Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHS6

Protein Details
Accession C5MHS6    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-55SDVEETPKKVKKDKKEKKDKKEKKDKKEKKRKLDDDDDKEELBasic
62-83QIPLSKKQQRQLKKGKLDLEKLHydrophilic
292-314GEDRSAKRPKRLNENRNNNYNNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-45KKVKKDKKEKKDKKEKKDKKEKKRK
70-93QRQLKKGKLDLEKLAKKHPAPKPE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ctp:CTRG_05619  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MSDKEEQIVSEVTSDVEETPKKVKKDKKEKKDKKEKKDKKEKKRKLDDDDDKEELEIDLNAQIPLSKKQQRQLKKGKLDLEKLAKKHPAPKPENAPEEPEKESKRSEFGVWIGNLSFDTTKEDIIRFITNKTIDLETKIENDDISRINIPKKGTQIKGFAYVDLPSLNHVQSVVSLSEQILNGRKLLIKNANSFEGRPEKSTTEGSSSASKNPPSRILFVGNLSFDTTEDNLEEHFRHCGDITRIRMATFQDTGKCKGFAFIDFKNEEGATNALNSKLTKIFINRKLRMEYGEDRSAKRPKRLNENRNNNYNNNNYDGNNDNNNLSNNNGDYGNQGYEQREYTQREPKQYDNYDNSDSSRKRQYRERETSGSSGPQQSNKRMKSSVALASAQRASAAIVPSAGKKIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.15
4 0.16
5 0.18
6 0.27
7 0.33
8 0.37
9 0.46
10 0.54
11 0.6
12 0.7
13 0.78
14 0.8
15 0.86
16 0.92
17 0.94
18 0.96
19 0.96
20 0.96
21 0.96
22 0.95
23 0.95
24 0.96
25 0.95
26 0.95
27 0.96
28 0.96
29 0.95
30 0.96
31 0.94
32 0.93
33 0.93
34 0.92
35 0.9
36 0.86
37 0.77
38 0.66
39 0.56
40 0.47
41 0.35
42 0.26
43 0.17
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.12
51 0.16
52 0.25
53 0.31
54 0.35
55 0.43
56 0.53
57 0.61
58 0.7
59 0.76
60 0.78
61 0.79
62 0.81
63 0.82
64 0.81
65 0.76
66 0.74
67 0.73
68 0.69
69 0.62
70 0.62
71 0.6
72 0.55
73 0.59
74 0.57
75 0.58
76 0.57
77 0.63
78 0.66
79 0.68
80 0.72
81 0.64
82 0.64
83 0.58
84 0.56
85 0.51
86 0.48
87 0.42
88 0.38
89 0.4
90 0.35
91 0.34
92 0.33
93 0.3
94 0.26
95 0.25
96 0.29
97 0.25
98 0.24
99 0.21
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.08
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.17
112 0.2
113 0.16
114 0.17
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.22
119 0.21
120 0.18
121 0.2
122 0.21
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.18
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.3
139 0.35
140 0.36
141 0.38
142 0.41
143 0.39
144 0.44
145 0.41
146 0.34
147 0.28
148 0.25
149 0.21
150 0.16
151 0.15
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.15
172 0.13
173 0.18
174 0.23
175 0.23
176 0.27
177 0.29
178 0.31
179 0.29
180 0.29
181 0.28
182 0.29
183 0.26
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.22
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.23
197 0.25
198 0.24
199 0.25
200 0.3
201 0.28
202 0.29
203 0.27
204 0.27
205 0.25
206 0.24
207 0.24
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.12
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.13
227 0.16
228 0.22
229 0.24
230 0.27
231 0.28
232 0.27
233 0.29
234 0.26
235 0.25
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.23
240 0.26
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.23
245 0.22
246 0.21
247 0.23
248 0.21
249 0.26
250 0.25
251 0.26
252 0.25
253 0.24
254 0.19
255 0.16
256 0.15
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.21
268 0.3
269 0.38
270 0.48
271 0.5
272 0.53
273 0.56
274 0.54
275 0.5
276 0.47
277 0.44
278 0.41
279 0.44
280 0.42
281 0.41
282 0.47
283 0.53
284 0.52
285 0.54
286 0.54
287 0.53
288 0.62
289 0.7
290 0.75
291 0.77
292 0.83
293 0.82
294 0.85
295 0.83
296 0.75
297 0.7
298 0.66
299 0.57
300 0.5
301 0.45
302 0.36
303 0.34
304 0.35
305 0.32
306 0.29
307 0.28
308 0.25
309 0.25
310 0.26
311 0.23
312 0.21
313 0.19
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.18
325 0.2
326 0.21
327 0.26
328 0.3
329 0.35
330 0.43
331 0.47
332 0.54
333 0.57
334 0.6
335 0.63
336 0.63
337 0.65
338 0.62
339 0.63
340 0.58
341 0.55
342 0.52
343 0.51
344 0.47
345 0.44
346 0.48
347 0.48
348 0.49
349 0.57
350 0.64
351 0.66
352 0.74
353 0.76
354 0.72
355 0.72
356 0.71
357 0.66
358 0.6
359 0.53
360 0.51
361 0.46
362 0.47
363 0.49
364 0.55
365 0.61
366 0.6
367 0.62
368 0.56
369 0.55
370 0.53
371 0.53
372 0.5
373 0.44
374 0.43
375 0.38
376 0.41
377 0.4
378 0.34
379 0.27
380 0.21
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.13
385 0.14
386 0.15
387 0.18
388 0.24
389 0.27