Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDJ5

Protein Details
Accession C5MDJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MENKNIIKKKKFKIHLQWQVINTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
KEGG ctp:CTRG_03747  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MENKNIIKKKKFKIHLQWQVINTYQNMAEEQRKRIEQLMGRDHGSLIRRMEVEMTSPRVCRAFLVGVCPHDLFVGTKQDLGECPNLHLQKHKMEYEYRTKKLGEKFPDIEYDYYKQLSQYVSELDRNIHNAQLRLQHTKEEKEKIAKVTKELDDLDVEIGLMVQELNFLIEKNQSSKAIEYSIELDKKCQDREKLSQQARKITENVGQTSQQKLQVCDECGAYLSRLDNDRRLADHFVGKIHMGYLELRNNFKEIQHKYKKTRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.88
4 0.85
5 0.76
6 0.72
7 0.64
8 0.55
9 0.44
10 0.36
11 0.28
12 0.22
13 0.21
14 0.2
15 0.27
16 0.29
17 0.33
18 0.37
19 0.37
20 0.39
21 0.41
22 0.44
23 0.41
24 0.45
25 0.49
26 0.46
27 0.46
28 0.44
29 0.41
30 0.37
31 0.34
32 0.29
33 0.22
34 0.23
35 0.22
36 0.21
37 0.23
38 0.19
39 0.21
40 0.21
41 0.24
42 0.23
43 0.23
44 0.25
45 0.24
46 0.23
47 0.2
48 0.2
49 0.19
50 0.18
51 0.23
52 0.24
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.22
57 0.16
58 0.16
59 0.12
60 0.12
61 0.18
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.21
69 0.15
70 0.17
71 0.22
72 0.24
73 0.23
74 0.28
75 0.29
76 0.31
77 0.35
78 0.35
79 0.31
80 0.34
81 0.39
82 0.45
83 0.5
84 0.45
85 0.43
86 0.42
87 0.45
88 0.48
89 0.51
90 0.45
91 0.44
92 0.44
93 0.43
94 0.45
95 0.41
96 0.35
97 0.3
98 0.26
99 0.21
100 0.19
101 0.18
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.16
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.27
124 0.28
125 0.33
126 0.36
127 0.33
128 0.33
129 0.34
130 0.37
131 0.37
132 0.42
133 0.37
134 0.35
135 0.36
136 0.34
137 0.32
138 0.29
139 0.25
140 0.18
141 0.18
142 0.15
143 0.1
144 0.09
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.03
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.15
169 0.2
170 0.22
171 0.21
172 0.21
173 0.25
174 0.28
175 0.31
176 0.34
177 0.34
178 0.37
179 0.46
180 0.54
181 0.59
182 0.64
183 0.66
184 0.64
185 0.67
186 0.63
187 0.58
188 0.5
189 0.43
190 0.4
191 0.39
192 0.38
193 0.32
194 0.32
195 0.31
196 0.33
197 0.33
198 0.34
199 0.32
200 0.3
201 0.34
202 0.36
203 0.36
204 0.33
205 0.31
206 0.26
207 0.24
208 0.23
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.19
214 0.22
215 0.26
216 0.29
217 0.31
218 0.31
219 0.33
220 0.34
221 0.32
222 0.35
223 0.31
224 0.29
225 0.28
226 0.26
227 0.23
228 0.19
229 0.16
230 0.12
231 0.14
232 0.19
233 0.24
234 0.27
235 0.3
236 0.3
237 0.33
238 0.33
239 0.33
240 0.37
241 0.38
242 0.45
243 0.54
244 0.62