Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD43

Protein Details
Accession C5MD43    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-199STTSKLVKKLRKPKRVNSGDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-193KKLRKPKR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, mito 5, plas 3, cyto 2.5, extr 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_04144  -  
Amino Acid Sequences MFQLLEFILNIFTFFIPLILTIKILDQSITFKYSCYQFVINYWLYYIVLQYLQYNIFMDNLLFLYVSKFIKFWLFYGKSNNLKLSNHFLLLRFLNLNSVQLFEVNYLNPLINKINPGFKEINYQIYLSGKIYLLPINYNQPSFRFLNNFIAMFQLPTNPSISSKSKSKSRQTSSSTTTSTTSKLVKKLRKPKRVNSGDSSHSETRSRSASRSRSRSSSTSTNIQQPNISSNQTSPTLSPIDYQIISDQLPSAQPNLLSIPKYKRTISPPPYEEIIQNSQLINNYNNNSPEISLSDNNNSRHSSRSVSRKSSFSSSRSRPVSINGSSSGNNSSNSNNNNNVINLESIDSTIMTNNNSSTSIGSGNSNSFTDIRIGSESMNRIQEQLNNTRSNINNDLPPLPTPRMMNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.08
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.14
15 0.17
16 0.2
17 0.18
18 0.17
19 0.21
20 0.24
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.23
25 0.25
26 0.32
27 0.29
28 0.26
29 0.24
30 0.21
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.25
61 0.27
62 0.29
63 0.37
64 0.44
65 0.45
66 0.48
67 0.51
68 0.45
69 0.43
70 0.44
71 0.45
72 0.39
73 0.35
74 0.33
75 0.3
76 0.3
77 0.28
78 0.28
79 0.2
80 0.18
81 0.19
82 0.18
83 0.19
84 0.15
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.1
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.15
100 0.16
101 0.22
102 0.22
103 0.28
104 0.27
105 0.26
106 0.33
107 0.31
108 0.34
109 0.29
110 0.29
111 0.24
112 0.24
113 0.24
114 0.17
115 0.17
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.18
124 0.19
125 0.2
126 0.19
127 0.19
128 0.23
129 0.23
130 0.24
131 0.21
132 0.22
133 0.28
134 0.29
135 0.28
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.18
140 0.16
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.1
146 0.12
147 0.16
148 0.19
149 0.2
150 0.25
151 0.29
152 0.36
153 0.44
154 0.52
155 0.57
156 0.6
157 0.65
158 0.65
159 0.67
160 0.64
161 0.61
162 0.52
163 0.44
164 0.39
165 0.32
166 0.27
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.28
171 0.35
172 0.41
173 0.49
174 0.58
175 0.66
176 0.72
177 0.76
178 0.78
179 0.81
180 0.81
181 0.77
182 0.72
183 0.66
184 0.59
185 0.54
186 0.52
187 0.42
188 0.36
189 0.32
190 0.26
191 0.23
192 0.24
193 0.22
194 0.19
195 0.25
196 0.33
197 0.4
198 0.47
199 0.48
200 0.48
201 0.51
202 0.51
203 0.48
204 0.45
205 0.4
206 0.39
207 0.38
208 0.42
209 0.4
210 0.38
211 0.34
212 0.28
213 0.28
214 0.24
215 0.23
216 0.15
217 0.14
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.13
244 0.13
245 0.17
246 0.23
247 0.28
248 0.31
249 0.32
250 0.35
251 0.4
252 0.49
253 0.52
254 0.55
255 0.51
256 0.51
257 0.52
258 0.48
259 0.41
260 0.36
261 0.32
262 0.25
263 0.24
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.18
269 0.19
270 0.2
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.22
275 0.2
276 0.19
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.18
281 0.24
282 0.29
283 0.3
284 0.32
285 0.33
286 0.31
287 0.32
288 0.32
289 0.31
290 0.32
291 0.41
292 0.46
293 0.52
294 0.54
295 0.54
296 0.56
297 0.58
298 0.57
299 0.51
300 0.53
301 0.5
302 0.56
303 0.56
304 0.54
305 0.47
306 0.47
307 0.49
308 0.41
309 0.39
310 0.32
311 0.31
312 0.29
313 0.3
314 0.29
315 0.24
316 0.22
317 0.21
318 0.22
319 0.25
320 0.29
321 0.33
322 0.32
323 0.32
324 0.33
325 0.32
326 0.3
327 0.25
328 0.21
329 0.17
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.17
353 0.18
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.21
363 0.24
364 0.26
365 0.29
366 0.28
367 0.27
368 0.29
369 0.32
370 0.34
371 0.4
372 0.43
373 0.41
374 0.42
375 0.48
376 0.48
377 0.5
378 0.5
379 0.44
380 0.41
381 0.42
382 0.42
383 0.37
384 0.37
385 0.36
386 0.33
387 0.33