Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M2R9

Protein Details
Accession C5M2R9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGSKRKKKEKQKDFVKAKLKVGKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-22KRKKKEKQKDFVKAKLKVG
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00358  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSKRKKKEKQKDFVKAKLKVGKTAQKPDNYTDTSFKAKTISLPNQSIASNVKSKSSGSSGTSTSSSGSDKVSLAALNHQLSLTKHHSPNTRKEVLLYLQTHLPANPSYYKNIMTSILPLILDEDKDVRKALMELISAIAAKQPGLIDLHLRSMILFILSAMSHIVPNIRTTSTHFLKIVVENSHGNLLNSYFVKVMRNYFVLMGWSLNEQDSASKSVAITNLSLNAMNAGSKIARVGHLQNLNKFLSKSLQYDDGKDSGELQMEVSIHPQSYRYLLNNTIQPYQPLKLFVNEFKSDLHNTDGISMLDLNSISTEDLDTRKKIMNDVFKPLLIKNLNAFVKEGGDIGREANNCISIINETCIDKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.9
3 0.85
4 0.83
5 0.81
6 0.72
7 0.69
8 0.69
9 0.69
10 0.68
11 0.72
12 0.7
13 0.69
14 0.7
15 0.67
16 0.67
17 0.61
18 0.56
19 0.5
20 0.47
21 0.46
22 0.43
23 0.38
24 0.32
25 0.29
26 0.31
27 0.36
28 0.41
29 0.42
30 0.44
31 0.45
32 0.45
33 0.44
34 0.4
35 0.34
36 0.29
37 0.28
38 0.25
39 0.26
40 0.25
41 0.26
42 0.27
43 0.27
44 0.27
45 0.24
46 0.27
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.24
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.16
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.18
69 0.24
70 0.25
71 0.28
72 0.3
73 0.35
74 0.44
75 0.48
76 0.58
77 0.6
78 0.59
79 0.51
80 0.5
81 0.49
82 0.43
83 0.45
84 0.36
85 0.29
86 0.27
87 0.28
88 0.27
89 0.22
90 0.21
91 0.14
92 0.16
93 0.19
94 0.19
95 0.21
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.23
100 0.22
101 0.16
102 0.17
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.06
143 0.05
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.13
159 0.2
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.22
165 0.23
166 0.22
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.15
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.12
225 0.17
226 0.25
227 0.28
228 0.3
229 0.33
230 0.33
231 0.32
232 0.3
233 0.25
234 0.22
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.28
239 0.27
240 0.3
241 0.32
242 0.29
243 0.26
244 0.24
245 0.23
246 0.16
247 0.16
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.18
263 0.22
264 0.25
265 0.29
266 0.31
267 0.31
268 0.29
269 0.3
270 0.3
271 0.28
272 0.26
273 0.26
274 0.24
275 0.25
276 0.29
277 0.3
278 0.33
279 0.33
280 0.32
281 0.3
282 0.32
283 0.3
284 0.28
285 0.27
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.13
304 0.18
305 0.19
306 0.21
307 0.26
308 0.27
309 0.32
310 0.37
311 0.43
312 0.43
313 0.5
314 0.5
315 0.46
316 0.48
317 0.43
318 0.44
319 0.35
320 0.33
321 0.28
322 0.34
323 0.34
324 0.33
325 0.34
326 0.26
327 0.26
328 0.24
329 0.22
330 0.14
331 0.13
332 0.13
333 0.14
334 0.18
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.2
339 0.19
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.17
344 0.18
345 0.19