Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9V2

Protein Details
Accession C5M9V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MKPTKKQNNLNLRRQKSKSTFNKDATPFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 15, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ctp:CTRG_02264  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKPTKKQNNLNLRRQKSKSTFNKDATPFSPAVSSQSSSVRNNQHSDPSDLTYNTPKPTQQNNFTPNPIIRKSTTAASPTDSNAKPVPYIIIVTNIPIQSTKDDFIQLINSRISTTDDSYTIDQFVAEHDNTITAILKVPDLETCNNMISALNNTHWEGKTLKLTLNIDQNDQLLSTNKHYINNDPSSTYSFGQPSSSSSLSSLSESYWKPPLSRNTSASSTPSALSLSRRTSSLDSRRFDSRSTSKSSISSLGLSSKRSSQSSSISSDPQSNKKPVPTFIMNMIQDNEKLTPDRNHSIEEDVPEENENDVHEHQNHHRQQQQQQQQQQQQDQEDNDENNDDGIDGNENPQSMDDGGDDEFIWVHATDDVTDTTNFPKGENSDNLIKVNARRLFVGNVPYSSNWTSLKNFLINKSNELEPDTNISILRVEIPVHQVPRSEPYYMFPIGRGLASVTKSKGFAIVTTGDRHSSEKLIELLNNVEFEGRSLTVRYDKYPEYNNYVMQQMHAHSSGNYHNLSQRNNLHYHDGISLPPNLPYLPQYPTSPSANKHQNQQNMASSLQPVLNYSPSPALLSSLVFERNSYQRNFYYASAAARGAGGNTVGSNQNQGSNQSEGQNQPSNSNSNQSQRAHPISESNVPNALTPGINQFISPPATGSYFQFSPQQQGHQHQSVPQSNQLQGQHAGSLRSLQFIPPPMAPPPPHPSHVHQLSQNPGTESPNAQAFMYWPPPYYNSTPIYAIPPPFHQYQYTGSPHHYQQQFPQQMNHQGQYNSRPQSQPVQQQEQRQSQVSKDSTPTPSRIIRDVTSKEETPLQEQTNTTEVTMSEEEKARDLINSIKDLSIDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.79
4 0.8
5 0.8
6 0.79
7 0.81
8 0.76
9 0.81
10 0.74
11 0.73
12 0.64
13 0.59
14 0.49
15 0.4
16 0.37
17 0.28
18 0.29
19 0.26
20 0.25
21 0.22
22 0.28
23 0.32
24 0.33
25 0.4
26 0.45
27 0.47
28 0.5
29 0.51
30 0.54
31 0.52
32 0.54
33 0.5
34 0.45
35 0.44
36 0.4
37 0.4
38 0.39
39 0.4
40 0.38
41 0.37
42 0.38
43 0.41
44 0.5
45 0.56
46 0.56
47 0.62
48 0.65
49 0.68
50 0.67
51 0.65
52 0.6
53 0.58
54 0.53
55 0.48
56 0.43
57 0.42
58 0.41
59 0.4
60 0.4
61 0.35
62 0.34
63 0.33
64 0.33
65 0.31
66 0.37
67 0.33
68 0.32
69 0.32
70 0.31
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.19
85 0.19
86 0.22
87 0.21
88 0.19
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.24
96 0.22
97 0.21
98 0.22
99 0.24
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.22
105 0.24
106 0.24
107 0.21
108 0.18
109 0.15
110 0.12
111 0.13
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.08
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.16
130 0.18
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.15
135 0.13
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.23
142 0.23
143 0.24
144 0.21
145 0.22
146 0.26
147 0.26
148 0.27
149 0.28
150 0.3
151 0.32
152 0.39
153 0.37
154 0.33
155 0.33
156 0.31
157 0.25
158 0.23
159 0.2
160 0.15
161 0.17
162 0.18
163 0.24
164 0.25
165 0.3
166 0.31
167 0.36
168 0.4
169 0.43
170 0.41
171 0.36
172 0.36
173 0.35
174 0.37
175 0.31
176 0.26
177 0.22
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.19
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.16
190 0.11
191 0.17
192 0.17
193 0.19
194 0.24
195 0.24
196 0.24
197 0.3
198 0.39
199 0.42
200 0.47
201 0.47
202 0.46
203 0.49
204 0.49
205 0.44
206 0.37
207 0.31
208 0.25
209 0.22
210 0.18
211 0.16
212 0.18
213 0.2
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.23
218 0.26
219 0.34
220 0.41
221 0.44
222 0.43
223 0.45
224 0.5
225 0.48
226 0.46
227 0.45
228 0.42
229 0.39
230 0.44
231 0.44
232 0.41
233 0.4
234 0.42
235 0.36
236 0.3
237 0.26
238 0.19
239 0.23
240 0.22
241 0.23
242 0.22
243 0.24
244 0.26
245 0.26
246 0.27
247 0.24
248 0.28
249 0.29
250 0.32
251 0.29
252 0.28
253 0.28
254 0.33
255 0.34
256 0.36
257 0.38
258 0.39
259 0.39
260 0.43
261 0.44
262 0.4
263 0.43
264 0.39
265 0.35
266 0.35
267 0.39
268 0.34
269 0.32
270 0.31
271 0.25
272 0.21
273 0.21
274 0.18
275 0.12
276 0.12
277 0.14
278 0.17
279 0.22
280 0.26
281 0.26
282 0.27
283 0.27
284 0.3
285 0.28
286 0.25
287 0.22
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.16
300 0.2
301 0.3
302 0.33
303 0.36
304 0.4
305 0.43
306 0.5
307 0.56
308 0.62
309 0.6
310 0.64
311 0.68
312 0.68
313 0.68
314 0.64
315 0.58
316 0.51
317 0.46
318 0.38
319 0.34
320 0.31
321 0.25
322 0.22
323 0.18
324 0.16
325 0.12
326 0.12
327 0.08
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.05
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.17
366 0.18
367 0.2
368 0.21
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.18
374 0.24
375 0.24
376 0.2
377 0.2
378 0.21
379 0.22
380 0.23
381 0.27
382 0.2
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.19
387 0.18
388 0.18
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.19
396 0.2
397 0.27
398 0.25
399 0.26
400 0.26
401 0.25
402 0.21
403 0.23
404 0.21
405 0.14
406 0.17
407 0.15
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.11
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.18
424 0.19
425 0.17
426 0.15
427 0.16
428 0.19
429 0.2
430 0.19
431 0.14
432 0.14
433 0.13
434 0.12
435 0.1
436 0.07
437 0.09
438 0.1
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.12
446 0.1
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.15
451 0.16
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.15
456 0.13
457 0.12
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.11
466 0.1
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.13
476 0.14
477 0.16
478 0.18
479 0.19
480 0.21
481 0.27
482 0.28
483 0.3
484 0.3
485 0.3
486 0.27
487 0.29
488 0.25
489 0.2
490 0.19
491 0.14
492 0.14
493 0.13
494 0.13
495 0.1
496 0.13
497 0.14
498 0.16
499 0.15
500 0.14
501 0.19
502 0.22
503 0.23
504 0.27
505 0.3
506 0.31
507 0.33
508 0.34
509 0.33
510 0.3
511 0.3
512 0.25
513 0.21
514 0.17
515 0.16
516 0.17
517 0.14
518 0.14
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.12
523 0.13
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.19
528 0.22
529 0.26
530 0.26
531 0.26
532 0.32
533 0.39
534 0.4
535 0.45
536 0.48
537 0.5
538 0.51
539 0.53
540 0.48
541 0.41
542 0.39
543 0.31
544 0.25
545 0.21
546 0.19
547 0.14
548 0.12
549 0.11
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.11
563 0.1
564 0.11
565 0.13
566 0.17
567 0.22
568 0.22
569 0.25
570 0.24
571 0.27
572 0.29
573 0.27
574 0.26
575 0.23
576 0.23
577 0.2
578 0.19
579 0.16
580 0.14
581 0.13
582 0.09
583 0.08
584 0.07
585 0.05
586 0.05
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.1
591 0.1
592 0.13
593 0.14
594 0.16
595 0.18
596 0.19
597 0.2
598 0.2
599 0.23
600 0.22
601 0.27
602 0.31
603 0.28
604 0.27
605 0.28
606 0.3
607 0.27
608 0.31
609 0.3
610 0.3
611 0.37
612 0.37
613 0.38
614 0.42
615 0.45
616 0.41
617 0.38
618 0.36
619 0.33
620 0.38
621 0.36
622 0.3
623 0.29
624 0.27
625 0.27
626 0.24
627 0.21
628 0.13
629 0.12
630 0.14
631 0.13
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.14
636 0.16
637 0.15
638 0.13
639 0.12
640 0.14
641 0.16
642 0.16
643 0.18
644 0.17
645 0.18
646 0.23
647 0.22
648 0.26
649 0.27
650 0.32
651 0.32
652 0.38
653 0.44
654 0.42
655 0.42
656 0.4
657 0.47
658 0.47
659 0.45
660 0.45
661 0.42
662 0.4
663 0.44
664 0.41
665 0.36
666 0.32
667 0.29
668 0.26
669 0.24
670 0.23
671 0.18
672 0.21
673 0.18
674 0.19
675 0.18
676 0.16
677 0.18
678 0.2
679 0.23
680 0.2
681 0.22
682 0.22
683 0.27
684 0.28
685 0.31
686 0.35
687 0.37
688 0.39
689 0.41
690 0.44
691 0.49
692 0.53
693 0.52
694 0.48
695 0.49
696 0.52
697 0.52
698 0.48
699 0.4
700 0.36
701 0.34
702 0.32
703 0.28
704 0.24
705 0.24
706 0.23
707 0.2
708 0.19
709 0.17
710 0.21
711 0.24
712 0.23
713 0.2
714 0.22
715 0.24
716 0.29
717 0.32
718 0.32
719 0.3
720 0.31
721 0.32
722 0.31
723 0.33
724 0.32
725 0.31
726 0.27
727 0.28
728 0.3
729 0.31
730 0.32
731 0.29
732 0.27
733 0.3
734 0.35
735 0.36
736 0.34
737 0.35
738 0.38
739 0.39
740 0.45
741 0.44
742 0.38
743 0.42
744 0.5
745 0.54
746 0.51
747 0.54
748 0.51
749 0.58
750 0.61
751 0.55
752 0.49
753 0.44
754 0.47
755 0.49
756 0.51
757 0.47
758 0.46
759 0.45
760 0.44
761 0.51
762 0.55
763 0.57
764 0.57
765 0.62
766 0.62
767 0.7
768 0.75
769 0.74
770 0.7
771 0.66
772 0.6
773 0.53
774 0.57
775 0.51
776 0.46
777 0.42
778 0.44
779 0.45
780 0.48
781 0.48
782 0.45
783 0.48
784 0.47
785 0.48
786 0.47
787 0.42
788 0.46
789 0.47
790 0.48
791 0.48
792 0.45
793 0.43
794 0.44
795 0.43
796 0.39
797 0.42
798 0.38
799 0.36
800 0.36
801 0.37
802 0.35
803 0.34
804 0.29
805 0.23
806 0.2
807 0.22
808 0.24
809 0.21
810 0.21
811 0.25
812 0.26
813 0.26
814 0.27
815 0.22
816 0.21
817 0.21
818 0.24
819 0.25
820 0.27
821 0.27
822 0.26