Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6HRN3

Protein Details
Accession A0A5N6HRN3    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-230YIKGSSEKAKREKARKEKNVLEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-50KAIDKPAPRVGKRDAPKEAPS
90-99EGGARRGGRA
213-224EKAKREKARKEK
238-266RGTSGPRGRGGRGGRGARGGRGSGPRPER
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLGNDPELDPSRPPAPPTKAIDKPAPRVGKRDAPKEAPSQPRAGQNSRRGNNVSGNEAAFRDRNAGRNQNREKPTDEREGGARRGGRARNDRQSRTGQTDSGKKVNQGWGGQSGEKELDDERAGEKIAQADENEPQTPAEEAEPAEKAKSYNDYLAEKAAAGDFSAKPVRAANEGSKADSKWANAKEFKREEDENYIKGSSEKAKREKARKEKNVLEVDMRFVEAPRGTSGPRGRGGRGGRGARGGRGSGPRPERTERSAPVTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.23
5 0.25
6 0.23
7 0.19
8 0.2
9 0.24
10 0.24
11 0.27
12 0.33
13 0.37
14 0.43
15 0.48
16 0.53
17 0.55
18 0.59
19 0.65
20 0.63
21 0.63
22 0.64
23 0.67
24 0.59
25 0.59
26 0.6
27 0.6
28 0.61
29 0.62
30 0.6
31 0.57
32 0.6
33 0.61
34 0.64
35 0.63
36 0.59
37 0.56
38 0.52
39 0.55
40 0.56
41 0.57
42 0.57
43 0.58
44 0.65
45 0.62
46 0.64
47 0.58
48 0.55
49 0.55
50 0.48
51 0.42
52 0.34
53 0.32
54 0.28
55 0.25
56 0.24
57 0.18
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.23
62 0.28
63 0.37
64 0.41
65 0.51
66 0.58
67 0.62
68 0.64
69 0.61
70 0.59
71 0.55
72 0.55
73 0.53
74 0.47
75 0.39
76 0.41
77 0.43
78 0.39
79 0.37
80 0.33
81 0.26
82 0.32
83 0.34
84 0.36
85 0.41
86 0.47
87 0.53
88 0.6
89 0.61
90 0.59
91 0.62
92 0.59
93 0.57
94 0.51
95 0.43
96 0.39
97 0.44
98 0.43
99 0.41
100 0.38
101 0.32
102 0.33
103 0.35
104 0.34
105 0.28
106 0.25
107 0.24
108 0.24
109 0.24
110 0.21
111 0.17
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.12
157 0.1
158 0.07
159 0.06
160 0.08
161 0.07
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.23
172 0.24
173 0.26
174 0.26
175 0.25
176 0.25
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.26
181 0.29
182 0.35
183 0.37
184 0.44
185 0.45
186 0.47
187 0.45
188 0.43
189 0.41
190 0.44
191 0.45
192 0.37
193 0.36
194 0.33
195 0.28
196 0.26
197 0.25
198 0.24
199 0.27
200 0.34
201 0.39
202 0.49
203 0.57
204 0.67
205 0.75
206 0.78
207 0.81
208 0.83
209 0.84
210 0.82
211 0.83
212 0.8
213 0.71
214 0.66
215 0.55
216 0.49
217 0.4
218 0.34
219 0.25
220 0.18
221 0.2
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.24
228 0.29
229 0.3
230 0.36
231 0.37
232 0.36
233 0.42
234 0.45
235 0.46
236 0.5
237 0.48
238 0.43
239 0.48
240 0.48
241 0.44
242 0.43
243 0.36
244 0.33
245 0.36
246 0.38
247 0.39
248 0.45
249 0.47
250 0.51
251 0.57
252 0.57
253 0.57
254 0.62
255 0.57
256 0.58
257 0.57
258 0.51
259 0.49
260 0.47
261 0.44
262 0.4
263 0.39
264 0.34
265 0.32
266 0.31