Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5Z4

Protein Details
Accession C5M5Z4    Localization Confidence High Confidence Score 23.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-119EEIRQMKRAAKRKLKAARRGGRRLRSQGSBasic
191-222LLKAKERKLRANQLNARKRRKKVAQALLNKSEHydrophilic
552-571EDSHQFKKKLRESEENNSRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-115KRAAKRKLKAARRGGRRLR
194-212AKERKLRANQLNARKRRKK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006553  Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031463  C:Cul3-RING ubiquitin ligase complex  
GO:0000113  C:nucleotide-excision repair factor 4 complex  
GO:0008094  F:ATP-dependent activity, acting on DNA  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0070911  P:global genome nucleotide-excision repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0008104  P:protein localization  
GO:0009411  P:response to UV  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ctp:CTRG_01275  -  
Amino Acid Sequences MSRRQRQSGVNGIRGPNSALTEFLRNEGITDAFRQRRLRDLNGANQDDHAPTEDNTTTGTETPEPTTTDDNSGNVTPEVRTESGLIQGDDEEIRQMKRAAKRKLKAARRGGRRLRSQGSPDGNSSSSDSDSDANFSDDDDDDEDEDDLNNEIKKFGEDDECVDCGKTFELSVSSRFIKEQAGYLCHECNQLLKAKERKLRANQLNARKRRKKVAQALLNKSEIKVPKLQDVCIKKITENIEEVDVLGDIGQVNMNRISKILSKNRSLNNKTMTLFLTPDLKRLEFWDCSNVDSDSLNKIASFCPNLESLTLFMCGQLHNDNLQYFATNLTKLHDLALNGPFLISDVMWQDYFEEAGSRLTKFEIRNTHRFGNDSLISLLENTGKNLTSLKLSRLDGLNSSEIYGLIPHYISDSKLTDLEISYPQDEELISDDLIITILSITGDTLTSLNLDGCSSLTERFLLEGVVKFCPNLTHLSIQHLDQITNEGFAKAFKEYGQINQGGLIEVYLTKCIGLGDEAVYELFQHSSHTLVELSINSLHLITNDFLHQVFTEDSHQFKKKLRESEENNSRKYYKHIGFPLLTYFDVGFVRAVDNEVLELIGESCPQLKVIEVYGDNRCTSRARFRNGLMVIGRQSDEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.46
3 0.38
4 0.33
5 0.26
6 0.22
7 0.23
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.16
17 0.2
18 0.28
19 0.3
20 0.36
21 0.41
22 0.41
23 0.49
24 0.54
25 0.55
26 0.56
27 0.59
28 0.62
29 0.66
30 0.67
31 0.58
32 0.53
33 0.49
34 0.4
35 0.34
36 0.27
37 0.19
38 0.16
39 0.21
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.16
48 0.18
49 0.21
50 0.22
51 0.22
52 0.23
53 0.26
54 0.25
55 0.27
56 0.26
57 0.24
58 0.25
59 0.24
60 0.23
61 0.2
62 0.19
63 0.15
64 0.15
65 0.19
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.22
71 0.24
72 0.22
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.18
83 0.24
84 0.32
85 0.42
86 0.5
87 0.58
88 0.63
89 0.71
90 0.78
91 0.81
92 0.82
93 0.84
94 0.83
95 0.82
96 0.87
97 0.87
98 0.86
99 0.85
100 0.83
101 0.77
102 0.74
103 0.69
104 0.67
105 0.65
106 0.58
107 0.52
108 0.47
109 0.42
110 0.37
111 0.34
112 0.27
113 0.2
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.16
144 0.15
145 0.19
146 0.21
147 0.22
148 0.21
149 0.2
150 0.18
151 0.14
152 0.14
153 0.11
154 0.07
155 0.07
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.18
165 0.17
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.23
170 0.24
171 0.24
172 0.23
173 0.23
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.21
179 0.28
180 0.34
181 0.41
182 0.47
183 0.51
184 0.57
185 0.6
186 0.68
187 0.67
188 0.7
189 0.71
190 0.76
191 0.8
192 0.81
193 0.83
194 0.81
195 0.78
196 0.78
197 0.79
198 0.78
199 0.79
200 0.8
201 0.78
202 0.79
203 0.82
204 0.76
205 0.71
206 0.6
207 0.5
208 0.45
209 0.38
210 0.31
211 0.29
212 0.26
213 0.3
214 0.31
215 0.32
216 0.34
217 0.37
218 0.39
219 0.38
220 0.37
221 0.3
222 0.33
223 0.35
224 0.3
225 0.27
226 0.23
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.14
231 0.1
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.15
246 0.23
247 0.3
248 0.33
249 0.37
250 0.44
251 0.5
252 0.58
253 0.56
254 0.55
255 0.51
256 0.5
257 0.45
258 0.41
259 0.36
260 0.27
261 0.24
262 0.19
263 0.23
264 0.18
265 0.21
266 0.21
267 0.2
268 0.19
269 0.21
270 0.24
271 0.18
272 0.19
273 0.21
274 0.19
275 0.2
276 0.21
277 0.19
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.13
348 0.14
349 0.19
350 0.27
351 0.32
352 0.39
353 0.44
354 0.47
355 0.43
356 0.44
357 0.4
358 0.36
359 0.3
360 0.24
361 0.2
362 0.16
363 0.15
364 0.13
365 0.13
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.15
377 0.19
378 0.19
379 0.21
380 0.22
381 0.22
382 0.19
383 0.21
384 0.2
385 0.15
386 0.15
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.09
391 0.07
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.05
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.11
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.2
461 0.2
462 0.26
463 0.27
464 0.26
465 0.3
466 0.27
467 0.24
468 0.19
469 0.22
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.12
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.12
481 0.13
482 0.17
483 0.22
484 0.22
485 0.21
486 0.22
487 0.22
488 0.19
489 0.17
490 0.13
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.12
519 0.1
520 0.12
521 0.11
522 0.12
523 0.11
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.11
528 0.1
529 0.1
530 0.11
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.16
539 0.18
540 0.21
541 0.27
542 0.32
543 0.33
544 0.39
545 0.48
546 0.51
547 0.58
548 0.62
549 0.66
550 0.69
551 0.77
552 0.81
553 0.78
554 0.73
555 0.69
556 0.63
557 0.54
558 0.52
559 0.51
560 0.45
561 0.47
562 0.5
563 0.52
564 0.52
565 0.52
566 0.5
567 0.43
568 0.38
569 0.3
570 0.24
571 0.19
572 0.18
573 0.17
574 0.12
575 0.1
576 0.11
577 0.1
578 0.12
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.09
594 0.1
595 0.11
596 0.13
597 0.19
598 0.19
599 0.24
600 0.29
601 0.32
602 0.31
603 0.3
604 0.3
605 0.28
606 0.32
607 0.39
608 0.41
609 0.46
610 0.52
611 0.54
612 0.61
613 0.58
614 0.59
615 0.5
616 0.47
617 0.41
618 0.38
619 0.36