Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M412

Protein Details
Accession C5M412    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-146MTSSSHQKNSKRIKNNSESYPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.833, cyto 10.5, cyto_mito 6.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00801  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
CDD cd00048  DSRM_SF  
Amino Acid Sequences MSSDSGKEIQTILDELTQVKGSVTQFVAQLNTIISRAPTREDWNKLNEIAYEGEKSNESPMTLNRINQAIEWPTSAIAIRLKELFEDGKLPLMTALTRVCVKTGADPKACNFILDYNPKVDPKNEMTSSSHQKNSKRIKNNSESYPPILPTLRSKSLAIRAATDKSYRRIEDLLASTTNDFQKSHNGRLASKGRAILNLCLVEILEPYAGLSDEDIDLITHRLLSNRILAKFAFGYNLVDGSKYNLSVDADFEEKIEVIGNLFLAHIGSLREENYDLEDLKRFVRSLYDTVITEYIEKNDPLAKASLMELDLLFKSITNLKYAPHHNFQYEIRETNDDPHVVKILVDGVELGSGVSSASLEAAKYRAANDVFDGSGNGIRKIWEVLVANVQEHNAQANNGATPVPLLTNGPMGYVTGVPAPLGYLPNANAVVPPPSISAPVPIPQAQLAIKNSTVSNEIGAITNSPHNQQQPPTQSQPPPQQQINPQLQSPQAQEQQPQPRASAGSNSPMNPYQQVTSQHPSAHPTPVIGQQQMTVSQQPQQYVQYQQQPYQIYPHATPQAPYGQQSMVQAPPQHIYQQQNTTMAHTPVQAVVPMGQQGMRHGKLEGAYYDSNNILTLPLEIPGNNSALSTLNTMISQAKIMPPEYNVHELTPLSQDRKLFYATVQIGDVYLGAGYGSTKKEARHKAAMCALNNPEKCLQVGLTLPSTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.16
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.16
8 0.15
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.23
15 0.19
16 0.19
17 0.15
18 0.15
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.15
23 0.16
24 0.2
25 0.23
26 0.29
27 0.38
28 0.44
29 0.47
30 0.5
31 0.53
32 0.5
33 0.47
34 0.4
35 0.34
36 0.3
37 0.27
38 0.24
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.19
45 0.18
46 0.17
47 0.2
48 0.27
49 0.29
50 0.3
51 0.29
52 0.31
53 0.31
54 0.29
55 0.31
56 0.25
57 0.24
58 0.23
59 0.21
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.18
74 0.16
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.23
90 0.31
91 0.36
92 0.38
93 0.4
94 0.41
95 0.47
96 0.46
97 0.38
98 0.31
99 0.27
100 0.31
101 0.35
102 0.35
103 0.3
104 0.33
105 0.35
106 0.35
107 0.33
108 0.31
109 0.31
110 0.38
111 0.36
112 0.36
113 0.39
114 0.45
115 0.53
116 0.53
117 0.53
118 0.5
119 0.54
120 0.6
121 0.66
122 0.68
123 0.69
124 0.72
125 0.76
126 0.8
127 0.82
128 0.79
129 0.76
130 0.7
131 0.64
132 0.58
133 0.48
134 0.42
135 0.36
136 0.31
137 0.3
138 0.34
139 0.34
140 0.33
141 0.33
142 0.35
143 0.41
144 0.45
145 0.39
146 0.36
147 0.35
148 0.36
149 0.37
150 0.37
151 0.33
152 0.33
153 0.38
154 0.35
155 0.34
156 0.32
157 0.31
158 0.32
159 0.32
160 0.29
161 0.24
162 0.24
163 0.22
164 0.24
165 0.25
166 0.2
167 0.18
168 0.16
169 0.25
170 0.29
171 0.34
172 0.34
173 0.34
174 0.34
175 0.42
176 0.47
177 0.4
178 0.38
179 0.37
180 0.34
181 0.36
182 0.37
183 0.3
184 0.28
185 0.25
186 0.21
187 0.17
188 0.16
189 0.12
190 0.1
191 0.09
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.17
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.15
221 0.11
222 0.12
223 0.1
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.13
272 0.15
273 0.15
274 0.17
275 0.18
276 0.17
277 0.18
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.18
309 0.23
310 0.27
311 0.28
312 0.29
313 0.27
314 0.29
315 0.29
316 0.31
317 0.28
318 0.25
319 0.22
320 0.23
321 0.22
322 0.23
323 0.24
324 0.18
325 0.17
326 0.15
327 0.15
328 0.12
329 0.12
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.07
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.1
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.1
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.15
433 0.13
434 0.16
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.15
454 0.17
455 0.2
456 0.23
457 0.29
458 0.33
459 0.38
460 0.42
461 0.45
462 0.46
463 0.5
464 0.57
465 0.57
466 0.55
467 0.51
468 0.51
469 0.51
470 0.56
471 0.58
472 0.49
473 0.43
474 0.4
475 0.39
476 0.37
477 0.34
478 0.31
479 0.28
480 0.28
481 0.3
482 0.36
483 0.44
484 0.47
485 0.45
486 0.39
487 0.36
488 0.36
489 0.34
490 0.31
491 0.23
492 0.24
493 0.26
494 0.26
495 0.27
496 0.27
497 0.27
498 0.24
499 0.23
500 0.18
501 0.2
502 0.24
503 0.27
504 0.3
505 0.31
506 0.32
507 0.31
508 0.35
509 0.33
510 0.32
511 0.26
512 0.22
513 0.23
514 0.27
515 0.3
516 0.26
517 0.24
518 0.21
519 0.22
520 0.23
521 0.22
522 0.18
523 0.15
524 0.2
525 0.21
526 0.21
527 0.22
528 0.23
529 0.24
530 0.26
531 0.32
532 0.36
533 0.36
534 0.38
535 0.42
536 0.41
537 0.39
538 0.4
539 0.37
540 0.32
541 0.3
542 0.33
543 0.33
544 0.32
545 0.31
546 0.29
547 0.33
548 0.3
549 0.31
550 0.27
551 0.22
552 0.23
553 0.25
554 0.25
555 0.2
556 0.22
557 0.22
558 0.21
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.26
563 0.29
564 0.32
565 0.37
566 0.38
567 0.4
568 0.39
569 0.4
570 0.39
571 0.35
572 0.3
573 0.24
574 0.22
575 0.2
576 0.2
577 0.16
578 0.12
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.16
586 0.23
587 0.23
588 0.23
589 0.22
590 0.24
591 0.24
592 0.27
593 0.22
594 0.2
595 0.2
596 0.2
597 0.22
598 0.2
599 0.19
600 0.16
601 0.15
602 0.1
603 0.09
604 0.1
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.12
610 0.13
611 0.14
612 0.12
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.14
617 0.13
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.14
622 0.14
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.15
627 0.16
628 0.18
629 0.18
630 0.19
631 0.23
632 0.27
633 0.3
634 0.28
635 0.26
636 0.27
637 0.25
638 0.25
639 0.27
640 0.28
641 0.26
642 0.28
643 0.29
644 0.29
645 0.32
646 0.32
647 0.26
648 0.22
649 0.28
650 0.27
651 0.27
652 0.25
653 0.22
654 0.2
655 0.19
656 0.18
657 0.09
658 0.07
659 0.05
660 0.04
661 0.04
662 0.05
663 0.09
664 0.11
665 0.14
666 0.17
667 0.22
668 0.32
669 0.42
670 0.49
671 0.55
672 0.56
673 0.61
674 0.67
675 0.7
676 0.61
677 0.59
678 0.57
679 0.57
680 0.54
681 0.51
682 0.45
683 0.39
684 0.38
685 0.33
686 0.27
687 0.21
688 0.24
689 0.24