Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6R8

Protein Details
Accession C5M6R8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-98YLLNTHTARQKAKKNNKENSGSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005768  C:endosome  
GO:0000329  C:fungal-type vacuole membrane  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0140312  F:cargo adaptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0060548  P:negative regulation of cell death  
GO:1900102  P:negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response  
GO:1904377  P:positive regulation of protein localization to cell periphery  
GO:0045053  P:protein retention in Golgi apparatus  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG ctp:CTRG_01549  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MPLSANEQKSVLQSCINTIKSQSNLMKHDLNDNKLLPALKHCSNFLSELRTNSLTPKQYYEIYMLVFDSLETLSTYLLNTHTARQKAKKNNKENSGSAFLADLYEIVQYSGNIIPRLYMMIVIGTTYMSIEGAPTKDLMKDMIEMCHGVQHPIRGLFLRYYLSQRTKNLLPFGNQADFQETVDFLIANFIEMNKLWVRLQHQGHSSERELRYRERKELKILVGSNLVRLSQIIDDYTGDESYSAVEYYKEKIFPTVTEQIIQCRDHLAQSYLIDVLIQVFPDDFHFATLDKLLNEVFVNLHPMLQKSELVQALIDRFIAYEKFASDISDLSVEERPVLHNVNIDDLFQSFWQFYSNLSESDPDLPPEEHSSLLQSLISLLLTFDPENFSNLDVIYKFAEENLGGQDEGDDQEEMWSNLLIEPVSHFKSIKSLLRLENFYDFYKKLTNINLQKQISLAIIDKILSLASENQKDILMDVEEIDGIFRYLMVLIKESPSKLDTAKNLGVTKTIKVNNGELLVTPEFLEVQEKICKVFQLVENPEDPVKTIANLMYIRKTYLNKNLENIIYTYPSLISRILFKLKIIGYVNLQQKKNDEASELQSTSNFKNLSVIINELYQYHQEYSSDLILTLYLNAAIVTDQLQLESLCYELFTQCFVIYEENLILSTHQNRNSASVNPRDSLSGGSLAFESILAIANSLAKTRNLSKDNYESLITKLTLYASRLSKKNEVTRAILACAHLWNQERKGEENDGKRVLECLQKCLRVADGCLDPFLSVKLFIEILNQSIILNVDSWFTNGVIELTKTNIENLEDNQELDILFKRVLAYMENPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.35
3 0.35
4 0.32
5 0.33
6 0.37
7 0.35
8 0.43
9 0.43
10 0.42
11 0.45
12 0.48
13 0.5
14 0.45
15 0.53
16 0.52
17 0.49
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.4
22 0.4
23 0.32
24 0.32
25 0.34
26 0.34
27 0.35
28 0.36
29 0.35
30 0.35
31 0.38
32 0.34
33 0.36
34 0.33
35 0.33
36 0.38
37 0.37
38 0.35
39 0.37
40 0.42
41 0.39
42 0.39
43 0.4
44 0.38
45 0.38
46 0.4
47 0.38
48 0.32
49 0.27
50 0.25
51 0.21
52 0.18
53 0.15
54 0.12
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.13
66 0.14
67 0.21
68 0.27
69 0.33
70 0.4
71 0.47
72 0.56
73 0.63
74 0.73
75 0.77
76 0.8
77 0.84
78 0.86
79 0.85
80 0.79
81 0.75
82 0.7
83 0.6
84 0.49
85 0.4
86 0.31
87 0.24
88 0.19
89 0.12
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.09
97 0.12
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.13
105 0.11
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.14
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.19
142 0.21
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.22
148 0.29
149 0.34
150 0.37
151 0.39
152 0.42
153 0.45
154 0.47
155 0.49
156 0.44
157 0.41
158 0.4
159 0.42
160 0.39
161 0.34
162 0.31
163 0.28
164 0.25
165 0.22
166 0.18
167 0.14
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.07
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.12
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.19
185 0.26
186 0.3
187 0.32
188 0.35
189 0.38
190 0.41
191 0.43
192 0.42
193 0.42
194 0.42
195 0.41
196 0.41
197 0.44
198 0.51
199 0.51
200 0.58
201 0.58
202 0.59
203 0.61
204 0.64
205 0.59
206 0.56
207 0.52
208 0.45
209 0.42
210 0.38
211 0.33
212 0.27
213 0.24
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.09
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.17
239 0.18
240 0.18
241 0.23
242 0.26
243 0.24
244 0.26
245 0.26
246 0.28
247 0.31
248 0.31
249 0.24
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.2
254 0.17
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.18
348 0.17
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.05
409 0.08
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.14
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.25
420 0.28
421 0.29
422 0.27
423 0.27
424 0.25
425 0.23
426 0.22
427 0.19
428 0.17
429 0.19
430 0.18
431 0.17
432 0.19
433 0.26
434 0.31
435 0.37
436 0.44
437 0.41
438 0.4
439 0.38
440 0.35
441 0.27
442 0.21
443 0.15
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.08
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.14
460 0.11
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.16
486 0.16
487 0.21
488 0.23
489 0.25
490 0.25
491 0.24
492 0.26
493 0.23
494 0.23
495 0.24
496 0.24
497 0.24
498 0.25
499 0.26
500 0.24
501 0.24
502 0.23
503 0.16
504 0.17
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.07
513 0.09
514 0.12
515 0.12
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.13
520 0.17
521 0.18
522 0.23
523 0.26
524 0.27
525 0.27
526 0.28
527 0.27
528 0.23
529 0.21
530 0.14
531 0.11
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.12
536 0.14
537 0.15
538 0.17
539 0.17
540 0.18
541 0.21
542 0.23
543 0.24
544 0.32
545 0.37
546 0.35
547 0.37
548 0.4
549 0.37
550 0.35
551 0.32
552 0.24
553 0.18
554 0.17
555 0.15
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.1
560 0.09
561 0.11
562 0.15
563 0.18
564 0.17
565 0.17
566 0.21
567 0.21
568 0.26
569 0.24
570 0.22
571 0.22
572 0.29
573 0.37
574 0.39
575 0.39
576 0.35
577 0.36
578 0.39
579 0.39
580 0.32
581 0.27
582 0.23
583 0.27
584 0.31
585 0.3
586 0.25
587 0.24
588 0.26
589 0.24
590 0.26
591 0.21
592 0.16
593 0.18
594 0.18
595 0.19
596 0.18
597 0.18
598 0.14
599 0.15
600 0.15
601 0.13
602 0.13
603 0.12
604 0.13
605 0.13
606 0.12
607 0.12
608 0.12
609 0.14
610 0.15
611 0.14
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.07
618 0.05
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.07
633 0.05
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.09
640 0.08
641 0.1
642 0.1
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.11
647 0.1
648 0.11
649 0.1
650 0.1
651 0.12
652 0.18
653 0.22
654 0.26
655 0.28
656 0.28
657 0.32
658 0.34
659 0.37
660 0.37
661 0.39
662 0.39
663 0.37
664 0.37
665 0.34
666 0.32
667 0.28
668 0.23
669 0.18
670 0.14
671 0.14
672 0.13
673 0.12
674 0.12
675 0.09
676 0.08
677 0.05
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.09
683 0.09
684 0.1
685 0.12
686 0.11
687 0.15
688 0.21
689 0.3
690 0.31
691 0.34
692 0.4
693 0.45
694 0.48
695 0.46
696 0.42
697 0.35
698 0.33
699 0.34
700 0.28
701 0.21
702 0.18
703 0.18
704 0.19
705 0.19
706 0.24
707 0.26
708 0.33
709 0.37
710 0.42
711 0.47
712 0.52
713 0.59
714 0.6
715 0.58
716 0.56
717 0.57
718 0.54
719 0.49
720 0.43
721 0.35
722 0.29
723 0.26
724 0.23
725 0.22
726 0.24
727 0.28
728 0.31
729 0.33
730 0.35
731 0.36
732 0.4
733 0.44
734 0.47
735 0.48
736 0.51
737 0.51
738 0.5
739 0.46
740 0.43
741 0.37
742 0.39
743 0.33
744 0.34
745 0.37
746 0.4
747 0.4
748 0.4
749 0.41
750 0.35
751 0.35
752 0.33
753 0.31
754 0.29
755 0.28
756 0.27
757 0.22
758 0.2
759 0.2
760 0.15
761 0.1
762 0.1
763 0.11
764 0.11
765 0.11
766 0.15
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.15
771 0.13
772 0.13
773 0.14
774 0.1
775 0.1
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.1
782 0.1
783 0.09
784 0.1
785 0.11
786 0.12
787 0.12
788 0.13
789 0.16
790 0.16
791 0.17
792 0.18
793 0.19
794 0.2
795 0.22
796 0.27
797 0.25
798 0.25
799 0.24
800 0.22
801 0.19
802 0.18
803 0.19
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.14
808 0.15
809 0.17
810 0.18