Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4W6

Protein Details
Accession C5M4W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
674-699SPSPRTINAEDPKKKRKPSMSSLGDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
685-703PKKKRKPSMSSLGDGKRRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
KEGG ctp:CTRG_01944  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MSVSFLDMNTNHNNQGINQSLMMNGNNNSGNQQQQPPPPPPGQQQMFNQTPQMQYSQGPQPGPQVRNSSVPPPPPPPPQQQMGQPQMQQQQRFNMNMPQQMSQQQMMAAQQQLQQQQQQQQQAAMAAASGRAMPSKNAAFNGAPTNGQSVQLSGTNGVATNSNGGNNNNNNSKTVSYNPNGLMSSLPSANLQSQSASTSRVHTPHMGNQPQPFIPQQMQPQQIQPQQGPNQQHSGPPAPNQQQMLKKGNAGNTSVAATPKNGTIGSASGPASSQQYPSFAQSSGQSFGMPPNTANNNQPLQTQFGPQTQQQQQQQGQHPTISGRSPISRQTLPANGSQEVNNAISEQFQQEINTRIIKRNLGNTAIIRILDLIDFISNQSYENLSNIDFWTRITPANFLPSAILKFNFLGNGSSGTSLHEVTGLNLNFLQLNADSNNPNSPHQFELNTSTAPRFFVSCVQAKTIIRCSITLSGSKFQVLNNGSIIIVLKIELHFNYQDGSNSVSRGTVKILMSRDLRIEWIDLNCADYQGNISMSALETKLKAIIDSKKDFKKQKESLDEMISTSHAVRLGATSGIDAQSMRILQLGDIMTSMKSLMEFSVVNNVSSPLRSLELLITSQGAQQAQALQAQMAAQAHFQAANASGANSFIGSQQSQVKKNLASAANNNGNNTVSSPSPRTINAEDPKKKRKPSMSSLGDGKRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.32
3 0.31
4 0.27
5 0.25
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.25
10 0.21
11 0.18
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.23
16 0.24
17 0.27
18 0.29
19 0.35
20 0.37
21 0.45
22 0.51
23 0.53
24 0.57
25 0.56
26 0.57
27 0.57
28 0.6
29 0.56
30 0.55
31 0.57
32 0.59
33 0.59
34 0.55
35 0.52
36 0.46
37 0.43
38 0.39
39 0.35
40 0.27
41 0.24
42 0.29
43 0.33
44 0.34
45 0.33
46 0.31
47 0.38
48 0.45
49 0.46
50 0.46
51 0.45
52 0.43
53 0.47
54 0.49
55 0.47
56 0.44
57 0.48
58 0.48
59 0.47
60 0.5
61 0.53
62 0.57
63 0.59
64 0.58
65 0.57
66 0.56
67 0.58
68 0.61
69 0.6
70 0.58
71 0.52
72 0.54
73 0.57
74 0.59
75 0.56
76 0.5
77 0.51
78 0.51
79 0.51
80 0.47
81 0.47
82 0.47
83 0.47
84 0.46
85 0.4
86 0.37
87 0.39
88 0.4
89 0.33
90 0.28
91 0.23
92 0.22
93 0.21
94 0.22
95 0.19
96 0.17
97 0.2
98 0.24
99 0.28
100 0.29
101 0.32
102 0.34
103 0.41
104 0.45
105 0.47
106 0.44
107 0.41
108 0.39
109 0.35
110 0.3
111 0.21
112 0.15
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.13
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.23
126 0.21
127 0.23
128 0.27
129 0.23
130 0.2
131 0.18
132 0.22
133 0.19
134 0.2
135 0.17
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.2
153 0.23
154 0.28
155 0.31
156 0.32
157 0.31
158 0.31
159 0.31
160 0.28
161 0.3
162 0.32
163 0.28
164 0.32
165 0.32
166 0.32
167 0.31
168 0.28
169 0.23
170 0.17
171 0.18
172 0.13
173 0.13
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.2
188 0.22
189 0.25
190 0.27
191 0.32
192 0.41
193 0.41
194 0.41
195 0.42
196 0.43
197 0.39
198 0.38
199 0.31
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.28
204 0.33
205 0.36
206 0.35
207 0.38
208 0.41
209 0.42
210 0.41
211 0.36
212 0.36
213 0.38
214 0.43
215 0.42
216 0.38
217 0.39
218 0.37
219 0.37
220 0.33
221 0.33
222 0.29
223 0.29
224 0.34
225 0.33
226 0.36
227 0.36
228 0.38
229 0.39
230 0.44
231 0.46
232 0.39
233 0.39
234 0.38
235 0.4
236 0.37
237 0.32
238 0.27
239 0.22
240 0.22
241 0.19
242 0.17
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.13
263 0.14
264 0.16
265 0.17
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.13
277 0.11
278 0.14
279 0.17
280 0.19
281 0.2
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.23
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.2
290 0.18
291 0.19
292 0.21
293 0.2
294 0.27
295 0.28
296 0.34
297 0.35
298 0.4
299 0.41
300 0.46
301 0.51
302 0.47
303 0.43
304 0.37
305 0.35
306 0.29
307 0.27
308 0.2
309 0.15
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.18
314 0.21
315 0.2
316 0.21
317 0.22
318 0.25
319 0.25
320 0.27
321 0.25
322 0.21
323 0.22
324 0.2
325 0.18
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.2
343 0.22
344 0.24
345 0.24
346 0.26
347 0.27
348 0.24
349 0.25
350 0.22
351 0.22
352 0.19
353 0.17
354 0.12
355 0.1
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.15
384 0.15
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.13
390 0.13
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.15
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.05
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.18
432 0.22
433 0.23
434 0.22
435 0.2
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.16
440 0.11
441 0.11
442 0.14
443 0.18
444 0.22
445 0.23
446 0.23
447 0.27
448 0.27
449 0.3
450 0.31
451 0.3
452 0.25
453 0.24
454 0.26
455 0.26
456 0.26
457 0.26
458 0.24
459 0.23
460 0.23
461 0.24
462 0.22
463 0.17
464 0.23
465 0.21
466 0.19
467 0.17
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.16
495 0.16
496 0.2
497 0.22
498 0.25
499 0.26
500 0.27
501 0.26
502 0.22
503 0.22
504 0.19
505 0.18
506 0.16
507 0.15
508 0.16
509 0.14
510 0.16
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.1
515 0.11
516 0.1
517 0.11
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.15
531 0.22
532 0.29
533 0.35
534 0.42
535 0.47
536 0.56
537 0.63
538 0.65
539 0.69
540 0.68
541 0.72
542 0.74
543 0.72
544 0.69
545 0.66
546 0.59
547 0.48
548 0.42
549 0.32
550 0.24
551 0.18
552 0.14
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.08
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.13
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.18
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.2
595 0.12
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.14
600 0.15
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.13
605 0.14
606 0.16
607 0.14
608 0.12
609 0.12
610 0.14
611 0.14
612 0.15
613 0.14
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.13
618 0.12
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.11
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.1
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.11
633 0.09
634 0.09
635 0.08
636 0.12
637 0.11
638 0.14
639 0.22
640 0.29
641 0.33
642 0.37
643 0.4
644 0.38
645 0.41
646 0.46
647 0.43
648 0.42
649 0.42
650 0.47
651 0.51
652 0.51
653 0.49
654 0.43
655 0.39
656 0.34
657 0.3
658 0.23
659 0.17
660 0.21
661 0.24
662 0.25
663 0.27
664 0.28
665 0.33
666 0.35
667 0.42
668 0.47
669 0.53
670 0.61
671 0.67
672 0.76
673 0.79
674 0.82
675 0.82
676 0.83
677 0.82
678 0.82
679 0.84
680 0.81
681 0.78
682 0.79
683 0.78