Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MB86

Protein Details
Accession C5MB86    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-279NVVSSSRQRRWRMRKLTWRIEENHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014752  Arrestin-like_C  
IPR014756  Ig_E-set  
IPR024391  LDB19_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000138  C:Golgi trans cisterna  
GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0031625  F:ubiquitin protein ligase binding  
GO:0002092  P:positive regulation of receptor internalization  
GO:0070086  P:ubiquitin-dependent endocytosis  
KEGG ctp:CTRG_03328  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13002  LDB19  
Amino Acid Sequences MSLLARVLHLSSEKAALKRAAIAEQSSSISSSSSSNESLTPATSTSSMKNLNTRQVSSSQNTKKSNYTLSIKIESPPIILYGNPQESTGSIISGILKLENFETVDLENVTLSLVQTMKYTKPFILPNSNSISNCNNCTVRTNELARWDVLTAKAMFPPGEHAYPFSHLLPGSLPPSSRLGSSHSLSFIKYELKAVGKTVDGEIKELVLPVNIARSVIRGPDRNSVRIFPPTEVTAKAVLPNVIYPKATFPIELKIDNVVSSSRQRRWRMRKLTWRIEENIKVKAHTCEKHNAKLQAAEKAYKKSNSNTKPNSKNSSAMHHSTVTTNVSLIPSPSNQQSSPTPQPLQDGIPDNEDIDDAGDHDMEEAIRSGPSHAQDNFIEDFLTPSTAATATTTHHPALSIQPTIYTPHPVDMDKHLYLEETRTVSYGEIKSGWKSDFSGSGKIELVANISTVGCSTGMTNHILNLSTDDKPIQMDTKLGANFSCDIDDPTLGVFVNHTMIVEVVVAEELVHNVERKRSNSVISLSPSKSAGHSNGTSDTEGKSTSTSNEPLQMGVPTGAARVLRMQFKLPITERSGLGIAWDDEVPPTYEDVSNLSPPTYNDPLSTTVSPAQSARSTPSQTPRLIIGRGDTPLMGNFELDASTQSIDNLINNGKDNIQELSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.29
4 0.28
5 0.32
6 0.32
7 0.3
8 0.28
9 0.29
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.23
14 0.21
15 0.17
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.23
34 0.26
35 0.28
36 0.36
37 0.39
38 0.46
39 0.49
40 0.49
41 0.46
42 0.47
43 0.5
44 0.47
45 0.52
46 0.52
47 0.56
48 0.58
49 0.58
50 0.59
51 0.57
52 0.58
53 0.55
54 0.52
55 0.5
56 0.51
57 0.52
58 0.47
59 0.44
60 0.42
61 0.36
62 0.31
63 0.25
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.18
68 0.21
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.22
73 0.22
74 0.26
75 0.22
76 0.15
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.13
104 0.16
105 0.19
106 0.21
107 0.21
108 0.25
109 0.29
110 0.34
111 0.41
112 0.4
113 0.42
114 0.46
115 0.49
116 0.44
117 0.43
118 0.43
119 0.36
120 0.36
121 0.36
122 0.31
123 0.27
124 0.31
125 0.31
126 0.29
127 0.32
128 0.34
129 0.31
130 0.35
131 0.36
132 0.33
133 0.31
134 0.27
135 0.23
136 0.19
137 0.21
138 0.16
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.22
151 0.24
152 0.19
153 0.18
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.18
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.22
171 0.23
172 0.22
173 0.22
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.13
204 0.17
205 0.19
206 0.22
207 0.3
208 0.34
209 0.36
210 0.37
211 0.36
212 0.34
213 0.36
214 0.34
215 0.27
216 0.26
217 0.24
218 0.24
219 0.22
220 0.21
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.17
238 0.19
239 0.19
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.1
246 0.1
247 0.16
248 0.21
249 0.26
250 0.35
251 0.42
252 0.51
253 0.61
254 0.7
255 0.73
256 0.77
257 0.82
258 0.83
259 0.86
260 0.82
261 0.76
262 0.69
263 0.65
264 0.62
265 0.54
266 0.5
267 0.4
268 0.35
269 0.32
270 0.33
271 0.34
272 0.3
273 0.31
274 0.35
275 0.39
276 0.45
277 0.49
278 0.47
279 0.41
280 0.44
281 0.42
282 0.39
283 0.36
284 0.34
285 0.31
286 0.32
287 0.35
288 0.32
289 0.33
290 0.32
291 0.4
292 0.43
293 0.51
294 0.55
295 0.61
296 0.66
297 0.7
298 0.7
299 0.62
300 0.6
301 0.52
302 0.5
303 0.45
304 0.39
305 0.35
306 0.29
307 0.28
308 0.23
309 0.23
310 0.17
311 0.13
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.16
325 0.22
326 0.25
327 0.28
328 0.27
329 0.25
330 0.27
331 0.26
332 0.25
333 0.21
334 0.21
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.15
340 0.14
341 0.1
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.08
358 0.09
359 0.13
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.19
364 0.19
365 0.16
366 0.16
367 0.12
368 0.12
369 0.09
370 0.1
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.1
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.16
386 0.18
387 0.16
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.13
395 0.14
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.2
400 0.24
401 0.21
402 0.21
403 0.19
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.16
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.16
414 0.15
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.18
420 0.18
421 0.14
422 0.15
423 0.15
424 0.21
425 0.22
426 0.26
427 0.24
428 0.25
429 0.25
430 0.23
431 0.23
432 0.15
433 0.14
434 0.09
435 0.09
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.15
454 0.14
455 0.15
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.15
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.15
472 0.1
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.06
499 0.08
500 0.09
501 0.16
502 0.21
503 0.23
504 0.29
505 0.3
506 0.32
507 0.35
508 0.38
509 0.36
510 0.36
511 0.41
512 0.35
513 0.35
514 0.33
515 0.29
516 0.27
517 0.26
518 0.24
519 0.23
520 0.23
521 0.24
522 0.27
523 0.28
524 0.28
525 0.25
526 0.23
527 0.18
528 0.18
529 0.16
530 0.14
531 0.13
532 0.14
533 0.18
534 0.2
535 0.2
536 0.25
537 0.25
538 0.24
539 0.24
540 0.22
541 0.18
542 0.15
543 0.15
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.13
550 0.17
551 0.21
552 0.23
553 0.25
554 0.28
555 0.3
556 0.37
557 0.35
558 0.37
559 0.37
560 0.39
561 0.37
562 0.34
563 0.33
564 0.25
565 0.23
566 0.2
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.17
580 0.19
581 0.2
582 0.2
583 0.2
584 0.19
585 0.2
586 0.27
587 0.27
588 0.25
589 0.23
590 0.25
591 0.28
592 0.32
593 0.31
594 0.27
595 0.27
596 0.27
597 0.28
598 0.25
599 0.26
600 0.23
601 0.24
602 0.26
603 0.28
604 0.32
605 0.37
606 0.45
607 0.48
608 0.47
609 0.47
610 0.48
611 0.45
612 0.43
613 0.38
614 0.33
615 0.3
616 0.3
617 0.29
618 0.23
619 0.2
620 0.2
621 0.22
622 0.18
623 0.15
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.11
634 0.12
635 0.12
636 0.15
637 0.17
638 0.18
639 0.21
640 0.22
641 0.22
642 0.22
643 0.23