Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MJB2

Protein Details
Accession C5MJB2    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-26MTAPKTKAPKKGKVQDFVLKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9.5, nucl 9, cyto_mito 9, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR004516  HisRS/HisZ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
GO:0019538  P:protein metabolic process  
KEGG ctp:CTRG_06155  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13393  tRNA-synt_His  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
Amino Acid Sequences MIRRFIMTAPKTKAPKKGKVQDFVLKTPKGTKDWADKDMVIREAIFGTLSNLFKKHGGVTIDTPVFELREILTGKYGEDSKLIYNLEDQGGELTSLRYDLTVPFARFVACNNIANIKRYHIAKVYRRDQPAMTKGRMREFYQCDFDVAGNYDTMVPDSEILALLCDGLTGLGIQDFKVKLNHRKILDGIFEACGVKEEDVRKVSSAVDKLDKVEWKQVKAEMVNEKGQDEAVADKIGEFVKHNGSIREVLEYLQGNEIIKSSATAQEGIKEMEILADYVDAFGINNYLSFDLSLARGLGLLHWFDLRSRHCCLCSTKKRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.72
3 0.74
4 0.78
5 0.79
6 0.79
7 0.81
8 0.79
9 0.76
10 0.74
11 0.71
12 0.62
13 0.55
14 0.55
15 0.52
16 0.47
17 0.45
18 0.44
19 0.46
20 0.51
21 0.53
22 0.5
23 0.46
24 0.47
25 0.48
26 0.42
27 0.32
28 0.26
29 0.23
30 0.19
31 0.18
32 0.14
33 0.09
34 0.1
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.19
44 0.2
45 0.22
46 0.24
47 0.29
48 0.29
49 0.28
50 0.27
51 0.22
52 0.2
53 0.17
54 0.15
55 0.08
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.17
63 0.17
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.12
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.18
95 0.2
96 0.18
97 0.19
98 0.19
99 0.25
100 0.26
101 0.28
102 0.28
103 0.22
104 0.24
105 0.24
106 0.25
107 0.24
108 0.31
109 0.36
110 0.45
111 0.49
112 0.52
113 0.53
114 0.53
115 0.49
116 0.48
117 0.49
118 0.46
119 0.42
120 0.39
121 0.39
122 0.42
123 0.43
124 0.39
125 0.38
126 0.37
127 0.38
128 0.38
129 0.36
130 0.31
131 0.28
132 0.26
133 0.19
134 0.16
135 0.13
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.13
165 0.18
166 0.26
167 0.33
168 0.39
169 0.37
170 0.39
171 0.39
172 0.38
173 0.35
174 0.28
175 0.21
176 0.16
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.15
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.2
193 0.18
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.26
199 0.23
200 0.3
201 0.31
202 0.29
203 0.31
204 0.32
205 0.32
206 0.3
207 0.34
208 0.31
209 0.31
210 0.33
211 0.31
212 0.29
213 0.25
214 0.24
215 0.19
216 0.13
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.15
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.24
233 0.23
234 0.23
235 0.2
236 0.16
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.17
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.15
253 0.17
254 0.19
255 0.19
256 0.18
257 0.14
258 0.13
259 0.11
260 0.12
261 0.09
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.21
293 0.25
294 0.26
295 0.31
296 0.36
297 0.36
298 0.42
299 0.49
300 0.53