Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6D5

Protein Details
Accession C5M6D5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-368DIDPLTRKKKEREVRNKQKSLKLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-360KKKEREVRN
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045243  Rna14-like  
IPR008847  Suf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
KEGG ctp:CTRG_01416  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05843  Suf  
Amino Acid Sequences MLARSWITEFNRITEKRLKRSLIPTNNKDDEDVERQLQYWLRWLELEKQNKLELKDESLNDKRIQYVYKQATYALPFVPEIWFQYVKYLLFQNEEGNLQESISTLRDGGLLLNPKSMLLSFQLAEMYERDNSFDNAKDVFNKLINSLTKEYNVIASQLNELHEKTKPKTQDCDEEDDDDNVDDDNNNNNGKNVDMNGGGSKITAQVYRISLADSKQMISLEKEQKRLADAITLSYIKLMTACKRVEGIKEARNVFKQARKFEKIGYQLFVENALIEHYSDKKATALKIFDLGKKNFQTNGKFLLDYLDYLILINDVDTMRTLIQSSDANFSKEISSLQEELQLTDIDPLTRKKKEREVRNKQKSLKLLFQKYISFASNFLSLDITHSFAKKCEQLFPNDDPADLFTDRYKLDNVNIIKKDELGRGDALDIDDEELARLKRRKLSNFNEEESKSAVKSIQDSKNMIEEEEETKVNEEEQIVGPSIVALMSALPNASYFGLPSESVFNSDKLVTLFSNLSNIPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.56
4 0.63
5 0.63
6 0.61
7 0.7
8 0.75
9 0.76
10 0.78
11 0.76
12 0.77
13 0.77
14 0.7
15 0.62
16 0.54
17 0.49
18 0.45
19 0.43
20 0.35
21 0.31
22 0.31
23 0.33
24 0.34
25 0.28
26 0.3
27 0.27
28 0.25
29 0.26
30 0.28
31 0.34
32 0.39
33 0.47
34 0.43
35 0.46
36 0.5
37 0.52
38 0.52
39 0.47
40 0.42
41 0.4
42 0.42
43 0.41
44 0.45
45 0.46
46 0.49
47 0.46
48 0.45
49 0.41
50 0.37
51 0.38
52 0.33
53 0.37
54 0.4
55 0.4
56 0.4
57 0.38
58 0.39
59 0.39
60 0.38
61 0.28
62 0.22
63 0.19
64 0.19
65 0.2
66 0.16
67 0.16
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.21
72 0.23
73 0.21
74 0.23
75 0.24
76 0.2
77 0.22
78 0.23
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.17
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.12
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.14
105 0.1
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.18
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.26
134 0.26
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.19
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.18
150 0.22
151 0.23
152 0.28
153 0.33
154 0.36
155 0.43
156 0.45
157 0.51
158 0.5
159 0.55
160 0.51
161 0.48
162 0.45
163 0.38
164 0.34
165 0.24
166 0.2
167 0.12
168 0.1
169 0.07
170 0.06
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.14
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.23
207 0.28
208 0.31
209 0.33
210 0.33
211 0.33
212 0.33
213 0.32
214 0.24
215 0.18
216 0.15
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.24
234 0.26
235 0.25
236 0.3
237 0.32
238 0.32
239 0.33
240 0.34
241 0.32
242 0.32
243 0.32
244 0.34
245 0.4
246 0.41
247 0.41
248 0.41
249 0.44
250 0.44
251 0.41
252 0.35
253 0.28
254 0.25
255 0.24
256 0.22
257 0.15
258 0.09
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.2
275 0.21
276 0.25
277 0.29
278 0.29
279 0.31
280 0.32
281 0.33
282 0.32
283 0.36
284 0.34
285 0.3
286 0.35
287 0.3
288 0.28
289 0.27
290 0.25
291 0.2
292 0.17
293 0.15
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.05
310 0.07
311 0.09
312 0.1
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.16
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.14
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.15
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.09
334 0.11
335 0.16
336 0.21
337 0.27
338 0.31
339 0.35
340 0.45
341 0.53
342 0.62
343 0.69
344 0.75
345 0.8
346 0.87
347 0.9
348 0.86
349 0.84
350 0.8
351 0.74
352 0.72
353 0.7
354 0.65
355 0.6
356 0.56
357 0.51
358 0.46
359 0.43
360 0.35
361 0.26
362 0.21
363 0.19
364 0.19
365 0.17
366 0.15
367 0.13
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.19
377 0.21
378 0.22
379 0.28
380 0.3
381 0.35
382 0.4
383 0.43
384 0.48
385 0.43
386 0.42
387 0.34
388 0.32
389 0.3
390 0.24
391 0.21
392 0.13
393 0.16
394 0.16
395 0.18
396 0.18
397 0.15
398 0.17
399 0.24
400 0.27
401 0.33
402 0.35
403 0.36
404 0.34
405 0.35
406 0.36
407 0.33
408 0.3
409 0.24
410 0.23
411 0.21
412 0.21
413 0.2
414 0.17
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.18
424 0.22
425 0.26
426 0.33
427 0.42
428 0.51
429 0.59
430 0.67
431 0.71
432 0.73
433 0.73
434 0.72
435 0.65
436 0.57
437 0.51
438 0.43
439 0.32
440 0.27
441 0.25
442 0.19
443 0.24
444 0.31
445 0.35
446 0.39
447 0.41
448 0.41
449 0.45
450 0.44
451 0.38
452 0.31
453 0.26
454 0.23
455 0.25
456 0.23
457 0.17
458 0.19
459 0.19
460 0.17
461 0.17
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.17
466 0.16
467 0.16
468 0.15
469 0.13
470 0.13
471 0.09
472 0.07
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.1
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.16
489 0.16
490 0.2
491 0.22
492 0.2
493 0.21
494 0.21
495 0.21
496 0.18
497 0.2
498 0.16
499 0.17
500 0.19
501 0.17
502 0.21