FuNGI

C5M3W9

Protein Details

Accession

C5M3W9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-88	AEEYKLMQLKKEKREREKKQKEKEKKEMEMANKKH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
63-81	KKEKREREKKQKEKEKKEM

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034261 CNOT4_RRM IPR039780 Mot2 IPR039515 NOT4_mRING-HC-C4C4 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk IPR000571 Znf_CCCH IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0030015 C:CCR4-NOT core complex GO:0005737 C:cytoplasm GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0031087 P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0010498 P:proteasomal protein catabolic process GO:0000209 P:protein polyubiquitination
KEGG	ctp:CTRG_00758 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF14570 zf-RING_4
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM PS50103 ZF_C3H1
CDD	cd16618 mRING-HC-C4C4_CNOT4 cd12438 RRM_CNOT4

Amino Acid Sequences

MDISDKNFKPCPCGYQICQFCYNNIRQNPELNGRCPGCRRLYDDESVEYKTVSAEEYKLMQLKKEKREREKKQKEKEKKEMEMANKKHLAGLRVVQKNLVYVTGLNPPCNPDDLHSVLRSDKYFGQYGKISKIVINKKSPNPQTTSHHHQNPGLVVYVTFARKEDALRCITELDGSLCDGRVLRAAHGTTKYCSSYLRGHPCPNPNCMFLHEPGEEADSYTRKDLSTQQGIKMGMTTGSHTTSFGEDSDHLGHQLSDDESQPHSSMQHQQASHEVHREHLPSTAHWATTGTTSGSNSPSVNNNIPLANSAAFPTLGEIARDMKQQQKKEVKPRVKAAKSNNVPTSDDIDLDDNSVLKFAESTSEQLRDLDDVRNVRFKSFDTGKILPLFNFRGDFTNDIKPEDEKVIARQVIERFLLRPIKNYHLAYQNHPIMQQQAMLQRQQQVQQRTPGLQAAQLQQQKNEEQQKQAQQQLLLLQLQHQQQLQQQQQQLQQQQQQSQLANQLNTLKVADRLNTSTPPPPGLFTAKVAGAPAEVASTVGAGNPSSSSQLLTQLMSGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.54
3	0.6
4	0.58
5	0.63
6	0.57
7	0.53
8	0.54
9	0.57
10	0.56
11	0.54
12	0.56
13	0.5
14	0.55
15	0.57
16	0.6
17	0.57
18	0.5
19	0.54
20	0.49
21	0.52
22	0.52
23	0.52
24	0.49
25	0.48
26	0.52
27	0.53
28	0.56
29	0.56
30	0.55
31	0.53
32	0.49
33	0.47
34	0.4
35	0.31
36	0.26
37	0.2
38	0.17
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.14
43	0.16
44	0.19
45	0.24
46	0.24
47	0.28
48	0.35
49	0.43
50	0.51
51	0.59
52	0.66
53	0.72
54	0.82
55	0.88
56	0.9
57	0.93
58	0.93
59	0.94
60	0.95
61	0.95
62	0.95
63	0.95
64	0.93
65	0.88
66	0.86
67	0.82
68	0.81
69	0.81
70	0.74
71	0.72
72	0.65
73	0.59
74	0.54
75	0.49
76	0.41
77	0.34
78	0.37
79	0.37
80	0.39
81	0.4
82	0.38
83	0.35
84	0.35
85	0.32
86	0.25
87	0.17
88	0.12
89	0.14
90	0.21
91	0.22
92	0.21
93	0.21
94	0.23
95	0.24
96	0.25
97	0.23
98	0.17
99	0.22
100	0.26
101	0.28
102	0.27
103	0.27
104	0.27
105	0.3
106	0.28
107	0.25
108	0.24
109	0.24
110	0.27
111	0.26
112	0.28
113	0.3
114	0.32
115	0.33
116	0.31
117	0.28
118	0.27
119	0.35
120	0.39
121	0.42
122	0.48
123	0.51
124	0.56
125	0.65
126	0.69
127	0.65
128	0.61
129	0.6
130	0.58
131	0.59
132	0.61
133	0.6
134	0.6
135	0.58
136	0.55
137	0.52
138	0.47
139	0.4
140	0.32
141	0.23
142	0.17
143	0.15
144	0.16
145	0.14
146	0.12
147	0.11
148	0.11
149	0.12
150	0.14
151	0.17
152	0.19
153	0.2
154	0.21
155	0.21
156	0.21
157	0.2
158	0.18
159	0.15
160	0.12
161	0.09
162	0.1
163	0.09
164	0.08
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.14
172	0.15
173	0.18
174	0.21
175	0.23
176	0.2
177	0.22
178	0.23
179	0.2
180	0.2
181	0.2
182	0.24
183	0.31
184	0.39
185	0.4
186	0.44
187	0.49
188	0.58
189	0.57
190	0.55
191	0.5
192	0.42
193	0.39
194	0.38
195	0.35
196	0.27
197	0.29
198	0.23
199	0.21
200	0.19
201	0.2
202	0.16
203	0.13
204	0.14
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.1
210	0.12
211	0.17
212	0.22
213	0.3
214	0.31
215	0.32
216	0.35
217	0.36
218	0.34
219	0.28
220	0.21
221	0.13
222	0.11
223	0.11
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.1
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.1
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.17
253	0.2
254	0.25
255	0.24
256	0.24
257	0.29
258	0.33
259	0.32
260	0.29
261	0.25
262	0.21
263	0.23
264	0.24
265	0.19
266	0.18
267	0.18
268	0.13
269	0.2
270	0.19
271	0.17
272	0.16
273	0.16
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.08
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.1
284	0.11
285	0.13
286	0.16
287	0.16
288	0.16
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.13
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.09
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.19
310	0.25
311	0.28
312	0.37
313	0.44
314	0.5
315	0.59
316	0.68
317	0.68
318	0.68
319	0.75
320	0.76
321	0.72
322	0.71
323	0.68
324	0.69
325	0.65
326	0.66
327	0.61
328	0.53
329	0.49
330	0.44
331	0.41
332	0.3
333	0.26
334	0.19
335	0.17
336	0.14
337	0.14
338	0.12
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.07
347	0.07
348	0.1
349	0.12
350	0.14
351	0.14
352	0.14
353	0.15
354	0.14
355	0.15
356	0.15
357	0.17
358	0.18
359	0.19
360	0.26
361	0.26
362	0.25
363	0.24
364	0.22
365	0.27
366	0.28
367	0.31
368	0.31
369	0.33
370	0.35
371	0.38
372	0.37
373	0.3
374	0.3
375	0.27
376	0.22
377	0.21
378	0.19
379	0.18
380	0.2
381	0.22
382	0.22
383	0.27
384	0.27
385	0.27
386	0.27
387	0.25
388	0.25
389	0.24
390	0.23
391	0.16
392	0.18
393	0.23
394	0.23
395	0.23
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.26
400	0.24
401	0.19
402	0.24
403	0.32
404	0.28
405	0.32
406	0.34
407	0.38
408	0.44
409	0.45
410	0.44
411	0.44
412	0.46
413	0.45
414	0.49
415	0.47
416	0.41
417	0.4
418	0.36
419	0.29
420	0.28
421	0.24
422	0.19
423	0.22
424	0.23
425	0.25
426	0.27
427	0.31
428	0.33
429	0.37
430	0.41
431	0.42
432	0.44
433	0.49
434	0.5
435	0.45
436	0.44
437	0.41
438	0.35
439	0.3
440	0.29
441	0.26
442	0.31
443	0.35
444	0.34
445	0.34
446	0.37
447	0.37
448	0.41
449	0.47
450	0.43
451	0.43
452	0.5
453	0.56
454	0.6
455	0.62
456	0.57
457	0.48
458	0.46
459	0.43
460	0.39
461	0.31
462	0.24
463	0.21
464	0.24
465	0.25
466	0.26
467	0.24
468	0.22
469	0.26
470	0.35
471	0.39
472	0.4
473	0.43
474	0.46
475	0.51
476	0.56
477	0.58
478	0.56
479	0.57
480	0.55
481	0.56
482	0.56
483	0.55
484	0.48
485	0.45
486	0.45
487	0.43
488	0.38
489	0.36
490	0.34
491	0.3
492	0.3
493	0.28
494	0.21
495	0.21
496	0.23
497	0.23
498	0.22
499	0.26
500	0.29
501	0.31
502	0.33
503	0.35
504	0.35
505	0.36
506	0.33
507	0.31
508	0.31
509	0.34
510	0.32
511	0.29
512	0.3
513	0.27
514	0.26
515	0.25
516	0.21
517	0.15
518	0.14
519	0.11
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.1
532	0.12
533	0.12
534	0.13
535	0.13
536	0.19
537	0.2
538	0.2
539	0.21

C5M3W9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer