Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M8Y0

Protein Details
Accession C5M8Y0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-315ELPVRERSKRNNSYNNKDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.833, cyto 7, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0043024  F:ribosomal small subunit binding  
GO:0033592  F:RNA strand annealing activity  
GO:0034057  F:RNA strand-exchange activity  
GO:0097010  P:eukaryotic translation initiation factor 4F complex assembly  
GO:0001731  P:formation of translation preinitiation complex  
KEGG ctp:CTRG_02852  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPPKKNVKMDLSSFLADDSFGGSWADEEVDISSIGVSLDQPSYSTAAPIGGSGNTATATSGGSGFASQAPVNEEFRRERKEFPIPDQPPYRARVSNLPWETDEDGIVRHFEDRMQAQGIISDVVLPKDRETGKLRGFAFVTFNEREILEESLNLSMSEFQGRKIYVNVAAPPKESEGDWRSGRGGNASSRREPAVELDWGSARNSRAELPTRQRSNRNIESDQSNENNTPTRAPRRQEPELDWGSARGAKIDLPPRQRSNRNFNNNDENNNATPRTPRRQEPELDWGSARSTRAELPVRERSKRNNSYNNKDSTTTTQKPSEPEFDWKRGQSLPSGRRSTSTSTNKKDDKKEEQSSQQQGPQKSHFSVLDIEDEEDEEEHKEETQSKQTQVEDLTEKTADLSVHDDNDGWEVVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.37
3 0.29
4 0.21
5 0.17
6 0.13
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.1
55 0.09
56 0.1
57 0.14
58 0.16
59 0.2
60 0.2
61 0.24
62 0.28
63 0.34
64 0.4
65 0.39
66 0.41
67 0.45
68 0.53
69 0.54
70 0.54
71 0.59
72 0.55
73 0.6
74 0.6
75 0.57
76 0.51
77 0.51
78 0.48
79 0.4
80 0.4
81 0.41
82 0.4
83 0.47
84 0.44
85 0.43
86 0.39
87 0.4
88 0.39
89 0.3
90 0.26
91 0.16
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.17
116 0.18
117 0.22
118 0.26
119 0.32
120 0.34
121 0.4
122 0.39
123 0.36
124 0.36
125 0.32
126 0.29
127 0.23
128 0.25
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.15
154 0.17
155 0.2
156 0.21
157 0.22
158 0.22
159 0.21
160 0.21
161 0.18
162 0.16
163 0.19
164 0.17
165 0.22
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.23
170 0.23
171 0.18
172 0.18
173 0.18
174 0.25
175 0.28
176 0.28
177 0.28
178 0.29
179 0.27
180 0.25
181 0.22
182 0.17
183 0.15
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.18
196 0.23
197 0.28
198 0.36
199 0.41
200 0.44
201 0.48
202 0.51
203 0.56
204 0.57
205 0.56
206 0.49
207 0.46
208 0.45
209 0.42
210 0.39
211 0.32
212 0.27
213 0.21
214 0.2
215 0.2
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.26
220 0.3
221 0.32
222 0.38
223 0.44
224 0.48
225 0.5
226 0.49
227 0.48
228 0.45
229 0.44
230 0.36
231 0.29
232 0.25
233 0.23
234 0.18
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.14
239 0.21
240 0.26
241 0.31
242 0.37
243 0.43
244 0.5
245 0.57
246 0.59
247 0.63
248 0.67
249 0.71
250 0.69
251 0.67
252 0.71
253 0.65
254 0.61
255 0.53
256 0.47
257 0.38
258 0.36
259 0.31
260 0.22
261 0.26
262 0.29
263 0.35
264 0.36
265 0.4
266 0.45
267 0.5
268 0.53
269 0.52
270 0.55
271 0.49
272 0.45
273 0.4
274 0.33
275 0.29
276 0.28
277 0.23
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.2
282 0.25
283 0.26
284 0.31
285 0.4
286 0.45
287 0.49
288 0.52
289 0.55
290 0.61
291 0.68
292 0.7
293 0.71
294 0.74
295 0.79
296 0.82
297 0.78
298 0.7
299 0.62
300 0.56
301 0.53
302 0.54
303 0.49
304 0.45
305 0.45
306 0.44
307 0.47
308 0.48
309 0.46
310 0.4
311 0.44
312 0.46
313 0.47
314 0.5
315 0.47
316 0.46
317 0.42
318 0.41
319 0.39
320 0.42
321 0.44
322 0.48
323 0.52
324 0.49
325 0.49
326 0.51
327 0.49
328 0.49
329 0.52
330 0.53
331 0.55
332 0.64
333 0.7
334 0.74
335 0.78
336 0.77
337 0.76
338 0.76
339 0.78
340 0.76
341 0.77
342 0.78
343 0.76
344 0.72
345 0.68
346 0.65
347 0.6
348 0.59
349 0.55
350 0.52
351 0.46
352 0.46
353 0.4
354 0.36
355 0.35
356 0.31
357 0.3
358 0.26
359 0.25
360 0.2
361 0.2
362 0.18
363 0.15
364 0.14
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.16
371 0.2
372 0.29
373 0.33
374 0.35
375 0.4
376 0.4
377 0.42
378 0.4
379 0.41
380 0.36
381 0.32
382 0.32
383 0.28
384 0.26
385 0.23
386 0.24
387 0.18
388 0.15
389 0.18
390 0.17
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.17
395 0.2
396 0.19