Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4H7

Protein Details
Accession C5M4H7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-168VEGPSKPAKKERTKQDKDREEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-157KPAKKER
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
IPR003903  UIM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0033565  C:ESCRT-0 complex  
GO:0005774  C:vacuolar membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0019904  F:protein domain specific binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0045324  P:late endosome to vacuole transport  
GO:0016237  P:lysosomal microautophagy  
GO:0071985  P:multivesicular body sorting pathway  
GO:1903319  P:positive regulation of protein maturation  
GO:0009306  P:protein secretion  
GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0043162  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
KEGG ctp:CTRG_00967  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00018  SH3_1  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50002  SH3  
PS50330  UIM  
PS50179  VHS  
CDD cd11805  SH3_GRB2_like_C  
cd16978  VHS_HSE1  
Amino Acid Sequences MPSLESLINKATDPTLTSDNWQYIFDVCDKISNDPETATKEAIATLKTKLASKDANVVLRTLALLTAVAENCGSRVKQEIATKSFLQDCLIKRLSDKKLHPAVKTKICEVLSQLYNTFKVDPSLKPMTDAYNKAKHDYPQYFNKKVEGPSKPAKKERTKQDKDREEEELQRALKLSLHEYEQQSKIEKKEYLNNKPLPEPKPEPESPPVETVATVSKVRALYDLISYEPDELSFRKGDVITVIESVYRDWWRGSLTNGKVGIFPLNYVTPIVNKSPAEIAKELELENRLINGEKKKIEKLLAILSSQNIDNINEDEVTSLYNEIIPLRIQLGAAIDKYSVRKEELLGLNQQLNNEVKLYNELLDKSISSRAQQNTGGLMYQQTAPYPMQQQQHQGPSQTQQSQIPQQHTQSQQLPPQYTQSQPLHQQQQQYSGYAGANNMPPPATTFNQYVPPQLQELQPQETSAGFGNAVYNRPQPTSQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.24
5 0.27
6 0.29
7 0.29
8 0.28
9 0.25
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.21
14 0.18
15 0.22
16 0.23
17 0.26
18 0.3
19 0.3
20 0.28
21 0.26
22 0.3
23 0.29
24 0.3
25 0.27
26 0.22
27 0.2
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.18
32 0.17
33 0.2
34 0.21
35 0.24
36 0.24
37 0.28
38 0.3
39 0.3
40 0.37
41 0.38
42 0.42
43 0.39
44 0.37
45 0.32
46 0.28
47 0.26
48 0.17
49 0.12
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.14
60 0.13
61 0.1
62 0.14
63 0.17
64 0.23
65 0.3
66 0.36
67 0.38
68 0.42
69 0.42
70 0.41
71 0.41
72 0.35
73 0.31
74 0.29
75 0.28
76 0.31
77 0.33
78 0.3
79 0.31
80 0.39
81 0.45
82 0.48
83 0.49
84 0.5
85 0.58
86 0.63
87 0.64
88 0.65
89 0.66
90 0.66
91 0.65
92 0.57
93 0.53
94 0.49
95 0.45
96 0.39
97 0.38
98 0.31
99 0.3
100 0.3
101 0.25
102 0.25
103 0.25
104 0.23
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.18
109 0.23
110 0.28
111 0.27
112 0.28
113 0.29
114 0.31
115 0.34
116 0.38
117 0.37
118 0.39
119 0.4
120 0.41
121 0.43
122 0.41
123 0.44
124 0.45
125 0.44
126 0.47
127 0.55
128 0.57
129 0.54
130 0.54
131 0.49
132 0.48
133 0.51
134 0.45
135 0.44
136 0.49
137 0.57
138 0.6
139 0.63
140 0.68
141 0.69
142 0.73
143 0.77
144 0.79
145 0.79
146 0.83
147 0.86
148 0.86
149 0.81
150 0.76
151 0.71
152 0.63
153 0.6
154 0.53
155 0.47
156 0.38
157 0.34
158 0.3
159 0.24
160 0.22
161 0.18
162 0.17
163 0.13
164 0.16
165 0.2
166 0.22
167 0.27
168 0.26
169 0.27
170 0.28
171 0.3
172 0.29
173 0.29
174 0.3
175 0.27
176 0.34
177 0.42
178 0.47
179 0.53
180 0.55
181 0.52
182 0.54
183 0.59
184 0.53
185 0.51
186 0.47
187 0.41
188 0.45
189 0.44
190 0.43
191 0.4
192 0.41
193 0.35
194 0.32
195 0.3
196 0.22
197 0.21
198 0.18
199 0.15
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.13
241 0.19
242 0.2
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.22
247 0.22
248 0.22
249 0.13
250 0.13
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.14
278 0.16
279 0.2
280 0.23
281 0.25
282 0.28
283 0.3
284 0.31
285 0.28
286 0.27
287 0.28
288 0.26
289 0.24
290 0.22
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.15
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.23
331 0.26
332 0.27
333 0.28
334 0.28
335 0.3
336 0.3
337 0.29
338 0.25
339 0.21
340 0.19
341 0.18
342 0.16
343 0.12
344 0.14
345 0.15
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.19
354 0.17
355 0.17
356 0.24
357 0.25
358 0.29
359 0.3
360 0.29
361 0.26
362 0.26
363 0.24
364 0.17
365 0.15
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.1
370 0.12
371 0.13
372 0.16
373 0.19
374 0.23
375 0.26
376 0.29
377 0.36
378 0.4
379 0.47
380 0.46
381 0.44
382 0.41
383 0.41
384 0.46
385 0.42
386 0.38
387 0.35
388 0.38
389 0.44
390 0.48
391 0.48
392 0.46
393 0.46
394 0.51
395 0.5
396 0.51
397 0.49
398 0.49
399 0.48
400 0.5
401 0.5
402 0.44
403 0.47
404 0.44
405 0.4
406 0.43
407 0.42
408 0.41
409 0.45
410 0.52
411 0.55
412 0.54
413 0.6
414 0.54
415 0.58
416 0.54
417 0.48
418 0.4
419 0.34
420 0.32
421 0.25
422 0.23
423 0.18
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.17
428 0.16
429 0.19
430 0.24
431 0.22
432 0.23
433 0.25
434 0.27
435 0.35
436 0.36
437 0.37
438 0.34
439 0.34
440 0.34
441 0.33
442 0.33
443 0.33
444 0.37
445 0.37
446 0.34
447 0.32
448 0.3
449 0.28
450 0.26
451 0.2
452 0.17
453 0.11
454 0.11
455 0.16
456 0.17
457 0.19
458 0.21
459 0.25
460 0.27
461 0.3