Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MF58

Protein Details
Accession C5MF58    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-382VNDLSGSVRKRKKTDQQDKSKKAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-382RKRKKTDQQDKSKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG ctp:CTRG_04701  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTTYSTEISKLISDGSRAYSAKDFDLAAEKYGDACAKFSETHDGNEDGDLLLLYGKAVFQSGVSKSEVFGGNPSAGQDLEEETGDSTKDVGDKQNDKEDEKDDDKFQFYADGDEEEEQQQQEEEQEGPQLASGEGEEDEGENQSDFEIAWELLDLARSLFENKVKSLDKGDLKPPYLSKDTEETENEYIVTVRKLSETYDILGEVSLEAENFNQAAEDLKKSLELRLELYPDTSSLITEAHYKLALALEFQSDDMESRKKSAEQMKLAIEALERRNAKESEADKKKDNQEMIDEMKEKYRDLLKDPSEELKNQQLDIIKGILGEEASSGGSSNTQNVGAAIVNNLQSMVKKKNDKPVVNDLSGSVRKRKKTDQQDKSKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.24
4 0.24
5 0.26
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.28
10 0.24
11 0.2
12 0.27
13 0.24
14 0.21
15 0.21
16 0.19
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.25
27 0.24
28 0.26
29 0.29
30 0.29
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.16
35 0.14
36 0.11
37 0.08
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.11
48 0.12
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.22
54 0.22
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.1
77 0.15
78 0.22
79 0.27
80 0.3
81 0.39
82 0.41
83 0.41
84 0.42
85 0.4
86 0.39
87 0.38
88 0.37
89 0.32
90 0.32
91 0.32
92 0.29
93 0.25
94 0.22
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.18
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.25
155 0.27
156 0.28
157 0.33
158 0.32
159 0.32
160 0.33
161 0.32
162 0.31
163 0.29
164 0.26
165 0.23
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.1
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.16
216 0.17
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.12
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.23
248 0.31
249 0.36
250 0.37
251 0.4
252 0.4
253 0.4
254 0.39
255 0.33
256 0.25
257 0.22
258 0.2
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.27
263 0.26
264 0.26
265 0.29
266 0.31
267 0.35
268 0.43
269 0.45
270 0.44
271 0.52
272 0.57
273 0.56
274 0.55
275 0.46
276 0.42
277 0.44
278 0.43
279 0.4
280 0.36
281 0.3
282 0.33
283 0.32
284 0.27
285 0.26
286 0.29
287 0.26
288 0.29
289 0.38
290 0.36
291 0.39
292 0.42
293 0.44
294 0.42
295 0.41
296 0.39
297 0.39
298 0.37
299 0.33
300 0.33
301 0.29
302 0.27
303 0.27
304 0.25
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.12
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.18
335 0.24
336 0.3
337 0.39
338 0.45
339 0.55
340 0.65
341 0.68
342 0.7
343 0.74
344 0.73
345 0.66
346 0.6
347 0.51
348 0.49
349 0.5
350 0.46
351 0.45
352 0.45
353 0.5
354 0.57
355 0.65
356 0.67
357 0.73
358 0.81
359 0.82
360 0.86
361 0.9
362 0.93