0.71
120	0.74
121	0.72
122	0.71
123	0.72
124	0.71
125	0.68
126	0.67
127	0.61
128	0.57
129	0.55
130	0.49
131	0.4
132	0.41
133	0.36
134	0.31
135	0.31
136	0.29
137	0.29
138	0.27
139	0.27
140	0.25
141	0.26
142	0.29
143	0.35
144	0.38
145	0.36
146	0.4
147	0.48
148	0.51
149	0.57
150	0.63
151	0.64
152	0.71
153	0.8
154	0.86
155	0.88
156	0.88
157	0.9
158	0.89
159	0.89
160	0.89
161	0.83
162	0.81
163	0.77
164	0.7
165	0.64
166	0.55
167	0.47
168	0.4
169	0.36
170	0.28
171	0.23
172	0.26
173	0.24
174	0.26
175	0.33
176	0.34
177	0.41
178	0.48
179	0.54
180	0.53
181	0.51
182	0.51
183	0.5
184	0.49
185	0.49
186	0.46
187	0.45
188	0.46
189	0.47
190	0.44
191	0.37
192	0.36
193	0.35
194	0.36
195	0.32
196	0.32
197	0.33
198	0.34
199	0.35
200	0.35
201	0.31
202	0.26
203	0.28
204	0.23
205	0.19
206	0.18
207	0.17
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.12
224	0.16
225	0.18
226	0.19
227	0.2
228	0.19
229	0.21
230	0.25
231	0.28
232	0.27
233	0.26
234	0.25
235	0.26
236	0.25
237	0.21
238	0.17
239	0.12
240	0.09
241	0.08
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.12
246	0.13
247	0.18
248	0.19
249	0.23
250	0.28
251	0.31
252	0.33
253	0.31
254	0.3
255	0.26
256	0.24
257	0.23
258	0.17
259	0.17
260	0.15
261	0.15
262	0.14
263	0.13
264	0.13
265	0.11
266	0.11
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.09
272	0.11
273	0.13
274	0.17
275	0.26
276	0.27
277	0.31
278	0.35
279	0.38
280	0.39
281	0.37
282	0.34
283	0.31
284	0.31
285	0.29
286	0.27
287	0.24
288	0.27
289	0.31
290	0.37
291	0.37
292	0.44
293	0.48
294	0.52
295	0.56
296	0.59
297	0.63
298	0.63
299	0.63
300	0.59
301	0.6
302	0.58
303	0.51
304	0.46
305	0.41
306	0.35
307	0.31
308	0.25
309	0.19
310	0.16
311	0.16
312	0.13
313	0.1
314	0.08
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.1
323	0.12
324	0.13
325	0.12
326	0.11
327	0.13
328	0.12
329	0.12
330	0.12
331	0.18
332	0.21
333	0.22
334	0.26
335	0.29
336	0.36
337	0.44
338	0.51
339	0.49
340	0.55
341	0.6
342	0.64
343	0.62
344	0.58
345	0.53
346	0.51
347	0.48
348	0.43
349	0.37
350	0.3
351	0.28
352	0.27
353	0.28
354	0.23
355	0.2
356	0.16
357	0.18
358	0.18
359	0.17
360	0.17
361	0.16
362	0.2
363	0.21
364	0.2
365	0.19
366	0.19
367	0.18
368	0.16
369	0.13
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.13
393	0.16
394	0.16
395	0.17
396	0.16
397	0.16
398	0.17
399	0.23
400	0.21
401	0.19
402	0.23
403	0.22
404	0.22
405	0.22
406	0.24
407	0.17
408	0.2
409	0.2
410	0.17
411	0.16
412	0.16
413	0.18
414	0.14
415	0.16
416	0.16
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.15
422	0.18
423	0.17
424	0.16
425	0.16
426	0.17
427	0.18
428	0.17
429	0.17
430	0.13
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.08
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.12
454	0.17
455	0.22
456	0.32
457	0.41
458	0.42
459	0.43
460	0.47
461	0.45
462	0.42
463	0.41
464	0.39
465	0.41
466	0.41
467	0.41
468	0.38
469	0.37
470	0.38
471	0.42
472	0.42
473	0.42
474	0.49
475	0.57
476	0.63
477	0.67
478	0.72
479	0.68
480	0.67
481	0.63
482	0.63
483	0.63
484	0.63
485	0.63
486	0.59
487	0.55
488	0.47
489	0.41
490	0.33
491	0.25
492	0.18
493	0.13
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.11
509	0.12
510	0.18
511	0.22
512	0.22
513	0.23
514	0.26
515	0.31
516	0.36
517	0.4
518	0.41
519	0.42
520	0.44
521	0.42
522	0.42
523	0.37
524	0.3
525	0.23
526	0.15
527	0.1
528	0.13
529	0.12
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.14
536	0.14
537	0.16
538	0.19
539	0.21
540	0.21
541	0.2
542	0.2
543	0.18
544	0.14
545	0.12
546	0.09
547	0.07
548	0.06
549	0.12
550	0.12
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.14
556	0.15
557	0.11
558	0.12
559	0.12
560	0.14
561	0.16
562	0.16
563	0.16
564	0.15
565	0.14
566	0.15
567	0.15
568	0.18
569	0.21
570	0.24
571	0.24
572	0.23
573	0.24
574	0.23
575	0.24
576	0.2
577	0.16
578	0.14
579	0.15
580	0.15
581	0.14
582	0.12
583	0.11
584	0.1
585	0.09
586	0.08
587	0.05
588	0.05
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.1
596	0.1
597	0.06
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.11
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.1
611	0.1
612	0.09
613	0.11
614	0.14
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.13
619	0.13
620	0.13
621	0.15
622	0.12
623	0.13
624	0.14
625	0.17
626	0.2
627	0.22
628	0.25
629	0.21
630	0.22
631	0.2
632	0.2
633	0.2
634	0.18
635	0.16
636	0.17
637	0.17
638	0.21
639	0.24
640	0.28
641	0.28
642	0.29
643	0.32
644	0.31
645	0.38
646	0.39
647	0.46
648	0.46
649	0.53
650	0.51
651	0.49
652	0.46
653	0.39
654	0.35
655	0.28
656	0.25
657	0.2
658	0.2
659	0.19
660	0.19
661	0.2
662	0.2
663	0.23
664	0.19
665	0.17
666	0.22
667	0.22
668	0.22
669	0.25
670	0.24
671	0.2
672	0.22
673	0.22
674	0.21
675	0.24
676	0.24
677	0.21
678	0.19
679	0.18
680	0.17
681	0.14
682	0.12
683	0.08
684	0.08
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.11
692	0.13
693	0.17
694	0.21
695	0.24
696	0.25
697	0.26
698	0.24
699	0.23
700	0.22
701	0.19
702	0.15
703	0.12
704	0.1
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.1
709	0.14
710	0.13
711	0.13
712	0.13
713	0.13
714	0.12
715	0.11
716	0.1
717	0.05
718	0.05
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.03
725	0.03
726	0.06
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.08
731	0.09
732	0.1
733	0.1
734	0.08
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.09
739	0.1
740	0.12
741	0.12
742	0.12
743	0.13
744	0.15
745	0.14
746	0.14
747	0.13
748	0.11
749	0.13
750	0.14
751	0.16
752	0.17
753	0.17
754	0.19
755	0.19
756	0.22
757	0.22
758	0.19
759	0.19
760	0.17
761	0.17
762	0.16
763	0.16
764	0.12
765	0.11
766	0.12
767	0.09
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.07
772	0.07
773	0.06
774	0.05
775	0.06
776	0.05
777	0.05
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.05
784	0.09
785	0.1
786	0.11
787	0.12
788	0.13
789	0.14
790	0.16
791	0.18
792	0.23
793	0.25
794	0.29
795	0.3
796	0.29
797	0.28
798	0.25
799	0.26
800	0.18
801	0.17
802	0.16
803	0.15
804	0.14
805	0.14
806	0.14
807	0.14
808	0.15
809	0.14
810	0.11
811	0.1
812	0.11
813	0.13
814	0.13
815	0.13
816	0.13
817	0.12
818	0.12
819	0.17
820	0.18
821	0.18
822	0.21
823	0.2
824	0.21
825	0.22
826	0.26
827	0.26
828	0.27
829	0.31
830	0.37
831	0.41
832	0.47
833	0.54
834	0.54
835	0.56
836	0.58
837	0.58
838	0.57
839	0.6
840	0.55
841	0.49
842	0.5
843	0.49
844	0.48
845	0.49
846	0.43
847	0.36
848	0.41
849	0.45
850	0.44
851	0.46
852	0.44
853	0.4
854	0.39
855	0.39
856	0.32
857	0.29
858	0.24
859	0.18
860	0.19
861	0.17
862	0.16
863	0.16
864	0.17
865	0.18
866	0.23
867	0.23
868	0.22
869	0.25
870	0.29
871	0.34
872	0.35
873	0.3
874	0.26
875	0.26
876	0.23
877	0.21
878	0.16
879	0.11
880	0.07
881	0.07
882	0.07
883	0.07
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.06
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.07
895	0.07
896	0.09
897	0.1
898	0.11
899	0.14
900	0.18
901	0.21
902	0.24
903	0.27
904	0.31
905	0.37
906	0.4
907	0.36
908	0.33
909	0.3
910	0.26
911	0.24
912	0.18
913	0.11
914	0.09
915	0.09
916	0.08
917	0.07
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.05
922	0.05
923	0.06
924	0.06
925	0.07
926	0.1
927	0.1
928	0.11
929	0.12
930	0.13
931	0.17
932	0.18
933	0.18
934	0.18
935	0.24
936	0.23
937	0.28
938	0.29
939	0.28
940	0.29
941	0.31
942	0.37
943	0.32
944	0.35
945	0.31
946	0.32
947	0.32
948	0.32
949	0.32
950	0.27
951	0.24
952	0.23
953	0.23
954	0.2
955	0.18
956	0.17
957	0.14
958	0.14
959	0.15
960	0.16
961	0.21
962	0.28
963	0.29
964	0.3
965	0.32
966	0.35
967	0.38
968	0.38
969	0.33
970	0.33
971	0.33
972	0.32
973	0.36
974	0.34
975	0.3
976	0.33
977	0.36
978	0.32
979	0.34
980	0.38
981	0.35
982	0.36
983	0.4
984	0.37
985	0.34
986	0.39
987	0.38
988	0.32
989	0.32
990	0.3
991	0.27
992	0.28
993	0.27
994	0.22
995	0.2
996	0.2
997	0.17
998	0.16
999	0.15
1000	0.13
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.14
1004	0.14
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.14
1009	0.15
1010	0.2
1011	0.2
1012	0.21
1013	0.22
1014	0.22
1015	0.23
1016	0.24
1017	0.25
1018	0.2
1019	0.17
1020	0.19
1021	0.25
1022	0.26
1023	0.24
1024	0.23
1025	0.21
1026	0.19
1027	0.19
1028	0.18
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.14
1032	0.14
1033	0.15
1034	0.17
1035	0.15
1036	0.14
1037	0.11
1038	0.09
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.05
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.06
1050	0.08
1051	0.07
1052	0.08
1053	0.11
1054	0.12
1055	0.14
1056	0.17
1057	0.21
1058	0.24
1059	0.27
1060	0.28
1061	0.27
1062	0.28
1063	0.29
1064	0.27
1065	0.24
1066	0.23
1067	0.25
1068	0.27
1069	0.27
1070	0.28
1071	0.27
1072	0.28
1073	0.28
1074	0.27
1075	0.28
1076	0.25
1077	0.26
1078	0.25
1079	0.23
1080	0.22
1081	0.28
1082	0.33
1083	0.28
1084	0.27
1085	0.26
1086	0.25
1087	0.26
1088	0.25
1089	0.2
1090	0.15
1091	0.15
1092	0.15
1093	0.13
1094	0.13
1095	0.12
1096	0.12
1097	0.1
1098	0.09
1099	0.1
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.13
1103	0.17
1104	0.18
1105	0.18
1106	0.19
1107	0.18
1108	0.23
1109	0.25
1110	0.28
1111	0.26
1112	0.25
1113	0.27
1114	0.29
1115	0.3
1116	0.23
1117	0.23
1118	0.2
1119	0.26
1120	0.26
1121	0.25
1122	0.25
1123	0.27
1124	0.31
1125	0.31
1126	0.36
1127	0.35
1128	0.37
1129	0.44
1130	0.48
1131	0.52
1132	0.51
1133	0.53
1134	0.5
1135	0.51
1136	0.52
1137	0.47
1138	0.49
1139	0.51
1140	0.48
1141	0.51
1142	0.52
1143	0.53
1144	0.6
1145	0.66
1146	0.66
1147	0.67
1148	0.71
1149	0.7
1150	0.7
1151	0.68
1152	0.63
1153	0.63
1154	0.59
1155	0.51
1156	0.46
1157	0.42
1158	0.41
1159	0.38
1160	0.33
1161	0.27
1162	0.29
1163	0.31
1164	0.33
1165	0.33
1166	0.31
1167	0.26
1168	0.26
1169	0.23
1170	0.17
1171	0.19
1172	0.17
1173	0.16
1174	0.16
1175	0.15
1176	0.15
1177	0.15
1178	0.14
1179	0.14
1180	0.12
1181	0.16
1182	0.15
1183	0.16
1184	0.16
1185	0.15
1186	0.15
1187	0.15
1188	0.17
1189	0.15
1190	0.18
1191	0.21
1192	0.24
1193	0.27
1194	0.27
1195	0.24
1196	0.22
1197	0.2
1198	0.22
1199	0.22
1200	0.26
1201	0.26
1202	0.27
1203	0.31
1204	0.36
1205	0.43
1206	0.49
1207	0.53
1208	0.57
1209	0.61
1210	0.68
1211	0.75
1212	0.79
1213	0.83
1214	0.84
1215	0.87
1216	0.86
1217	0.84
1218	0.83
1219	0.74
1220	0.7
1221	0.62
1222	0.52
1223	0.41
1224	0.34
1225	0.33
1226	0.25
1227	0.26
1228	0.2
1229	0.21
1230	0.23
1231	0.25
1232	0.27
1233	0.26
1234	0.29
1235	0.29
1236	0.32
1237	0.28
1238	0.25
1239	0.27
1240	0.25
1241	0.23
1242	0.2
1243	0.23
1244	0.27
1245	0.29
1246	0.31
1247	0.29
1248	0.3
1249	0.3
1250	0.32
1251	0.29
1252	0.28
1253	0.32
1254	0.33
1255	0.36
1256	0.34
1257	0.34
1258	0.33
1259	0.37
1260	0.38
1261	0.41
1262	0.47
1263	0.5
1264	0.52
1265	0.53
1266	0.52
1267	0.52
1268	0.53
1269	0.5
1270	0.5
1271	0.5
1272	0.57
1273	0.57
1274	0.58
1275	0.63
1276	0.63
1277	0.68
1278	0.7
1279	0.73

C5MA51

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer