Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MI87

Protein Details
Accession C5MI87    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-55VLVEQTKKEQPKKKIYTTSDLEHydrophilic
277-300SISGNKKISKTKMRKKKGAMTDTSHydrophilic
363-385ESGGRKLVKKDEEKKKLQKAASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-293KKISKTKMRKKK
367-394RKLVKKDEEKKKLQKAASSVSKGKAARK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0031902  C:late endosome membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0071986  C:Ragulator complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:1904669  P:ATP export  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
GO:0032456  P:endocytic recycling  
GO:0006970  P:response to osmotic stress  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG ctp:CTRG_05780  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGRRFDKKNATTFNVLHRAHDDVKYFDDDASKHVLVEQTKKEQPKKKIYTTSDLESKLANENIRDNEGLAAHYGITYDDSKYDYMQHLKPMGNTDGVFVGAKETSVEKKQKIEDLIRDQLPSERTRKVARDLDQSIPDELQGFNPNLDPRLREVLEALEDEAYIEEEQEGADEDVFDMLLKSGEVEDENEFYYGSGAEDYDDEYDEWDLDNYEDEYNQKYESGVPEDEDGELPDGVNQDWQRDFMKFKKDTKHKANDWDSDDEFEEEEEDEVPDLPSISGNKKISKTKMRKKKGAMTDTSSFSMSSSALFRTEGLTLLDDRYEQLNKKFEDDEEKEHKPFNMEEERHDLEGMLDEFLDNYELESGGRKLVKKDEEKKKLQKAASSVSKGKAARKLNQAFGDMKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.59
3 0.52
4 0.46
5 0.46
6 0.43
7 0.44
8 0.38
9 0.31
10 0.34
11 0.35
12 0.34
13 0.29
14 0.29
15 0.25
16 0.25
17 0.29
18 0.26
19 0.22
20 0.23
21 0.27
22 0.27
23 0.35
24 0.38
25 0.39
26 0.45
27 0.55
28 0.62
29 0.66
30 0.72
31 0.75
32 0.78
33 0.79
34 0.83
35 0.8
36 0.8
37 0.76
38 0.73
39 0.69
40 0.61
41 0.52
42 0.43
43 0.38
44 0.35
45 0.32
46 0.28
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.3
51 0.28
52 0.24
53 0.22
54 0.21
55 0.19
56 0.15
57 0.12
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.18
71 0.23
72 0.25
73 0.29
74 0.32
75 0.33
76 0.34
77 0.35
78 0.33
79 0.29
80 0.27
81 0.23
82 0.19
83 0.18
84 0.16
85 0.11
86 0.11
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.12
92 0.2
93 0.26
94 0.26
95 0.32
96 0.35
97 0.39
98 0.42
99 0.44
100 0.45
101 0.46
102 0.51
103 0.47
104 0.44
105 0.4
106 0.38
107 0.36
108 0.32
109 0.29
110 0.25
111 0.27
112 0.32
113 0.35
114 0.39
115 0.43
116 0.43
117 0.47
118 0.48
119 0.49
120 0.48
121 0.46
122 0.39
123 0.32
124 0.27
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.21
138 0.21
139 0.19
140 0.19
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.29
233 0.32
234 0.38
235 0.46
236 0.54
237 0.62
238 0.69
239 0.74
240 0.69
241 0.74
242 0.75
243 0.71
244 0.66
245 0.62
246 0.52
247 0.44
248 0.4
249 0.31
250 0.24
251 0.17
252 0.14
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.09
265 0.11
266 0.18
267 0.2
268 0.25
269 0.3
270 0.36
271 0.43
272 0.52
273 0.61
274 0.64
275 0.73
276 0.78
277 0.82
278 0.83
279 0.85
280 0.84
281 0.82
282 0.77
283 0.73
284 0.67
285 0.62
286 0.55
287 0.46
288 0.36
289 0.27
290 0.22
291 0.15
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.14
309 0.17
310 0.19
311 0.24
312 0.31
313 0.31
314 0.34
315 0.35
316 0.33
317 0.39
318 0.4
319 0.43
320 0.43
321 0.47
322 0.45
323 0.46
324 0.45
325 0.38
326 0.35
327 0.34
328 0.37
329 0.34
330 0.36
331 0.42
332 0.44
333 0.41
334 0.4
335 0.32
336 0.22
337 0.25
338 0.21
339 0.14
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.1
351 0.11
352 0.15
353 0.19
354 0.2
355 0.24
356 0.32
357 0.41
358 0.49
359 0.59
360 0.65
361 0.71
362 0.79
363 0.86
364 0.88
365 0.87
366 0.81
367 0.77
368 0.72
369 0.72
370 0.72
371 0.69
372 0.64
373 0.59
374 0.61
375 0.58
376 0.58
377 0.57
378 0.55
379 0.56
380 0.61
381 0.65
382 0.66
383 0.66
384 0.64