Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6HSN3

Protein Details
Accession A0A5N6HSN3    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPDKKDKKRKAAAATAAADHydrophilic
95-114KVETEKKLSNKKTKKADGTAHydrophilic
195-220VPKIPDSKKAKRKILKKQRENKQEAEBasic
310-334KGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTBasic
406-475KKVADDTPKKAKKDKKKGAQSKEQETPKVTPKKDTPKKETPKKETPAATASPATKAGAKAKKAKKTKTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-75KKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPAESTNASPKPILKKNKGNAAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKR
100-134KKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKASTKAKKP
201-213SKKAKRKILKKQR
312-355ANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEK
412-475TPKKAKKDKKKGAQSKEQETPKVTPKKDTPKKETPKKETPAATASPATKAGAKAKKAKKTKTKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPAESTNASPKPILKKNKGNAAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKRAADFLSDNDDSESEDAPEAKVETEKKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKASTKAKKPEPVAEESDDEEMEDEESAASGASASEDEEEDDRTAALIKGFESSGDEDESGDEGFNSDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQRENKQEAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGEISRLRLSRNRITGRSKHYAFIEFTSTSVAKIVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHAELWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEKLKALGYEFELPQLKSVDEVPVQQEENKAIEASETVPEEPAKAIEAPKEEDKKVADDTPKKAKKDKKKGAQSKEQETPKVTPKKDTPKKETPKKETPAATASPATKAGAKAKKAKKTKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.66
4 0.56
5 0.47
6 0.39
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.32
13 0.42
14 0.51
15 0.58
16 0.64
17 0.66
18 0.71
19 0.75
20 0.75
21 0.71
22 0.61
23 0.57
24 0.56
25 0.51
26 0.45
27 0.38
28 0.4
29 0.44
30 0.51
31 0.58
32 0.58
33 0.63
34 0.69
35 0.78
36 0.8
37 0.77
38 0.75
39 0.74
40 0.73
41 0.64
42 0.61
43 0.58
44 0.54
45 0.49
46 0.46
47 0.42
48 0.42
49 0.49
50 0.48
51 0.47
52 0.52
53 0.54
54 0.59
55 0.61
56 0.63
57 0.64
58 0.69
59 0.74
60 0.75
61 0.76
62 0.75
63 0.73
64 0.73
65 0.67
66 0.61
67 0.59
68 0.49
69 0.45
70 0.38
71 0.32
72 0.22
73 0.2
74 0.17
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.14
83 0.14
84 0.18
85 0.23
86 0.27
87 0.33
88 0.43
89 0.51
90 0.58
91 0.66
92 0.7
93 0.75
94 0.8
95 0.81
96 0.77
97 0.76
98 0.7
99 0.68
100 0.66
101 0.6
102 0.53
103 0.48
104 0.44
105 0.4
106 0.37
107 0.34
108 0.36
109 0.38
110 0.44
111 0.48
112 0.55
113 0.6
114 0.67
115 0.74
116 0.75
117 0.78
118 0.76
119 0.75
120 0.7
121 0.7
122 0.64
123 0.59
124 0.54
125 0.47
126 0.43
127 0.37
128 0.34
129 0.26
130 0.21
131 0.16
132 0.11
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.25
185 0.25
186 0.34
187 0.41
188 0.5
189 0.56
190 0.62
191 0.7
192 0.7
193 0.78
194 0.79
195 0.82
196 0.83
197 0.84
198 0.86
199 0.86
200 0.89
201 0.85
202 0.79
203 0.74
204 0.68
205 0.59
206 0.54
207 0.45
208 0.34
209 0.29
210 0.24
211 0.18
212 0.12
213 0.12
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.12
231 0.13
232 0.11
233 0.11
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.19
241 0.25
242 0.26
243 0.35
244 0.38
245 0.4
246 0.46
247 0.51
248 0.55
249 0.57
250 0.52
251 0.46
252 0.43
253 0.41
254 0.36
255 0.31
256 0.27
257 0.19
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.13
262 0.13
263 0.11
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.18
284 0.22
285 0.25
286 0.31
287 0.29
288 0.37
289 0.38
290 0.41
291 0.38
292 0.35
293 0.3
294 0.26
295 0.23
296 0.2
297 0.21
298 0.22
299 0.3
300 0.33
301 0.41
302 0.44
303 0.49
304 0.56
305 0.63
306 0.7
307 0.71
308 0.79
309 0.8
310 0.84
311 0.89
312 0.87
313 0.86
314 0.85
315 0.84
316 0.8
317 0.8
318 0.78
319 0.79
320 0.77
321 0.74
322 0.73
323 0.67
324 0.69
325 0.65
326 0.66
327 0.57
328 0.58
329 0.61
330 0.61
331 0.66
332 0.66
333 0.67
334 0.66
335 0.69
336 0.68
337 0.68
338 0.68
339 0.69
340 0.7
341 0.68
342 0.63
343 0.58
344 0.52
345 0.45
346 0.38
347 0.3
348 0.25
349 0.2
350 0.22
351 0.25
352 0.23
353 0.23
354 0.23
355 0.2
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.19
363 0.2
364 0.2
365 0.21
366 0.19
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.16
386 0.19
387 0.23
388 0.3
389 0.36
390 0.34
391 0.36
392 0.36
393 0.36
394 0.36
395 0.38
396 0.39
397 0.41
398 0.47
399 0.55
400 0.6
401 0.61
402 0.66
403 0.7
404 0.72
405 0.77
406 0.81
407 0.81
408 0.85
409 0.91
410 0.92
411 0.93
412 0.9
413 0.87
414 0.86
415 0.81
416 0.75
417 0.69
418 0.65
419 0.64
420 0.65
421 0.58
422 0.57
423 0.61
424 0.67
425 0.72
426 0.77
427 0.76
428 0.78
429 0.87
430 0.89
431 0.91
432 0.89
433 0.89
434 0.86
435 0.85
436 0.79
437 0.74
438 0.69
439 0.61
440 0.56
441 0.5
442 0.45
443 0.38
444 0.35
445 0.3
446 0.27
447 0.28
448 0.33
449 0.37
450 0.42
451 0.5
452 0.58
453 0.67
454 0.73
455 0.8