Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M8K6

Protein Details
Accession C5M8K6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-130LQQQQQQQQQQRQRQQQQLQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039637  CNOT7/CNOT8/Pop2  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
KEGG ctp:CTRG_02728  -  
Amino Acid Sequences MMNLNPHLQYLQQQQQQSQGQQQSVQQQQPQAGQTQSGQSPQLSQLQLQQLQRQQLLQQQTSQSQPQITTPTSANPLLAILNGGSANSNTTSTPGSLSSNPVLQQLQLQQLQQQQQQQQQQRQRQQQQLQQAQFQQLQAQQIQQAQQQQQQQQQVQPVAPQSIPIIKEVWAHNLEHEFQSLRTFINDKTSKIYISIHQEIPGIVARPVGTFKSSSDYHFQTLRTNSDLLNLIQLSLCVVKITKNDVISSSIIWQFNFLYDLSKEMYNEEHLSLLSQSSQINFQLHSTQGIPHFDFSELMIESGLILDDNINWISFHAGYDLGFFVSLLSNRDLPVDEPDFYWWCGKYFPNYYDLKYIGNQILNKNSGLTNGTNTPDDKSNSNNKPSIEYLAEELHLLPISPAIRQHFTNSSSTASNTNASFHSQQLSSTLHAYLSMECFKELLRRSNIAVLNRFKGIIWGLGSFNANGSTSNATTNTSTSVNNDDSFTATTAAAIRMNGISTPSTPVASINKGGMVHFGGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.5
3 0.55
4 0.53
5 0.52
6 0.49
7 0.45
8 0.45
9 0.48
10 0.49
11 0.51
12 0.52
13 0.47
14 0.45
15 0.47
16 0.48
17 0.46
18 0.41
19 0.34
20 0.31
21 0.29
22 0.31
23 0.29
24 0.27
25 0.27
26 0.23
27 0.25
28 0.26
29 0.31
30 0.26
31 0.25
32 0.29
33 0.35
34 0.41
35 0.41
36 0.45
37 0.43
38 0.47
39 0.47
40 0.42
41 0.37
42 0.38
43 0.43
44 0.38
45 0.38
46 0.37
47 0.39
48 0.42
49 0.42
50 0.38
51 0.33
52 0.32
53 0.3
54 0.32
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.28
60 0.28
61 0.24
62 0.19
63 0.18
64 0.16
65 0.14
66 0.11
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.16
84 0.2
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.23
89 0.22
90 0.18
91 0.21
92 0.21
93 0.25
94 0.24
95 0.24
96 0.26
97 0.31
98 0.36
99 0.37
100 0.39
101 0.39
102 0.44
103 0.52
104 0.56
105 0.6
106 0.64
107 0.7
108 0.73
109 0.77
110 0.79
111 0.8
112 0.8
113 0.76
114 0.78
115 0.77
116 0.7
117 0.64
118 0.58
119 0.53
120 0.48
121 0.42
122 0.35
123 0.29
124 0.29
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.22
129 0.24
130 0.23
131 0.27
132 0.27
133 0.31
134 0.36
135 0.38
136 0.42
137 0.46
138 0.47
139 0.43
140 0.45
141 0.42
142 0.36
143 0.33
144 0.29
145 0.25
146 0.21
147 0.19
148 0.15
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.15
153 0.13
154 0.18
155 0.18
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.2
160 0.21
161 0.22
162 0.18
163 0.19
164 0.14
165 0.12
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.21
173 0.23
174 0.22
175 0.26
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.26
180 0.21
181 0.26
182 0.29
183 0.26
184 0.25
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.14
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.13
200 0.14
201 0.16
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.24
206 0.24
207 0.24
208 0.26
209 0.25
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.15
216 0.15
217 0.13
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.2
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.19
334 0.23
335 0.23
336 0.28
337 0.29
338 0.3
339 0.32
340 0.32
341 0.28
342 0.23
343 0.26
344 0.22
345 0.24
346 0.25
347 0.24
348 0.28
349 0.27
350 0.26
351 0.24
352 0.21
353 0.19
354 0.19
355 0.17
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.2
362 0.22
363 0.23
364 0.21
365 0.25
366 0.33
367 0.38
368 0.43
369 0.44
370 0.41
371 0.43
372 0.43
373 0.41
374 0.32
375 0.27
376 0.23
377 0.21
378 0.2
379 0.16
380 0.15
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.12
389 0.15
390 0.18
391 0.18
392 0.23
393 0.25
394 0.28
395 0.3
396 0.29
397 0.27
398 0.26
399 0.26
400 0.24
401 0.21
402 0.21
403 0.18
404 0.19
405 0.17
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.21
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.21
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.14
418 0.14
419 0.15
420 0.13
421 0.15
422 0.17
423 0.16
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.22
428 0.25
429 0.3
430 0.32
431 0.34
432 0.36
433 0.44
434 0.47
435 0.46
436 0.49
437 0.46
438 0.44
439 0.42
440 0.4
441 0.32
442 0.31
443 0.26
444 0.21
445 0.18
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.19
450 0.17
451 0.16
452 0.14
453 0.13
454 0.11
455 0.13
456 0.15
457 0.14
458 0.17
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.19
463 0.19
464 0.17
465 0.17
466 0.18
467 0.23
468 0.23
469 0.23
470 0.24
471 0.22
472 0.22
473 0.23
474 0.22
475 0.18
476 0.15
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.15
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.2
494 0.23
495 0.26
496 0.27
497 0.23
498 0.24
499 0.24
500 0.25
501 0.24
502 0.22