Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCX3

Protein Details
Accession C5MCX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-81FESNLEKLRKKRYNRLSKVGLIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ctp:CTRG_04074  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13428  TPR_14  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAEKVRYYLEQSVPELEDLKSKGLFDKNEITMIMRRRTDFEHRITGRGCKPKDFLRYSEFESNLEKLRKKRYNRLSKVGLIDTKPSISDWAGTRRIMFILDRSTRRYPGETDLWSQYLKFAKQNGAIKVIYKVYSRLLQLQPRNIDAWLSAAKYEFETNGNAKGARVLFQKGLRINPESTELWLNYAQFELTYISKLLARRKVLGLLTEKQQRDAMESEESKRVEALKKDKSNGDDVEGADDEFANDKIELPSTEEIKDELNHLPEADMNMLGNPETNPALKGDVVLTIFDLCIPAILKSLPKHSTVIKPDDKVFEIVGKFLNLIDKFTDLNREYLYLHILNYLQKEYSDDLRTTLIDITLPIRGITAATDGLSSSLQLSVNKFIAYKRKLKDAAQRDTLTNMFVNQLNSQFFNDNNEPPSEKVDTLLKAIIKKCRTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.25
4 0.26
5 0.23
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.26
10 0.3
11 0.32
12 0.32
13 0.38
14 0.37
15 0.38
16 0.37
17 0.35
18 0.34
19 0.4
20 0.41
21 0.37
22 0.37
23 0.38
24 0.44
25 0.5
26 0.52
27 0.51
28 0.54
29 0.52
30 0.56
31 0.55
32 0.58
33 0.57
34 0.59
35 0.55
36 0.5
37 0.53
38 0.55
39 0.63
40 0.6
41 0.56
42 0.53
43 0.55
44 0.56
45 0.59
46 0.52
47 0.44
48 0.42
49 0.4
50 0.41
51 0.43
52 0.42
53 0.4
54 0.5
55 0.57
56 0.62
57 0.7
58 0.73
59 0.78
60 0.81
61 0.84
62 0.8
63 0.77
64 0.75
65 0.7
66 0.64
67 0.54
68 0.49
69 0.41
70 0.35
71 0.29
72 0.24
73 0.2
74 0.16
75 0.18
76 0.18
77 0.24
78 0.26
79 0.26
80 0.27
81 0.26
82 0.25
83 0.23
84 0.2
85 0.16
86 0.22
87 0.28
88 0.3
89 0.35
90 0.38
91 0.4
92 0.42
93 0.41
94 0.35
95 0.35
96 0.38
97 0.35
98 0.36
99 0.35
100 0.34
101 0.32
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.27
109 0.33
110 0.39
111 0.37
112 0.38
113 0.36
114 0.34
115 0.33
116 0.31
117 0.26
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.26
124 0.29
125 0.35
126 0.39
127 0.43
128 0.43
129 0.41
130 0.4
131 0.33
132 0.28
133 0.2
134 0.19
135 0.14
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.16
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.19
156 0.2
157 0.25
158 0.24
159 0.26
160 0.26
161 0.27
162 0.26
163 0.23
164 0.26
165 0.21
166 0.21
167 0.2
168 0.17
169 0.16
170 0.17
171 0.16
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.1
183 0.13
184 0.18
185 0.22
186 0.23
187 0.25
188 0.25
189 0.28
190 0.27
191 0.28
192 0.26
193 0.23
194 0.27
195 0.32
196 0.31
197 0.29
198 0.3
199 0.26
200 0.25
201 0.23
202 0.2
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.22
207 0.22
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.18
212 0.23
213 0.28
214 0.33
215 0.36
216 0.39
217 0.41
218 0.4
219 0.41
220 0.36
221 0.31
222 0.25
223 0.21
224 0.21
225 0.18
226 0.16
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.1
286 0.12
287 0.18
288 0.2
289 0.21
290 0.23
291 0.26
292 0.33
293 0.36
294 0.43
295 0.42
296 0.43
297 0.44
298 0.45
299 0.43
300 0.36
301 0.31
302 0.27
303 0.22
304 0.2
305 0.18
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.18
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.24
317 0.18
318 0.2
319 0.2
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.23
324 0.16
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.19
330 0.19
331 0.15
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.23
336 0.24
337 0.22
338 0.22
339 0.23
340 0.23
341 0.22
342 0.2
343 0.14
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.14
367 0.18
368 0.19
369 0.2
370 0.2
371 0.22
372 0.31
373 0.35
374 0.42
375 0.41
376 0.49
377 0.54
378 0.6
379 0.65
380 0.65
381 0.68
382 0.68
383 0.67
384 0.59
385 0.58
386 0.52
387 0.44
388 0.35
389 0.26
390 0.21
391 0.2
392 0.22
393 0.2
394 0.23
395 0.23
396 0.24
397 0.26
398 0.25
399 0.23
400 0.29
401 0.31
402 0.31
403 0.32
404 0.34
405 0.33
406 0.33
407 0.38
408 0.33
409 0.29
410 0.27
411 0.31
412 0.29
413 0.29
414 0.32
415 0.3
416 0.33
417 0.38
418 0.44