Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9R2

Protein Details
Accession C5M9R2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-77FSKDVSKAKKTKIQKSKIRKPTEKKKDISNGKQTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-69KAKKTKIQKSKIRKPTEKKKD
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 9.333, nucl 7.5, cyto_nucl 6.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002043  UDG_fam1  
IPR005122  Uracil-DNA_glycosylase-like  
IPR036895  Uracil-DNA_glycosylase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004844  F:uracil DNA N-glycosylase activity  
GO:0006284  P:base-excision repair  
KEGG ctp:CTRG_02224  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03167  UDG  
CDD cd10027  UDG-F1-like  
Amino Acid Sequences MSMLRRGSYSTISFITRVNIIYRRSISNSSYKMSKRILITDFFSKDVSKAKKTKIQKSKIRKPTEKKKDISNGKQTIAKEQIEKSEEKELKDEKAVDEVSKDEKLVDEVSKDEKVVDEVSKEEKPQDIKNQTKSDEEVSAPEFNGIVKDHPDNYDKFCEKFNFNKSKWVDSLNPEQRELLRLEIESLHITWLAFLHKELTKPYFLKLKKFLKSQSGKTIYPPANQIYSWSQLTPLPDVKCLIIGQDPYHGPNQAHGLAFSVLEPTRPPPSLVNIYKTISNDYPNFEVPDPKKQPGGGNLTKWAKRGVLMLNAVLTVEAHKANSHANQGWEEFTENVIKNILEFHKDDALVIMAWGSPAQKRVAKFKMASNKDHFLVLKTVHPSPLSAYRGFLNSKVFLQCNEFLEKHQKDKIDWGLIDGNIVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.24
6 0.27
7 0.27
8 0.34
9 0.36
10 0.38
11 0.41
12 0.44
13 0.43
14 0.46
15 0.48
16 0.44
17 0.49
18 0.47
19 0.49
20 0.48
21 0.49
22 0.43
23 0.46
24 0.46
25 0.42
26 0.44
27 0.45
28 0.43
29 0.39
30 0.37
31 0.3
32 0.29
33 0.34
34 0.36
35 0.37
36 0.42
37 0.48
38 0.56
39 0.65
40 0.74
41 0.76
42 0.8
43 0.81
44 0.85
45 0.88
46 0.9
47 0.91
48 0.91
49 0.91
50 0.92
51 0.93
52 0.91
53 0.84
54 0.83
55 0.83
56 0.83
57 0.83
58 0.82
59 0.76
60 0.69
61 0.71
62 0.61
63 0.58
64 0.54
65 0.47
66 0.41
67 0.37
68 0.41
69 0.4
70 0.4
71 0.35
72 0.39
73 0.39
74 0.36
75 0.4
76 0.36
77 0.35
78 0.39
79 0.38
80 0.28
81 0.3
82 0.3
83 0.24
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.2
88 0.19
89 0.14
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.15
94 0.12
95 0.14
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.14
104 0.12
105 0.13
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.23
112 0.27
113 0.35
114 0.4
115 0.46
116 0.53
117 0.57
118 0.55
119 0.54
120 0.51
121 0.44
122 0.36
123 0.3
124 0.24
125 0.21
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.14
130 0.11
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.19
139 0.19
140 0.23
141 0.29
142 0.29
143 0.28
144 0.3
145 0.31
146 0.32
147 0.38
148 0.43
149 0.45
150 0.44
151 0.52
152 0.5
153 0.52
154 0.49
155 0.46
156 0.4
157 0.35
158 0.45
159 0.44
160 0.43
161 0.39
162 0.39
163 0.35
164 0.33
165 0.3
166 0.2
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.17
188 0.18
189 0.2
190 0.25
191 0.25
192 0.3
193 0.37
194 0.43
195 0.44
196 0.48
197 0.49
198 0.5
199 0.55
200 0.53
201 0.54
202 0.51
203 0.46
204 0.44
205 0.5
206 0.42
207 0.38
208 0.37
209 0.28
210 0.24
211 0.24
212 0.25
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.19
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.13
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.14
256 0.19
257 0.28
258 0.3
259 0.32
260 0.31
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.31
265 0.23
266 0.25
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.25
272 0.22
273 0.28
274 0.27
275 0.36
276 0.37
277 0.36
278 0.37
279 0.36
280 0.39
281 0.38
282 0.45
283 0.39
284 0.37
285 0.43
286 0.47
287 0.47
288 0.45
289 0.4
290 0.31
291 0.27
292 0.29
293 0.25
294 0.24
295 0.24
296 0.23
297 0.21
298 0.2
299 0.19
300 0.15
301 0.11
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.13
309 0.16
310 0.2
311 0.2
312 0.22
313 0.24
314 0.25
315 0.25
316 0.22
317 0.21
318 0.16
319 0.15
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.19
327 0.2
328 0.17
329 0.18
330 0.2
331 0.23
332 0.23
333 0.23
334 0.19
335 0.18
336 0.14
337 0.13
338 0.1
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.11
345 0.15
346 0.19
347 0.22
348 0.31
349 0.36
350 0.42
351 0.44
352 0.5
353 0.56
354 0.58
355 0.63
356 0.61
357 0.6
358 0.54
359 0.55
360 0.47
361 0.39
362 0.38
363 0.32
364 0.31
365 0.3
366 0.31
367 0.3
368 0.3
369 0.27
370 0.28
371 0.34
372 0.33
373 0.29
374 0.29
375 0.28
376 0.32
377 0.34
378 0.32
379 0.28
380 0.26
381 0.29
382 0.33
383 0.32
384 0.29
385 0.34
386 0.35
387 0.33
388 0.38
389 0.34
390 0.34
391 0.44
392 0.46
393 0.47
394 0.48
395 0.48
396 0.44
397 0.52
398 0.55
399 0.53
400 0.48
401 0.46
402 0.46
403 0.42