Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCV6

Protein Details
Accession C5MCV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-90IKLPSDFKQQQQQQSKRKQKSRNEGLVDDHydrophilic
95-119ASKPNTPRPNTPKLRNPKPQQTAPYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
KEGG ctp:CTRG_04057  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51385  YJEF_N  
Amino Acid Sequences MTEFLNYTVDLTLKDGTRSSGLISHVDGQQIILSNAIHSVQPRKVVPSFNISSTEIADLKVIKLPSDFKQQQQQQSKRKQKSRNEGLVDDAILFASKPNTPRPNTPKLRNPKPQQTAPYTGGSEQPDWDDSSDIQEIKSSNDFDFQANLAMFDKKSVFADFQKRDHTSINDRLVGHNKIENVNKTKKEKYDNNEMVLEQNRVDNWDNIGTAANSKAGTPVIHQSSYKEQQNQNLKLINPVNLATVPSASPVQLLEIERLSTDTYGITPAMMAEVCAINLSQLIMESVLGGASRLSNKKNHNLPPLVLLLIGSSRGGSRAFATGRHLTNHGVRVLAFMINTEEVDSDLQQQWKLFESAGGKVVIGNVLELLDIVNNQLDTPVEVIIDALQGYDDHLEDVFYQEEDQVTLRKLMKWCNEPQQQNKIMSLDIPSGIDGGSGTLSDDSLKLNCRWCISMGLPLSGIILAYKNGNMSSTDDEVIHYVVDIGIPNKVYSNKGNLRKFDKFWFSAEASLKLEVSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.2
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.24
12 0.24
13 0.24
14 0.22
15 0.18
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.13
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.19
27 0.2
28 0.26
29 0.28
30 0.33
31 0.36
32 0.4
33 0.4
34 0.43
35 0.43
36 0.39
37 0.42
38 0.37
39 0.34
40 0.31
41 0.31
42 0.22
43 0.19
44 0.19
45 0.16
46 0.15
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.17
51 0.21
52 0.23
53 0.33
54 0.36
55 0.36
56 0.46
57 0.53
58 0.6
59 0.67
60 0.73
61 0.72
62 0.8
63 0.86
64 0.87
65 0.89
66 0.89
67 0.88
68 0.89
69 0.9
70 0.89
71 0.84
72 0.75
73 0.7
74 0.62
75 0.52
76 0.4
77 0.29
78 0.19
79 0.13
80 0.11
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.13
85 0.22
86 0.3
87 0.34
88 0.44
89 0.51
90 0.6
91 0.66
92 0.72
93 0.73
94 0.76
95 0.83
96 0.83
97 0.84
98 0.84
99 0.83
100 0.82
101 0.79
102 0.76
103 0.72
104 0.65
105 0.59
106 0.5
107 0.42
108 0.4
109 0.35
110 0.29
111 0.23
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.15
117 0.13
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.16
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.17
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.19
146 0.29
147 0.32
148 0.35
149 0.41
150 0.42
151 0.42
152 0.43
153 0.41
154 0.39
155 0.43
156 0.43
157 0.4
158 0.39
159 0.4
160 0.42
161 0.39
162 0.33
163 0.27
164 0.25
165 0.25
166 0.29
167 0.32
168 0.34
169 0.4
170 0.44
171 0.48
172 0.51
173 0.53
174 0.57
175 0.59
176 0.58
177 0.62
178 0.59
179 0.57
180 0.53
181 0.47
182 0.42
183 0.36
184 0.31
185 0.2
186 0.16
187 0.13
188 0.15
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.13
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.18
211 0.24
212 0.29
213 0.32
214 0.33
215 0.33
216 0.39
217 0.49
218 0.49
219 0.45
220 0.43
221 0.39
222 0.38
223 0.38
224 0.32
225 0.23
226 0.21
227 0.18
228 0.15
229 0.16
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.07
280 0.1
281 0.12
282 0.18
283 0.22
284 0.3
285 0.38
286 0.44
287 0.48
288 0.48
289 0.46
290 0.43
291 0.4
292 0.33
293 0.25
294 0.18
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.17
309 0.21
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.25
315 0.28
316 0.23
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.14
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.1
333 0.12
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.16
395 0.17
396 0.21
397 0.24
398 0.32
399 0.38
400 0.43
401 0.48
402 0.54
403 0.61
404 0.64
405 0.69
406 0.72
407 0.7
408 0.66
409 0.61
410 0.52
411 0.44
412 0.36
413 0.31
414 0.23
415 0.17
416 0.15
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.08
431 0.1
432 0.14
433 0.17
434 0.22
435 0.25
436 0.27
437 0.28
438 0.28
439 0.31
440 0.28
441 0.33
442 0.29
443 0.28
444 0.25
445 0.23
446 0.22
447 0.17
448 0.15
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.15
459 0.19
460 0.2
461 0.21
462 0.2
463 0.2
464 0.21
465 0.19
466 0.16
467 0.11
468 0.08
469 0.07
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.11
475 0.12
476 0.15
477 0.17
478 0.21
479 0.23
480 0.33
481 0.4
482 0.49
483 0.56
484 0.6
485 0.67
486 0.7
487 0.7
488 0.69
489 0.68
490 0.61
491 0.57
492 0.56
493 0.49
494 0.49
495 0.48
496 0.43
497 0.36
498 0.35