Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6P1

Protein Details
Accession C5M6P1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-229NLVSKFPTKLKSKKTKRNHNLIPNNSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-219KMKANKVAKINRRKSRNTENLVSKFPTKLKSKKTKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ctp:CTRG_01522  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MIPPDSHTQTQTQSHQPFVHQPPCQPQQQQQQQQVSIQLPIHKSFPSQLIHYNSLPYTFTVSGQQQFYFPLQRELSSAANISTNKSTSAQLTSYSPISPDHTPPNVSDPQFYSPSSSCVLSSSPSYSTQPTILDTNTQKMSYQFPITISMNYGNHLPQQQFQQQSSPHPQQQQQQSQLSPRESKMKANKVAKINRRKSRNTENLVSKFPTKLKSKKTKRNHNLIPNNSIYYPIYRPSANDGLSFYDTEFLNKFIYPKIEIKKYSTSALDPQRSYITAYEYPINNHWVIWDYETGWVHLTGIWKASLNVEEANVSPSHMKADIVKLLESTPKEYQHYIKRIRGGFLKIQGTWLPYKLCKILARRFCYHIRYSLIPLFGADFPNSCLKPNARGFGELKLDDLHNFGESALPLPIPPPPTSHQQQSIPHTNSGNSNYVAKSNQLEPPAPITNAKALPPVGVLLPGQQSQQTSPLMQYNSSSFPFNCNVTTTSDGNYNAPITPPKRHYSSSSSISSISSSVFSGERITPISNGYSTSEIPSFNEMIDIVNASKCLQTLSKDSSSPRNMKNENKVYGSENGGISAILLAAGLSGVSNNHREAVSRSSPRDSNVKAGMTINDLLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.49
4 0.53
5 0.55
6 0.57
7 0.51
8 0.53
9 0.57
10 0.6
11 0.64
12 0.59
13 0.59
14 0.62
15 0.69
16 0.73
17 0.73
18 0.75
19 0.7
20 0.68
21 0.65
22 0.55
23 0.48
24 0.42
25 0.38
26 0.34
27 0.34
28 0.34
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.31
33 0.29
34 0.28
35 0.34
36 0.38
37 0.42
38 0.41
39 0.41
40 0.36
41 0.34
42 0.32
43 0.25
44 0.23
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.25
49 0.28
50 0.3
51 0.3
52 0.25
53 0.27
54 0.29
55 0.3
56 0.27
57 0.29
58 0.28
59 0.28
60 0.3
61 0.3
62 0.29
63 0.24
64 0.24
65 0.17
66 0.2
67 0.2
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.2
75 0.24
76 0.21
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.17
84 0.2
85 0.21
86 0.23
87 0.28
88 0.29
89 0.31
90 0.31
91 0.36
92 0.39
93 0.37
94 0.35
95 0.32
96 0.33
97 0.34
98 0.33
99 0.32
100 0.26
101 0.28
102 0.26
103 0.24
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.18
120 0.23
121 0.23
122 0.26
123 0.26
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.27
128 0.25
129 0.25
130 0.22
131 0.21
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.22
136 0.23
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.16
141 0.18
142 0.21
143 0.2
144 0.18
145 0.24
146 0.3
147 0.32
148 0.33
149 0.35
150 0.34
151 0.39
152 0.45
153 0.46
154 0.45
155 0.47
156 0.5
157 0.53
158 0.6
159 0.62
160 0.61
161 0.58
162 0.55
163 0.56
164 0.57
165 0.54
166 0.47
167 0.41
168 0.42
169 0.39
170 0.45
171 0.49
172 0.52
173 0.57
174 0.59
175 0.64
176 0.64
177 0.72
178 0.73
179 0.75
180 0.76
181 0.75
182 0.77
183 0.77
184 0.76
185 0.78
186 0.78
187 0.74
188 0.72
189 0.73
190 0.69
191 0.65
192 0.59
193 0.5
194 0.43
195 0.4
196 0.38
197 0.37
198 0.41
199 0.48
200 0.57
201 0.66
202 0.74
203 0.81
204 0.86
205 0.87
206 0.9
207 0.89
208 0.88
209 0.88
210 0.82
211 0.77
212 0.68
213 0.6
214 0.49
215 0.41
216 0.31
217 0.24
218 0.21
219 0.17
220 0.17
221 0.15
222 0.16
223 0.2
224 0.24
225 0.22
226 0.21
227 0.2
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.15
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.2
244 0.24
245 0.29
246 0.31
247 0.34
248 0.38
249 0.38
250 0.37
251 0.32
252 0.28
253 0.3
254 0.36
255 0.36
256 0.31
257 0.31
258 0.29
259 0.29
260 0.28
261 0.22
262 0.19
263 0.15
264 0.16
265 0.19
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.21
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.09
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.1
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.15
314 0.14
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.19
319 0.2
320 0.25
321 0.3
322 0.38
323 0.41
324 0.41
325 0.46
326 0.45
327 0.46
328 0.44
329 0.4
330 0.35
331 0.34
332 0.33
333 0.27
334 0.27
335 0.26
336 0.24
337 0.21
338 0.2
339 0.16
340 0.14
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.21
345 0.27
346 0.34
347 0.4
348 0.45
349 0.46
350 0.5
351 0.51
352 0.51
353 0.46
354 0.42
355 0.37
356 0.33
357 0.35
358 0.33
359 0.29
360 0.23
361 0.21
362 0.19
363 0.17
364 0.16
365 0.12
366 0.09
367 0.11
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.17
372 0.17
373 0.25
374 0.28
375 0.31
376 0.27
377 0.3
378 0.31
379 0.32
380 0.35
381 0.27
382 0.24
383 0.21
384 0.2
385 0.17
386 0.17
387 0.12
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.07
398 0.09
399 0.11
400 0.11
401 0.14
402 0.17
403 0.24
404 0.28
405 0.32
406 0.35
407 0.38
408 0.43
409 0.46
410 0.53
411 0.49
412 0.48
413 0.44
414 0.41
415 0.39
416 0.37
417 0.33
418 0.24
419 0.23
420 0.21
421 0.22
422 0.22
423 0.2
424 0.18
425 0.18
426 0.21
427 0.21
428 0.22
429 0.21
430 0.25
431 0.26
432 0.25
433 0.22
434 0.2
435 0.23
436 0.23
437 0.23
438 0.2
439 0.18
440 0.17
441 0.16
442 0.16
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.17
454 0.16
455 0.15
456 0.16
457 0.21
458 0.2
459 0.2
460 0.2
461 0.19
462 0.22
463 0.22
464 0.23
465 0.18
466 0.21
467 0.23
468 0.23
469 0.21
470 0.2
471 0.2
472 0.22
473 0.26
474 0.23
475 0.22
476 0.24
477 0.24
478 0.23
479 0.23
480 0.2
481 0.16
482 0.17
483 0.22
484 0.21
485 0.28
486 0.33
487 0.36
488 0.4
489 0.42
490 0.46
491 0.48
492 0.51
493 0.5
494 0.48
495 0.44
496 0.4
497 0.38
498 0.33
499 0.26
500 0.19
501 0.14
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.16
513 0.18
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.17
519 0.2
520 0.19
521 0.18
522 0.19
523 0.21
524 0.19
525 0.16
526 0.16
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.13
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.11
537 0.13
538 0.14
539 0.16
540 0.21
541 0.28
542 0.31
543 0.34
544 0.38
545 0.45
546 0.51
547 0.56
548 0.56
549 0.58
550 0.62
551 0.67
552 0.75
553 0.74
554 0.71
555 0.66
556 0.62
557 0.56
558 0.53
559 0.48
560 0.41
561 0.32
562 0.27
563 0.24
564 0.21
565 0.18
566 0.14
567 0.09
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.05
577 0.08
578 0.11
579 0.12
580 0.15
581 0.15
582 0.17
583 0.21
584 0.28
585 0.34
586 0.39
587 0.43
588 0.47
589 0.49
590 0.51
591 0.56
592 0.51
593 0.49
594 0.48
595 0.45
596 0.41
597 0.41
598 0.39
599 0.34