Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6HV58

Protein Details
Accession A0A5N6HV58    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-440FPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGGSTHydrophilic
491-522DGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-109RKRKR
130-142EDEKRRVEKAKRQ
342-344KKK
419-439PRKLRVMRAKKQPKKREAGGS
495-531RIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKSKSQSEKAPQTEKTETSIPFLAGNASVDPTLASLFETSSGPVKAPSLPTTSNAVEKPTAGDDISEDVSEPEDEDQVMQEASEASSDAGGEPAQVASEPPSRKRKRAAGEDLEESYMRRIAKEEQKEDEKRRVEKAKRQKAEGEDEDEDEDEATSTEKSDDEDEDKSSDEDAEIAIPKHETLTGDAQSSNIDKSNRTVFLSNVSNEAIKSKSAKKTLLKHFESFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFASGGKVPKRAAFAKREVLDETTPSTNAYIVYSTVQAARKAPAALNGTVILDRHVRVDSVAHPAPVDNKRCVFVGNLNFVDQEGNADDEEKPKKKKAPADVEEGLWRTFNAHTTKPKGQTTRQGNVESVRVVRDSVTRVAKGFAYVQFYDQNCVEEALLLDGKHFPPMLPRKLRVMRAKKQPKKREAGGSTQSKSLREADKTLQGRAGKLFGRAGAAKVRADAAKSISKNSLVFEGHRATDDGSSRIRVKTKSRGSKGKPKNRSSKRAAAYKAAGGKKRKTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.63
4 0.57
5 0.53
6 0.45
7 0.42
8 0.4
9 0.33
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.17
14 0.17
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.17
35 0.21
36 0.23
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.33
41 0.33
42 0.34
43 0.31
44 0.32
45 0.27
46 0.26
47 0.26
48 0.22
49 0.22
50 0.17
51 0.16
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.14
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.09
87 0.16
88 0.2
89 0.27
90 0.38
91 0.44
92 0.5
93 0.58
94 0.63
95 0.65
96 0.72
97 0.75
98 0.73
99 0.72
100 0.69
101 0.63
102 0.55
103 0.46
104 0.36
105 0.28
106 0.22
107 0.17
108 0.14
109 0.14
110 0.21
111 0.3
112 0.38
113 0.42
114 0.45
115 0.55
116 0.62
117 0.66
118 0.66
119 0.64
120 0.59
121 0.63
122 0.66
123 0.65
124 0.67
125 0.73
126 0.75
127 0.73
128 0.73
129 0.71
130 0.67
131 0.68
132 0.61
133 0.56
134 0.47
135 0.43
136 0.4
137 0.33
138 0.27
139 0.18
140 0.15
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.09
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.1
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.15
184 0.19
185 0.2
186 0.21
187 0.21
188 0.18
189 0.23
190 0.25
191 0.23
192 0.2
193 0.19
194 0.17
195 0.16
196 0.18
197 0.13
198 0.11
199 0.14
200 0.19
201 0.24
202 0.28
203 0.34
204 0.39
205 0.48
206 0.57
207 0.63
208 0.6
209 0.56
210 0.53
211 0.49
212 0.44
213 0.35
214 0.27
215 0.21
216 0.17
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.15
222 0.2
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.24
228 0.29
229 0.33
230 0.29
231 0.29
232 0.29
233 0.29
234 0.28
235 0.26
236 0.21
237 0.17
238 0.15
239 0.2
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.21
244 0.21
245 0.24
246 0.27
247 0.28
248 0.29
249 0.32
250 0.37
251 0.37
252 0.37
253 0.34
254 0.31
255 0.26
256 0.22
257 0.2
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.16
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.1
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.21
301 0.26
302 0.27
303 0.23
304 0.24
305 0.25
306 0.25
307 0.26
308 0.21
309 0.21
310 0.23
311 0.25
312 0.25
313 0.24
314 0.24
315 0.23
316 0.22
317 0.15
318 0.11
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.13
325 0.2
326 0.24
327 0.28
328 0.32
329 0.38
330 0.44
331 0.5
332 0.55
333 0.6
334 0.58
335 0.63
336 0.59
337 0.54
338 0.51
339 0.46
340 0.35
341 0.25
342 0.2
343 0.14
344 0.13
345 0.17
346 0.18
347 0.21
348 0.28
349 0.35
350 0.41
351 0.46
352 0.51
353 0.52
354 0.53
355 0.58
356 0.59
357 0.6
358 0.59
359 0.55
360 0.5
361 0.46
362 0.43
363 0.35
364 0.27
365 0.21
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.2
372 0.23
373 0.23
374 0.23
375 0.24
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.19
380 0.2
381 0.2
382 0.21
383 0.26
384 0.26
385 0.27
386 0.24
387 0.23
388 0.18
389 0.19
390 0.16
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.11
402 0.19
403 0.28
404 0.37
405 0.42
406 0.44
407 0.52
408 0.59
409 0.67
410 0.68
411 0.7
412 0.69
413 0.74
414 0.83
415 0.83
416 0.87
417 0.89
418 0.88
419 0.87
420 0.85
421 0.84
422 0.78
423 0.78
424 0.76
425 0.75
426 0.67
427 0.64
428 0.58
429 0.49
430 0.46
431 0.43
432 0.39
433 0.34
434 0.37
435 0.35
436 0.43
437 0.44
438 0.43
439 0.42
440 0.38
441 0.37
442 0.34
443 0.34
444 0.27
445 0.27
446 0.27
447 0.22
448 0.25
449 0.24
450 0.24
451 0.26
452 0.27
453 0.24
454 0.24
455 0.26
456 0.23
457 0.23
458 0.23
459 0.22
460 0.27
461 0.28
462 0.31
463 0.31
464 0.33
465 0.32
466 0.31
467 0.32
468 0.26
469 0.27
470 0.29
471 0.3
472 0.28
473 0.28
474 0.27
475 0.23
476 0.26
477 0.26
478 0.24
479 0.23
480 0.26
481 0.28
482 0.32
483 0.37
484 0.38
485 0.44
486 0.51
487 0.59
488 0.65
489 0.72
490 0.78
491 0.81
492 0.86
493 0.9
494 0.9
495 0.9
496 0.89
497 0.9
498 0.9
499 0.92
500 0.89
501 0.89
502 0.86
503 0.85
504 0.79
505 0.76
506 0.7
507 0.66
508 0.66
509 0.64
510 0.63
511 0.61