Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDB8

Protein Details
Accession C5MDB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
532-561MDQKHSNDEKTRNAKRKKDRMVKIGEQLEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
546-549KRKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
KEGG ctp:CTRG_04219  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MSHKALFKGRRFDRDGTPSNSSSRAQSVSRTPLRSDDSDYESDAEEQDYIRIEELLREKLSNLHQQEVELSKEDRISAGDRRQHEALSLNRARIQESSSINDIISSLEFSRNDVSSQSRELLLAQLYKIIVSKSLVVYNEEHTSTPDYVDEDKVSKLINVFTTGNYRSELEFLYLYRALVALICSDIEEFGVLVSTELLNHIEKLITEPANSIVTNENKAQVISGYVTLTLVLHSGASSFGIEDRVAMLMEIGEGYTASATTLKKEVESGDREHSTFITDKNLDKKLINEANSKVNAEASVAVAAIHGVGCLLTLLPQGAFLNEIVEDLMFKLVPLLDNDEDRDIAKAAGRTIGVIYELYDYRQNDDEVNDENYDEDYNVNSPYYEQESLLAILTRLLNLSSKKVAKKDKKDISSVFRNISNTIHAYTNPKDREQIYKRTPDGLELLETTTDPIYIKLSKYRSLKINSWFLYFRLKQLRWCFSFGLHNQLVSNESIRDVLKEPENEFHYGTQNEIDESLLDDDNSEFLHEYMDQKHSNDEKTRNAKRKKDRMVKIGEQLEELNLTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.71
3 0.67
4 0.66
5 0.59
6 0.56
7 0.55
8 0.47
9 0.4
10 0.37
11 0.34
12 0.29
13 0.32
14 0.36
15 0.43
16 0.49
17 0.49
18 0.46
19 0.48
20 0.53
21 0.5
22 0.5
23 0.45
24 0.43
25 0.42
26 0.42
27 0.37
28 0.32
29 0.3
30 0.24
31 0.2
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.16
41 0.2
42 0.24
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.29
47 0.35
48 0.38
49 0.37
50 0.37
51 0.36
52 0.36
53 0.4
54 0.37
55 0.34
56 0.28
57 0.26
58 0.22
59 0.23
60 0.22
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.23
65 0.3
66 0.35
67 0.37
68 0.42
69 0.43
70 0.4
71 0.38
72 0.38
73 0.34
74 0.38
75 0.38
76 0.35
77 0.38
78 0.39
79 0.38
80 0.33
81 0.31
82 0.27
83 0.27
84 0.29
85 0.28
86 0.28
87 0.26
88 0.25
89 0.22
90 0.17
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.21
102 0.2
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.13
120 0.12
121 0.16
122 0.16
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.1
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.03
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.03
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.19
257 0.22
258 0.22
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.18
263 0.16
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.21
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.23
273 0.26
274 0.29
275 0.29
276 0.28
277 0.27
278 0.31
279 0.31
280 0.3
281 0.22
282 0.18
283 0.15
284 0.12
285 0.11
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.02
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.15
356 0.17
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.12
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.1
386 0.11
387 0.14
388 0.19
389 0.24
390 0.28
391 0.35
392 0.45
393 0.52
394 0.61
395 0.69
396 0.72
397 0.72
398 0.75
399 0.73
400 0.71
401 0.7
402 0.64
403 0.56
404 0.49
405 0.46
406 0.41
407 0.36
408 0.31
409 0.24
410 0.21
411 0.2
412 0.18
413 0.22
414 0.25
415 0.33
416 0.33
417 0.32
418 0.34
419 0.35
420 0.44
421 0.45
422 0.51
423 0.5
424 0.56
425 0.56
426 0.58
427 0.56
428 0.48
429 0.44
430 0.35
431 0.29
432 0.22
433 0.21
434 0.15
435 0.15
436 0.14
437 0.11
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.13
443 0.15
444 0.2
445 0.24
446 0.31
447 0.35
448 0.41
449 0.46
450 0.5
451 0.54
452 0.55
453 0.61
454 0.55
455 0.55
456 0.5
457 0.43
458 0.47
459 0.41
460 0.41
461 0.42
462 0.42
463 0.46
464 0.54
465 0.61
466 0.55
467 0.58
468 0.51
469 0.44
470 0.51
471 0.45
472 0.45
473 0.37
474 0.35
475 0.31
476 0.31
477 0.3
478 0.22
479 0.22
480 0.13
481 0.13
482 0.14
483 0.14
484 0.16
485 0.16
486 0.2
487 0.24
488 0.27
489 0.29
490 0.33
491 0.36
492 0.36
493 0.35
494 0.33
495 0.33
496 0.3
497 0.29
498 0.25
499 0.22
500 0.21
501 0.19
502 0.17
503 0.12
504 0.13
505 0.15
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.08
514 0.08
515 0.1
516 0.1
517 0.13
518 0.17
519 0.23
520 0.25
521 0.25
522 0.34
523 0.37
524 0.43
525 0.48
526 0.5
527 0.54
528 0.62
529 0.72
530 0.74
531 0.79
532 0.82
533 0.85
534 0.9
535 0.91
536 0.91
537 0.9
538 0.9
539 0.89
540 0.87
541 0.85
542 0.8
543 0.7
544 0.61
545 0.52
546 0.44