Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MES7

Protein Details
Accession C5MES7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MNVVKREEQNEKKKKTTKRKQRHTFSSESTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-21KKKKTTKRKQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_04570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MNVVKREEQNEKKKKTTKRKQRHTFSSESTSSKTMSEKQFNIDLELNQGDHIDPFIQDEDKLKLEELIPRILIERKSFLNVTEASLQQEIENSNEEAQVATEIDTSAIDVPLEEDEDQQEVFNKQKFELSKNINYALNETQLSLDFISLLIASVKPNLAKSTISPHLSKFVKPTSLNSDRLGQEGTEDSNNNNNSQSSNVGQGWKLESLNKITDLFREASVNLNDQVIKERRYWNMINLVLANGEALFRMRDPENNARAIGVKYGYGDSGSNYHDQGLALLRKDNQTGEVSFHPITSLNNAKIVGKINKFIRVKILSQIDGDYMLTGQSVFQFDFKSSKQNIINDIEKARFFLFEEDLFYQLIREAKLLVNYNVSIISNKIIIEINNTIIEIESIIYDELNEEELENYYQNISEYSSLNNKKCQLILNYLKLMLCCYYQYNLKLKQKVPTSLTKWKQSNSHPLILRPLVGNMRHELNLSNMESILRTLAAKFGEKLKKSKLNVDKFTNLAVRSRKSNPFQKSIEKPVSKFSLVLENGSAQIMVVNVTLTTNELFVNLIIHLRLIRFNTVEDFEGNVNGVNVLQLGFSDFNEIEECLDWSIQNFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.87
3 0.87
4 0.88
5 0.89
6 0.92
7 0.93
8 0.96
9 0.95
10 0.92
11 0.89
12 0.84
13 0.82
14 0.76
15 0.69
16 0.61
17 0.52
18 0.45
19 0.39
20 0.36
21 0.35
22 0.39
23 0.44
24 0.43
25 0.45
26 0.5
27 0.49
28 0.5
29 0.45
30 0.36
31 0.32
32 0.31
33 0.27
34 0.21
35 0.21
36 0.16
37 0.13
38 0.14
39 0.1
40 0.08
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.25
53 0.25
54 0.25
55 0.23
56 0.23
57 0.25
58 0.28
59 0.29
60 0.26
61 0.27
62 0.25
63 0.29
64 0.29
65 0.27
66 0.28
67 0.25
68 0.26
69 0.27
70 0.26
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.14
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.16
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.24
113 0.27
114 0.29
115 0.37
116 0.39
117 0.42
118 0.45
119 0.47
120 0.45
121 0.42
122 0.42
123 0.34
124 0.3
125 0.23
126 0.2
127 0.18
128 0.15
129 0.16
130 0.12
131 0.1
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.2
149 0.25
150 0.27
151 0.27
152 0.27
153 0.34
154 0.35
155 0.35
156 0.32
157 0.31
158 0.34
159 0.34
160 0.37
161 0.39
162 0.43
163 0.44
164 0.41
165 0.42
166 0.36
167 0.36
168 0.33
169 0.23
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.13
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.19
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.2
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.26
218 0.27
219 0.33
220 0.33
221 0.3
222 0.34
223 0.32
224 0.29
225 0.25
226 0.24
227 0.18
228 0.16
229 0.13
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.17
240 0.25
241 0.28
242 0.29
243 0.29
244 0.26
245 0.27
246 0.25
247 0.2
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.15
285 0.12
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.19
291 0.21
292 0.18
293 0.23
294 0.23
295 0.31
296 0.31
297 0.3
298 0.32
299 0.29
300 0.29
301 0.3
302 0.31
303 0.24
304 0.24
305 0.24
306 0.18
307 0.15
308 0.14
309 0.08
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.11
322 0.11
323 0.18
324 0.18
325 0.24
326 0.26
327 0.28
328 0.32
329 0.33
330 0.34
331 0.29
332 0.31
333 0.26
334 0.23
335 0.22
336 0.18
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.13
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.14
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.08
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.2
404 0.26
405 0.28
406 0.32
407 0.34
408 0.34
409 0.35
410 0.37
411 0.32
412 0.35
413 0.4
414 0.41
415 0.4
416 0.39
417 0.38
418 0.33
419 0.3
420 0.22
421 0.16
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.17
426 0.22
427 0.29
428 0.37
429 0.44
430 0.5
431 0.51
432 0.56
433 0.57
434 0.59
435 0.56
436 0.56
437 0.56
438 0.59
439 0.63
440 0.64
441 0.63
442 0.6
443 0.62
444 0.6
445 0.63
446 0.59
447 0.6
448 0.53
449 0.51
450 0.54
451 0.47
452 0.42
453 0.31
454 0.29
455 0.26
456 0.26
457 0.26
458 0.22
459 0.24
460 0.23
461 0.23
462 0.2
463 0.18
464 0.22
465 0.2
466 0.19
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.15
471 0.13
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.1
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.23
480 0.31
481 0.34
482 0.39
483 0.45
484 0.52
485 0.54
486 0.62
487 0.63
488 0.65
489 0.69
490 0.71
491 0.66
492 0.58
493 0.6
494 0.54
495 0.45
496 0.41
497 0.4
498 0.37
499 0.39
500 0.45
501 0.49
502 0.53
503 0.61
504 0.61
505 0.63
506 0.65
507 0.68
508 0.69
509 0.7
510 0.72
511 0.68
512 0.63
513 0.62
514 0.62
515 0.54
516 0.47
517 0.39
518 0.38
519 0.33
520 0.33
521 0.27
522 0.23
523 0.22
524 0.22
525 0.2
526 0.1
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.08
544 0.09
545 0.08
546 0.09
547 0.1
548 0.11
549 0.15
550 0.16
551 0.2
552 0.19
553 0.21
554 0.24
555 0.25
556 0.26
557 0.23
558 0.23
559 0.2
560 0.19
561 0.18
562 0.14
563 0.12
564 0.11
565 0.09
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.14
575 0.14
576 0.15
577 0.16
578 0.17
579 0.15
580 0.15
581 0.16
582 0.13
583 0.13
584 0.12